Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001193426.2

Sequence Length

2519 nt

GC Content

0.3831

AGUUUGAAUGAAAGCUCUACAAGAUGGCGGCGGUCGGGGCCGAGGCGCGAGGAGCUUGGUGUGUGCCUUGCCUAGUUUCACUUGAUACUCUUCAGGAAUUAUGUAGAAAAGAAAAGCUCACAUGUAAAUCGAUUGGAAUCACCAAAAGGAAUCUAAACAAUUAUGAGGUGGAAUACUUGUGUGACUACAAGGUAGUAAAGGAUAUGGAAUAUUAUCUUGUAAAAUGGAAAGGAUGGCCAGAUUCUACAAAUACUUGGGAACCUUUGCAAAAUCUGAAGUGCCCGUUACUGCUUCAGCAAUUCUCUAAUGACAAGCAUAAUUAUUUAUCUCAGGUAAUCACAAGUGAAGAAGCUGAAAGACGAGGACAGUUCUAUGACAACAAGGGAAUCACGUAUCUCUUUGAUCUGGACUAUGAGUCUGAUGAAUUCACAGUGGAUGCGGCUCGAUACGGCAAUGUGUCUCAUUUUGUGAAUCACAGCUGUGACCCAAAUCUUCAGGUGUUCAAUGUUUUCAUUGAUAACCUCGAUACUCGUCUUCCCCGAAUAGCAUUGUUUUCCACAAGAACCAUAAAUGCUGGAGAAGAGCUGACUUUUGAUUAUCAAAUGAAAGGUUCUGGAGAUAUAUCUUCAGAUUCUAUUGACCACAGCCCAGCCAAAAAGAGGGUCAGAACAGUAUGUAAAUGUGGAGCUGUGACUUGCAGAGGUUACCUCAACUGAACUUUUUCAGGAAAUAGAGCUGAUGAUUAUAAUAUUUUUUUCCUAAUGUUAACAUUUUUAAAAAUACAUAUUUGGGACUCUUAUUAUCAAGGUUCUACCUAUGUUAAUUUACAAUUCAUGUUUCAAGACAUUUGCCAAAUGUAUUACCGAUGCCUCUGAAAAGGGGGUCACUGGGUCUCAUAGACUGAUAUGAAGUCGACAUAUUUAUAGUGCUUAGAGACCAAACUAAUGGAAGGCAGACUAUUUACAGCUUAGUAUAUGUGUACUUAAGUCUAUGUGAACAGAGAAAUGCCUCCCGUAGUGUUUGAAAGCGUUAAGCUGAUAAUGUAAUUAACAACUGCUGAGAGAUCAAAGAUUCAACUUGCCAUACACCUCAAAUUCGGAGAAACAGUUAAUUUGGGCAAAUCUACAGUUCUGUUUUUGCUACUCUAUUGUCAUUCCUGUUUAAUACUCACUGUACUUGUAUUUGAGACAAAUAGGUGAUACUGAAUUUUAUACUGUUUUCUACUUUUCCAUUAAAACAUUGGCACCUCAAUGAUAAAGAAAUUUAAGGUAUAAAAUUAAAUGUAAAAAUUAAUUUCAGCUUCAUUUCGUAUUUCGAAGCAAUCUAGACUGUUGUGAUGAGUGUAUGUCUGAACCUGUAAUUCUUAAAAGACUUCUUAAUCUUCUAGAAGAAAAAUCUCCGAAGAGCUCUCUCUAGAAGUCCAAAAUGGCUAGCCAUUAUGCUUCUUUGAAAGGACAUGAUAAUGGGACCAGGAUGGUUUUUUGGAGUACCAAGCAAGGGGAAUGGAGCACUUUAAGGGCGCCUGUUAGUAACAUGAAUUGGAAAUCUGUGUCGAGUACCUCUGAUCUAAACGGUAAAACAAGCUGCCUGGAGAGCAGCUGUACCUAACAAUACUGUAAUGUACAUUAACAUUACAGCCUCUCAAUUUCAGGCAGGUGUAACAGUUCCUUUCCACCAGAUUUAAUAUUUUUAUACUUCCUGCAGGUUCUUCUUAAAAAGUAAUCUAUAUUUUUGAACUGAUACUUGUUUUAUACAUAAAUUUUUUUUAGAUGUGAUAAAGCUAAACUUGGCCAAAGUGUGUGCCUGAAUUAUUAGACCUUUUUAUUAGUCAACCUACGAAGACUAAAAUAGAAUAUAUUAGUUUUCAAGGGAGUGGGAGGCUUCCAACAUAGUAUUGAAUCUCAGGAAAAACUAUUCUUUCAUGUCUGAUUCUGAGAUUUCUAAUUGUGUUGUGAAAAUGAUAAAUGCAGCAAAUCUAGCUUUCAGUAUUCCUAAUUUUUACCUAAGCUCAUUGCUCCAGGCUUUGAUUACCUAAAAUAAGCUUGGAUAAAAUUGAACCAACUUCAAGAAUGCAGCACUUCUUAAUCUUUAGCUCUUUCUUGGGAGAAGCUAGACUUUAUUCAUUAUAUUGCUAUGACAACUUCACUCUUUCAUAAUAUAUAGGAUAAAUUGUUUACAUGAUUGGACCCUCAGAUUCUGUUAACCAAAAUUGCAGAAUGGGGGGCCAGGCCUGUGUGGUGGCUCACACCUGUGAUCCCAGCACUUUGGGAGGCUGAGGUAGGAGGAUCACGUGAGGUCGGGAGUUCAAGACCAGCCUGGCCAUCAUGGUGAAACCCUGUCUCUACUGAAAAUACAAAAAUUAGCCGGGCGUGGUGGCACACGCCUGUAGUCCCAGCUACUCAGGAGGCUGAGGCAGGAGAAUCACUUGAAUUCAGGAGGCGGAGGUUGCAGUGAGCCAAGAUCAUACCACUGCACUGCAGCCUGAGUGACACAGUAAGACUGUCUCCAAAAAAAAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-661.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -710.57

Frequency: 0.0000

Diversity: 755.31

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((......)))))........(((.(((((((.((((.((((((((.(........).)))))))))))).......(((((......)))))(((((((((((..........((((((.(((.....(((((.((........)).)))))...(((((((((((.....((.((((...((((((((((((............)))))))))))).(((((((((((((((((((((......((((.(((...((((((........(((.((((((((.....((((((..(((.((..(((..(.(((((....))))....).)..)))..)).)))...)))))).)))).)).)).)))........))))))..))).))))......))))))).)))).((.(((.(((.((((((((((((((((((......)))..)))))).)))..)))))))))))))).((((((...((((.((((..((((((....))))))..))))(((...)))(((((.((....(((((((((((.....)))))....)))))))).)))))((((((((((.(((....))).))))))((((((((....)))))))).................))))....))))))))))((((((((((.((((((((((..(((((((....))))))).....(((((....)))))((((((((((((..((((.(((((((........))))))).......((((...(((((..((((((.(((......)))))))))..)))))...))))......(((((....))))).((((....(((((...)))))(((((((...(((((...((((((((..(((((((((((.......))))))...))).))..))))))........((.(((((..((.(((((((((((((((....)))).)))))...)))))).)).....))))).))(((((..((((..((((((......))))))..))))..)))))(((....)))(((......)))..))...)))))...)))))))...(((.....)))))))))))..)))))))))))).....))))))(((((..(((((((....((((..(((....))).))))..))))))))))))....))))))))))))))....))))))))))...)))).)))))))).))))).((((((((((..(((((((((.....(((......((((.(((.((((...(((((((((..(((((.......)))))..)))).)))))..)))).))).)))).........(((((.........))))).....(((((.....(((..(((((((((.(((...(((....(((((((...((((....))))....)))))))..)))...))).))))))))).....)))..)))))(((((..((((((((((.((((((.((((....((((...(((((((.((((((...))).)))......((((........))))(((((((.((((((((((........((((((((......))))))))((((.........))))))))...)))))).))))))).)))))))...))))...))))....))))))..))))))..))))..))))).............)))..))))))))).))))))))))))).))))))....((((....))))..((((((.(((.(((.(((.((((....)))).))))))......(((((((((.(((...))).)))))))))..((((((.....))))))((((((((...(((((((((((...((...........))....)))))))))))...))))))))((((((((....((((((((.......)))....)))))....))))))))...(((.....)))((((((((..............))))))))......(((((.....)))))....))))))))).......(((((((((((....)))).))))))).(((((((..(((((...(((((.............))))))))))..)))))))...)))))))))))((.(((((..(((((((...........))))))).)))))))....((((((((((.....)))).(((((((....(((((((....)))))))....)))))))(((((((((((.(((...)))...))))))).))))(((((..(((((((((...................(((((((((((......)))))))(((((....)))))......)))))))))))).)..)))))...(((((((..((((....(((((((..............)))))))))))..))))))).))))))...))))))).)))...........

Thermodynamic Ensemble Prediction

{((((......)))))........(((.(((((((.((({{((((((({.,........,.}))))))))))).{{{{{,((({(,.....}}}}},{{((((({({...,...,{{{{{{{{,{{,...,.(((((.{{.,,....,)}.))))}.,.{{|||{{||||,,,,,{{,((({.,,((((((((((((............)))))))))))).{{(((((((((((((((((((......((((.(((...((((((........(((.((((((({.,,..((((((..(((.((..(((..,,,,{,{....||}}....}}},.)))..)).)))...)))))},)))).)).)).)))........))))))..))).))))......))))))).)))).{(.(((.(({{(((((((((((((({(({,,...,)))..}))))).))}..}))))))))))))),{(({((...{{,{,((((..((((((....))))))..)))).|}...,,,(((((,((....{(((((({{((,....})))}....)))))))).)))))((((((((((.(({....))).)))))}((((((((....)))))))).,|....,,...|||,.}}||......|,)))))|{(((((((((.{({{,{{(((..(((((((....)))))))}}}..(((({....}))))((((((((((((..((({.(((((((........))))))).......,{{{...(((((..((((((.(((......)))))))))..)))))...}}},.,,...{((((....}}}}},(((({{{{,,{{{...|,|,|(((((({...(((((...{{((((((..(((((((((((.......)))))}..,))).))..))))))........((.(((((..((.(((((((((((((((....))))},))))...)))))).}},,...))))).))((((({,({((..((((((......))))))..))))}.})))){((....}},..|,,,,..}}}.,},...}))))...}))))))...,,|,..}})}}}}))))))..)))))))))))).....,,|||,(((((..(((((((....((((..{{{....}}}.})))..)))))))))))}...,||||||||}}}}}},...}}}}}}}}}}...,|||,|,}}}})))}))}}.,||{{{{{{{.,|||||||||,...,,,,......,,|,,{{(,((({.,,(({{{,{{|,,{{{{,,......}}}}}..}}}},}}}}},,}}}}.}}}.,,,|{,....||||,,{{....{{{{{|||||{....{(({,..}}}|,|.}|||||||||.(({...(((,...(((((((,.{((({...,)))).,,,))))))),.}}}..,)))}))))))))).,,,.,}}..)}}))||{|{,,{{({({((((.((((((.{{{{..,,((({,,.(((((((.(({(((...}}).}}}......((((.......,|||}{((((((.{((((({{{{........((((((((......))))))))((((,,,.....,))))))))|..}}}))).))))))),))))))}...}}}).,,}}}}....))))))..}})))}}}||||..}}},}.,,,,,},,,,},}})}}|||||||||,|}||}}}},}))).)))))},,,}))|...}}}|||,,,,||,}}|)))|||,{{,.{{({,...,}}}.}}))},.{{{..(((((((((.(((...})).)))))))))..||{{{{|||,,}}||||((((((((...(((((((((((...{{...........)}.,..)))))))))))...))))))))|{|||{{{....{{((((((.......}}},...||}}}....}}}}})))...|{{,...,))|((((((((...,,.........))))))))}.....{((({.....))))},,,,}}}}},}}}},,....{{((((({((|,...})))}})))))}.{((((((..(((((,..,{(((.,...........))))))))))..)))))))..,)))))))}}}|{{.(((((..(((((((...........))))))),))))})}||||{|{|{({{{{|.{|,|}}|,||||((({,..{{{{|||,,,,))|||||,{|.|}}||||{{{{(((({{(.{{{...})),..))))))).)))}|||||..|||||||||..,{{,............,||,{(((((((......)))))))|,{{(,,,.||},},,,},.}))))))))))).}..}))))}},{{(((((..((((....(((((((.,............)))))))))))..))))))).}))))},..))))))).)))...........