Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001199900.2

Sequence Length

904 nt

GC Content

0.5553

GGCGGCCGAACCGCGUCGCUGGGCCGAAAGGUGCGCGAGCGCUGCCCGCGCGGGGACCACAACCAAAGUCGCGGCCGCCGCAGCCAUGCGCUGGGUGUGGGCGCUGCUGAAGAAUGCGUCCCUGGCAGGGGCGCCCAAGUACAUAGAGCACUUCAGCAAGUUCUCCCCGUCCCCGCUGUCCAUGAAGCAGUUUCUGGACUUCGGAUCCAGCAAUGCCUGUGAGAAAACCUCCUUCACCUUCCUCAGGCAGGAGCUGCCUGUGCGCCUGGCCAACAUCAUGAAAGAGAUCAACCUGCUUCCCGACCGAGUGCUGAGCACACCCUCCGUGCAGCUGGUGCAGAGCUGGUAUGUCCAGAGCCUCCUGGACAUCAUGGAGUUCCUGGACAAGGAUCCCGAGGACCAUCGCACCCUGAGCCAGUUCACUGACGCCCUGGUCACCAUCCGGAACCGGCACAACGACGUGGUGCCCACCAUGGCACAAGGCGUGCUUGAGUACAAGGACACCUACGGCGAUGACCCCGUCUCCAACCAGAACAUCCAGUACUUCCUGGACCGCUUCUACCUCAGCCGCAUCUCCAUCCGCAUGCUCAUCAACCAGCACAGUGGGUGCCGGCCACAGCGGCGGGGAGCGGGCGGUGGGGGGGGCGGUGCUGGGGCCCAGGGCCGGGCUGCUGAGGGGACCUAGACCACUCUUCAGAACCCCACAAAGGGAGUCUUUGAAUAGUUACUCCAGUAACUAUGGAGUUAAUGGCUCCAACAUGGAAAAAUAAAAUUUUUCUUUCUCAUUGAUUUUCCAUUUCAAAACGUUUUGUUUUCAGUGUUUGCAAAAUGUAAAAUUAUGUCACAUCUUUAAAAGAAUGUUUAAUUUAGUAUUUAUAAAAACUCUCAUUAUGUUCAAAAACAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-330.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -348.15

Frequency: 0.0000

Diversity: 205.93

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((((..((((((....((((.....(((((....))))))))))))))).(((..........))).))))))))((((((..((.((((((.(.(((((((((((((...((((((((...))))))))................)))))))..((((((((((.(((((..(((((.(((.....))))))))..)))...((((..((((((.(.(((.............)))).))))))...))))..((.((.....))))......(((......))).(((((((((((.(((.((((((.((((.......((((.(((((.(.(((((.(((((((((((......))))))))((((..(((.((((....((((...(..(((((..((..(.(((......)))..)..))..)))))..)))))....))))...)))..))))(((((......))))).(((.((.((((....)))).)).)))..((.((((....)))).))...........((((......))))))))).))).).))))).))))......((((.((((........))))..))))))))))).)))..)))))))))))))).)))))))))))))))))).).)))))).))..))))))((((((.....(((....)))((((((((((.....))).)).)))))((((((((....))))))))((((((...))))))...((((((((.(((...............))).))))))))......(((((((((...........))))))))).((((((....(((((((...))).)))).))))))..............))))))...((((....)))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((((((..(({((,{{{.((((.....(((((....))))))))))))))}}|{{..........}},.))))))))((((((..((.((((((.(.(((((((((((((...((((((((...))))))))....,,.......},.))))))),.((((((((((.(((((..(((((.(((,...}))))))))..)))...((((..((((((.(,({,.........,...,}}}.})))))...))))..|{.{{.....))},..,,,.,{,....,.},..(((((((((((.(((.((((((.((((.(({.,.((({.{((((({..((((,,(({(((((((......)))))))},{{(({(|{,{({{....(((...((.((..((((((....{{.{{(,({|{.,||{{,,..,|)}}},,..,,|},}}}))|,|......}}}(((((......))))).(((.((.((((....)))).)).)))..|))))))..)})),,}))..}}}},,,.(((((......)))))..{{|.,,.....))).},..,}}}}}..}}..))))..,.}))))))).).)))))))))},))..)))))))))))))).))))))))))))}))))).).)))))).))..))))))((((((,...,,{,....,,|{{{{{{||||.....|||,||.}}|}}{(((((((....)))))))|((((({...}))))),..{{((((((,{...,,,,,,,.......,||,}}}}}}}}.,..,.(((((((((.......,...))))))))).,,|||{.,..(((((({...}))}}))).,,,},},.........,..,)))))}...{{{{....,}},.