Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001199987.2

Sequence Length

1268 nt

GC Content

0.4211

GUUCCCGCAAGGUCGCUUUGCAGAGCGGGAGCGCGCUUAAGUAACUAGUCCGUAGUUCGAGGGUGCGCCGUGUCCUUUUGCGUUGGUACCAGCGGCGACAUGACGGGGUACACUCCGGAUGAGAAACUGCGGCUGCAGCAGCUGCGAGAGCUGAGAAGGCGAUGGCUGAAGGACCAGGAGCUGAGCCCUCGGGAGCCGGUGCUGCCCCCACAGAAGAUGGGGCCUAUGGAGAAAUUCUGGAAUAAAUUUUUGGAGAAUAAAUCCCCUUGGAGGAAAAUGGAAAAACCAUAUGGCAUAGUUGAAAAGAAGUCCAGAAUAUUCCCUGGUGAUACAAUUCUGGAGACUGGAGAAGUAAUUCCACCAAUGAAAGAAUUUCCUGAUCAACAUCAUUAAAGAUUAUGUAAAAAGUUAAAAGGCUUAUGAGCCUAAGUUUGUUCCUAUAUUACCAUAUUUACUGAAUUUUCUGGAAAAGUAACUUUAAUAAAGUUUAAUCUCAGAAAUUGUCAUAUCUGUUUUCAAGCAUUGUACAAUUUGAGACUGAGUAAUUUAACAAUAAGUAAAAAGUGGACAUGCUAAACAAAUAUGAGAGACUACCUACUUUUUCUGGUCAUUCUUGACUUGGAAAACGGUAUGGAAAAGUAUUUAGUUACAUGUUUGUUUGUUUUUUUCUUACACAGUACUUACACUAAUUUGGUAUCAGGGUAUGCAACAGUGAAAUAUCACAAUAAACAAAUGUAAGAACAGCAAUUCCAUGCACUUUUGUUUUAAGGAAAUCUUUCCGGCCAGGCGCAGUGGCUCAUGCCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCCGAGGCGGGCAGAUCACGAAGUCAGGAGAUCGAGACCAUCAUGGCUAACACAGUGAAACCCCGUCCCUACUAAAAAUACAAAAAAAUUAGCCGGGCGUGGUGGCGGGCUCCUGUAGUCCCAGCUACUGCGGAGGCUGAGGCACGAGAUUGGUGUGAACCCAGAAGGCGGAGCUUGCAGUAAGCCGAGAUAGUGCCACUGAGCCUGGGCGACAGAGCAAGACUCCGUCUCAAAAAAAAAAAAAGCUUUCCGAAUCAUUUUUGAAGAAUUUAGAAACUUGAUUGAAAAGCUUAUUCCAACUAUGAUCUGACACUCAAGACUGUCAGAUUUAGGUUGCUGUUAAUUUUGUCAUGAGAAUGUAAAAUACUAAAAUCUCUAAGUGAAAAAUUUGCAUACUAGUGCUUGUUAUAAAGGAUAAUGCAAAAAUAAACUUGGGAACUUUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-362.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -387.81

Frequency: 0.0000

Diversity: 239.84

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((((((((...)))))).(((((......)))))........((.((((((((((.(((((.(((.((((...((((((((....)))).))))...)))).))).)))))))).......)))))))))((((((.(.((.....(((((..(((..(((((...........))))).))))))))..)).).))))))((((((....).)))))..(((((...(((...(((((((((((..(((.......)))(((...)))...((((.....))))...((((((((.........((((((((..((......))....))))))))...((((........))))....(((.((......))..)))...........))))))))...........(((((....))))))))))))))))...))).)))))..........((((((((.....((((((...))))))...)).))))))((((..(((((.....(((((((((((...((((((((.((((.....(((((.((((.....(((((..(((((((((((((((...(((((..(((((((((.(((((....))))).............)))))))))..))))).)))))))))))......((((((((..((((((..((((...))))....))))))......((((....))))..........)))))))).))))..)))))..)))))))))....((((....))))..((((((.(((((((...(((((((..((((((....)))))).......)))))))((((.(........).))))...((.(((.(((((.((........(((.((.(((..((((.............))))..))))).))).((((((((((((.(((.(((((.(....).))))).)))))).....(((....)))........))))))))).)).))))).))).))))))))).))))))((......))...)))).))))))))........(((((((.(.(((((((((((((...))))))))..)))))).)))))))....(((((..(((((((((........)))))))))..))))).(((.((((((.((((((((...((......))...))))...)))))))))).)))))).)))))))).......)))))..))))..........))))))....

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((((((((((...)))))).(((((......))))).,{,,,..((.((((((((((.(((((.(((.((((.,.((((((((....))))}}))).,.)))).))).)))))))},......)))))))))((((((.(.((.....(((((..(((..(((((...........))))}.))))))))..)).).))))))((((({....}.)))))..(((((...{((...(((((((((((..(((.......)))(({...}))...((((.....))))...{(({{(((,...,,...((((((((..,,..,,..},....))))))))..,{(({{......}))),,,,..{{.,...}}}}}|,,|},,,,||,.....)))}))))...........(((((....)))))}))))))))))...})).)))))..,,,,....(((((((,.....((((({...})))))...},,)))))){(({,,(((((..{..(((((((((({...((((((((.((((.....(((((.((((.....(((((..(((((((((((((((...(((((..(((((((((,(((((....))))}.}}}},..,,,,.))}}})))}..))))).))))))))))),.....{(((((((..((((({,.{{{....,))),...,}}}}}......((((....))))..........)))))))).})))..)))))..))))))))}....((({....}))}{.((((((.(((((((.,.{(((({{..((((({....}))))).....,}))||}},((((.(........}.))))...,|}(((.(((((.((........(((.((,(({..((({.............})))..))))).))).(((((((((.{{.(((|({(({.{.,,.}.))))).}}|||......((|,...}}),....,},))))))))).)).))))).))).),))))))).)))))),),.....,,...)))).))))))))........(((((((.(,(((((((((((({...})))))))..)))))).)))))))....(((((..(((((((((........)))))))))..))))).(((.((((((.((((((((..,({......,,...))))...)))))))))).)))})).)))))))).......))))).,))))..........))))))....