Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001204358.2

Sequence Length

1398 nt

GC Content

0.4192

GCAUUUCCAGCAGGAGCUGCGAGCACAGUGCUGGCUCACAACAAGAUGCUCAAGGUGUCAGCCGUACUGUGUGUGUGUGCAGCCGCUUGGUGCAGUCAGUCUCUCGCAGCUGCCGCGGCGGUGGCUGCAGCCGGGGGGCGGUCGGACGGCGGUAAUUUUCUGGAUGAUAAACAAUGGCUCACCACAAUCUCUCAGUAUGACAAGGAAGUCGGACAGUGGAACAAAUUCCGAGACGAUGAUUAUUUCCGCACUUGGAGUCCAGGAAAACCCUUCGAUCAGGCUUUAGAUCCAGCUAAGGAUCCAUGCUUAAAGAUGAAAUGUAGUCGCCAUAAAGUAUGCAUUGCUCAAGAUUCUCAGACUGCAGUCUGCAUUAGUCACCGGAGGCUUACACACAGGAUGAAAGAAGCAGGAGUAGACCAUAGGCAGUGGAGGGGUCCCAUAUUAUCCACCUGCAAGCAGUGCCCAGUGGUCUAUCCCAGCCCUGUUUGUGGUUCAGAUGGUCAUACCUACUCUUUUCAGUGCAAACUAGAAUAUCAGGCAUGUGUCUUAGGAAAACAGAUCUCAGUCAAAUGUGAAGGACAUUGCCCAUGUCCUUCAGAUAAGCCCACCAGUACAAGCAGAAAUGUUAAGAGAGCAUGCAGUGACCUGGAGUUCAGGGAAGUGGCAAACAGAUUGCGGGACUGGUUCAAGGCCCUUCAUGAAAGUGGAAGUCAAAACAAGAAGACAAAAACAUUGCUGAGGCCUGAGAGAAGCAGAUUCGAUACCAGCAUCUUGCCAAUUUGCAAGGACUCACUUGGCUGGAUGUUUAACAGACUUGAUACAAACUAUGACCUGCUAUUGGACCAGUCAGAGCUCAGAAGCAUUUACCUUGAUAAGAAUGAACAGUGUACCAAGGCAUUCUUCAAUUCUUGUGACACAUACAAGGACAGUUUAAUAUCUAAUAAUGAGUGGUGCUACUGCUUCCAGAGACAGCAAGGUAAAAGAUGAGACCCUUACAGACGCAAAUAGUUGACCUGCAUGUCAAAUUUUACUUAUUUUUUAAGAAAAUAAAACAGUACACUAUGCUCAUUCAUUUUGUGUAUGUUUUUGUAAUUCAAGUGUUGAAUAAAAGAGCAAAUAAGAAGCAUGUUGAACAAAUAACUCUGCCAGAGAUACAACACAUGCUAAAUAAGAUGAAAAAUAGUAAUUAAUAUUUUGUAUUAAUGCCACUACAUUAUAGUUUCCAUUAUGAGCCACCAAGAAGCACACAGAAAUAUUAAGAACUUAGAUACUGAAAGUAAUCAUUAAAAUUAAUUUGCUAUCUGCUUUGCCCACAAUGUAAAAUAAAUGGAUUUUUUAUCACUAUACGGUGGAGUUUUAAUGUUCUAUUUUGUGAUCUUAUUAAAUGAGUUGAAUGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-369.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -396.31

Frequency: 0.0000

Diversity: 422.72

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((.((((....)))).)))..(((((((((.((((........((((((...))))))))))))))))))).(((((((.....(((((((......(((((((((((((((((...))))))))))....)))))))((((((..((.(((..((((((((((..(((....(((.........(((((((.((.((((......)))).))...((((....)))))))).)))........)))...)))..)))))))))))))))))))))((((....(((((......)))))...))))........((((((..(........)..))))))(((((.((((..(((((....)))))....))))...(((((((...((((((((((((.((.(((((.(((((((((.((((.((...((((............)))).....)).))))..))))))))).))....(((((((((((((((..(((((((.........((((((....))).)))(((((((..(((.(((((((........((((((.(((((.((((((((((.....)))))))))).))..(((.((((((.(..((((...((((.........((((.(..((((.....))))..).).)))))))..))))..)))))))....)))..(((((....))))).(((..........))).......))))))))))))))))(((.....)))......(((((((.(((((...............))))).)))))))..)))..))))))).....))))))).....))))))).(((((.(((((......(((((((((........((((((((((((((((.(((...(..((((((((.....))))))))..)...))).))).........)))))).)))).))).........)))))))))...)))).).))....)))))))))))(((((......)))))(((((.((((.....)))))))))..............))))).)))))))))))).(((((((...((((((...))))))..))))))).......(((((((...........((((...)))).......)))))))......((((.....((((.((((((((...))))))))...))))))))..)))))))....))))))))))))..)))))))...........(((((((((.(..((((((..((((((((((.....((.....)).....((((..((((..(((((.......)))))...))))..))))))))))))))...))))))..)))))........))))).......

Thermodynamic Ensemble Prediction

,((,(((({{{.}},)})),,.(((((((((.((((.(({.,..({..,|,..},))).))))))))))))),(((((({.{{{.(((((((({({{{(((({(((({(({((({,..}))))))))).|||))),)))(((((({.((.(((..((((((((((..{,,....(((....}},..{((((((.((.((((......)))).))...((({....}))))))).))),......|||}...})),,))))))))))))))))))))){(((....(((((......)))))...)))}...,{,{.{(((((..(........)..)))))},||}..{{{,..{{(((,,..}})))....}}}}...||,|||||}}||{{((({(({{.{.,((,((.(((((((((.((((.((.{{(((,..........}}.))).}...)).))))..))))))))).)),||.(((,,,,((((((((..(((((((.........(({(((....))).))}(((((((..(((.(((((((........((((((,{,,((,((((((((((.....)))))))))).}}..(((.((((((.(..((({...((((.........((((.(..((((,...,))))..).)}})}))))..))))..}))))))....)))..(((((....}|}}}.(((..........)))....,},)))))))))))))))}{{(.....}}}......{((((((.(((({...|...,.......})))).))))))}..)))..))))))).....))))))).....}))))))),,}}}.|||,...,||.,,,,((((((((((((((((.(((((......))))}.))),,))))))).......,))))),..|,......,,.....,||,{|||||,{||||.}},....{{{{{||||||,,|...||,|...}}....}.,,},.,,.,}|,|}}}}}.})))..{{{{{.((((,,,..}}})))))),,..}}}}}}}}},})))).))})))}))))}.(((((((...((((({...})))))..))))))).......((((((({{......,{.((((...)))).},...})))))))...,,.||||,,,,,{{{{.{{{{{|||,,,}))))}}}|..}}}}},}|,,|}|,,,}}}}.})))}},}},,}..))}}))|,,.,,,{{,,.{{(({{((({{,,{,{{{{,.|{{{{{{{{|.,,.,{|,...,}}.,,,.{{{{..{{{{..{{{{{.......))))),..}}}}.,))))))))))))))},,},))))}},,})}|,....,})))},,}}}}..