Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001204526.1
Sequence Length
754 nt
GC Content
0.6141
GAUUCACGCCCCCUUCCGGCGCCUAGAGCACCGCUGCCGCCAUGUUGAGGGGGGGACCGCGACCAGCUGGGCCCCUGGCUCAGGGAGGGGCCACGUCAGUGCUGCCAGAGACGUCACAAUGCCGGCCCAGCCGUUCGGCAGAGAAGAGGCGAUGGCGGCGAUGGCAUCUCUCGGCGCCCUGGCGCUGCUCCUGCUGUCCAGCCUCUCCCGCUGCUCAGCCGAGGCCUGCCUGGAGCCCCAGAUCACCCCUUCCUACUACACCACUUCUGACGCUGUCAUUUCCACUGAGACCGUCUUCAUUGUGGAGAUCUCCCUGACAUGCAAGAACAGGGUCCAGAACAUGGCUCUCUAUGCUGACGUCGGUGGAAAACAAUUCCCUGUCACUCGAGGCCAGGAUGUGGGGCGUUAUCAGGUGUCCUGGAGCCUGGACCACAAGAGCGCCCACGCAGGCACCUAUGAGGUUAGAUUCUUCGACGAGGAGUCCUACAGCCUCCUCAGGAAGGCUCAGAGGAAUAACGAGGACAUUUCCAUCAUCCCGCCUCUGUUUACAGUCAGCGUGGACCAUCGGGGCACUUGGAACGGGCCCUGGGUGUCCACUGAGGUGCUGGCUGCGGCGAUCGGCCUUGUGAUCUACUACUUGGCCUUCAGUGCGAAGAGCCACAUCCAGGCCUGAGGGCGGCACCCCAGCCCUGCCCUUGCUUCCUUCAAUAAACAUCACAGGACCUGGGACUGCACAGGACCUGGGGCUGCUGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-306.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -318.56
Frequency: 0.0000
Diversity: 233.53
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((((......((((.....(((...)))..)))).(((((((((((((.((((.....)).)).)))).((((..((.((((((..((((((.((.((((((((.((((...(((((.((..(((.(((......)))..)))...))))))).)))).))))).))))).))))))..)))))).))....)))).....((((((..(((((..((((...((((..(((((....(((.((((.......((..((((...((((((((((((((((((......))))..)))))))......))))).)).))))..))((((.((...(((...((((((((((((.(((.((((.....))))))).).(((((((...(..((((((((((..((..((((((........))).)))..)))))))).))))..).))).))))((..((((((((...))))))))..))(((((((...)).)))))((((((......(((((....))).))......))))))......)))))))))))))))).))))....)))).)))..)))))..))))...))))..)))))))))))...(((((.(.(((........((((((((.....)))).)))).))))))))).(((((((((......)))..))))))....))))))))).......((((.((((........)))).)))))))).).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
..{((({(((({....,(((({,..,,((...}}}},}}||.(((((((((((((.{{((...,.||,||{||||{({{||||{|((((((..((((((.((.((((((((.((((...(((({,((..(((.(((......)))..)))...))))))).)))).))))).))))).))))))..)}}}}}||||..{|||,....,{||||,.||||,|,|||{{|.{((({.,{||{|....|||,||||.......{{..{{((,.,((((((((((((((((((,....,}))}..))))))),.....})))).)}.}}}},,))|}||}},,}||||}.,||{{{((((({{.(((.((({.....})))))).}.((({((({{.{,.((((((((((,.{{..((((((........)))}}))..}))))))).)))}|||.|||.}}))((..((((((((...))))))))..))(((((((...)),}))))((((((......(((((....))).))......))))))......)))}}}|||||||.|{{|||{.{{.,....)))))))))).)))))}..})))}))))}})}))}}...((((..({(......,}}.,||||{{{.,,,.}}}},)))),,}}}|}))}|(((((((((......)))..)))))},},}}}}}}}}}}.......{(((.((((,.....,.)))).)))))))).},))),
Back