Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001206389.2
Sequence Length
877 nt
GC Content
0.5964
ACCUUGCGUCCGCAGUACCGACCCGCACGCUCUUCAGCGCAUCCCUAGUGAAGGAGGUUCUCCCCCAGCCCGUGGCUGUUGCACUUGCUGGUCCUCUGCCUCCAAGCCCAGCAUGUGAGGGAGCAGAGCCUGGUGACGGAUCAGCUCAGCCGCCGCCUCAUCCGGACCUACCAACUCUACAGCCGCACCAGCGGGAAGCACGUGCAGGUCCUGGCCAACAAGCGCAUCAACGCCAUGGCAGAGGACGGCGACCCCUUCGCAAAGCUCAUCGUGGAGACGGACACCUUUGGAAGCAGAGUUCGAGUCCGAGGAGCCGAGACGGGCCUCUACAUCUGCAUGAACAAGAAGGGGAAGCUGAUCGCCAAGAGCAACGGCAAAGGCAAGGACUGCGUCUUCACGGAGAUUGUGCUGGAGAACAACUACACAGCGCUGCAGAAUGCCAAGUACGAGGGCUGGUACAUGGCCUUCACCCGCAAGGGCCGGCCCCGCAAGGGCUCCAAGACGCGGCAGCACCAGCGUGAGGUCCACUUCAUGAAGCGGCUGCCCCGGGGCCACCACACCACCGAGCAGAGCCUGCGCUUCGAGUUCCUCAACUACCCGCCCUUCACGCGCAGCCUGCGCGGCAGCCAGAGGACUUGGGCCCCCGAGCCCCGAUAGGUGCUGCCUGGCCCUCCCCACAAUGCCAGACCGCAGAGAGGCUCAUCCUGUAGGGCACCCAAAACUCAAGCAAGAUGAGCUGUGCGCUGCUCUGCAGGCUGGGGAGGUGCUGGGGGAGCCCUGGGUUCCGGUUGUUGAUAUUGUUUGCUGUUGGGUUUUUGCUGUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUAAAACAAAAGAGAGGCUCUAUUUUUGUAUUCCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-339.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -357.69
Frequency: 0.0000
Diversity: 171.71
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.((((..((((((.((((..(((((((((((((((((((((..((((((.(.((..(((....(((....((((((((.(((((.(((.((((.((((((.((...)).)).)))).)).)).)))........((((((((....(((((((((....((((((....((.......((((....)))).......))..))))))..((((....(((......)))..)))).)))).))))).(((((((((...))...(((((.((((((((..(((((....))))).....))))).((((((......)).))))...))).)))))....))))))).))))))))).)))).))))))))...)))..)))..)).))))))))).)).)))))))))))...........))).))).(((.((((.((((........)))).)))).))).(((....)))((((.(((...((((((((.......(((((((((..(((((((....)))))))....(((((((.(((((........)).))).((((.((.(((((...(((.................)))...)))))))))))..))))))).(.((.(((((....))))))).)....))))))))).(((((((((((...(((.(((..((((...((((((((.(((.(((.........)))..))).)))))))).....))))))))))...)))))))).)))...)))))))))))..))))..)))).))))))..)).)).)))).......(((((((((((.((((........)))).))))))))))).................
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....,,....((((((..((((({...{.(((((((((((((((..((((((((.((..(((....(((....((((((((.(((({,(((.((((,((((((.((...)).)).)))).}),)),)}){{{,....((((((((....(((((((((..,.((((((..,.,,.......((((....))))...,...})}.)))))).,((((....(((......)))..)))).)))).))))).(((((((,,...},...(((((.(({(((((.,(((((....)))))...,.))))).(({(((......)))})))...))).)))))....))))))).))))))))),)))).))))))))...)))..)))..)).))))))))).)),})))))))))).,......((((((..(({(((.((((.((((........)))).)))).))).....(((.((((((.{((.,.((((((((.......((((((.,(..(((((((....)))))))..}.,)))))).{(((({{......,,.|||.((((.{,|{{{{{..,(((..,,,,........|..,,,...||}}}}}}))),)))}}}|,.|,||,|||||}}}})}}||{,{{....)).))),((((((((((((((...(({{(((..((((.,.((((((((.(((.(((.........)))..))).))))))))...,.))))))))))...)))))))).)))))))))))))))))..)))))).)))....})).)))))),)))))..))))))..,{{(((({({(({{,.....)))).))))))))})}.................
Back