Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001206703.2

Sequence Length

1873 nt

GC Content

0.4378

GCUUGGGGCCUGGGCAGCCACACUGCACGCAGGCUGGGCCGACUGAGGGGCUCAGAGGCCAGGCUCUGAGGCCCACGCAGGGCCUAGGGUGGGAAGAUGGCAGGUGGGGGCGGCGACCUGAGCACCAGGAUGUUCACGGAAGACCAGGGUGUAGAUGACAGGCUGCUCUAUGACAUUGUAUUCAAGCACUUCAAAAGAAAUAAGGUGGAGAUUUCAAAUGCAAUAAAAAAGACAUUUCCAUUCCUCGAGGGCCUCCGUGAUCGUGAUCUCAUCACAAAUAAAAUGUUUGAAGAUUCUCAAGAUUCUUGUAGAAACCUGGUCCCUGUACAGAGAGUGGUGUACAAUGUUCUUAGUGAACUGGAGAAGACAUUUAACCUGCCAGUUCUGGAAGCACUGUUCAGCGAUGUCAACAUGCAGGAAUACCCCGAUUUAAUUCACAUUUAUAAAGGCUUUGAAAAUGUAAUCCAUGACAAAUUGCCUCUCCAAGAAAGUGAAGAAGAAGAGAGGGAGGAGAGGUCUGGCCUCCAACUAAGUCUUGAACAAGGAACUGGUGAAAACUCUUUUCGAAGCCUGACUUGGCCACCUUCGGGUUCCCCAUCUCAUGCUGGUACAACCCCACCUGAAAAUGGACUCUCAGAGCACCCCUGUGAAACAGAACAGAUAAAUGCAAAGAGAAAAGAUACAACCAGUGACAAAGAUGAUUCGCUAGGAAGCCAACAAACAAAUGAACAAUGUGCUCAAAAGGCUGAGCCAACAGAGUCCUGCGAACAAAUUGCUGUCCAAGUGAAUAAUGGGGAUGCUGGAAGGGAGAUGCCCUGCCCGUUGCCCUGUGAUGAAGAAAGCCCAGAGGCAGAGCUACACAACCAUGGAAUCCAAAUUAAUUCCUGUUCUGUGCGACUGGUGGAUAUAAAAAAGGAAAAGCCAUUUUCUAAUUCAAAAGUUGAGUGCCAAGCCCAAGCAAGAACUCAUCAUAACCAGGCAUCUGACAUAAUAGUCAUCAGCAGUGAGGACUCUGAAGGAUCCACUGACGUUGAUGAGCCCUUAGAAGUCUUCAUCUCAGCACCGAGAAGUGAGCCUGUGAUCAAUAAUGACAACCCUUUAGAAUCAAAUGAUGAAAAGGAGGGCCAAGAAGCCACUUGCUCACGACCCCAGAUUGUACCAGAGCCCAUGGAUUUCAGAAAAUUAUCUACAUUCAGAGAAAGUUUUAAGAAAAGAGUGAUAGGACAAGACCACGACUUUUCAGAAUCCAGUGAGGAGGAGGCGCCCGCAGAAGCCUCGAGCGGGGCACUGAGAAGCAAGCAUGCUCCUAUGACUUCUAGAAGUACAUCUACUUGGAGAAUACCCAGCAGGAAGAGACGUUUCAGCAGUAGUGACUUUUCAGACCUGAGUAAUGGAGAAGAGCUUCAGGAAACCUGCAGCUCAUCCCUAAGAAGAGGGUCAGGUAAAGAAGAUUAGGAUGCCAAGACUUGGCCUGCAGAAUGUCAGGAAUGUGAAUUAAAAGCUGCUGUUUCCAGACGCUUUUUAUUCUGAGCACCUUCACUACCUUGUAUCCAGUUCAUCUGGGAACUCCUUUUUGCAUUUUAGAAAAUGGAAAGAGGCAGGAAAUUAUGAUAAACUCAUGUUUAACAGAAAGAGUUUCACUGACUAAAUGUAUGUAAUUAUAUUUUGUUGUUGUAGAAGAAAUAAAUAGCAAAUUUGUGGUAUUCUUUUUUUUAAACCUGCUCUCAUUCCUAUUAACACUAAGAUCUUAGAUUUUUAUAGUGAUAAAUGGGUUGACAUCAUUGUCAUUUGUAAUUGUAAAGCCUCAAAAGACAACUGUUCCUACUAUGUAAUUAUAGACAGAAAUAAAAACUUCAGAUCAAACACUCUCAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-521.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -557.03

Frequency: 0.0000

Diversity: 541.60

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..(((((((((((((((.....)))).).)))))(((((.......(((.(((((((......))))))).))).((((((((...(((((((....((((((((..((((..(((...(((((((((..((((((.(((.(((((((.....(((.(((((((.(((........(((......))).(((....)))...((((((((((.((...............)).)))))))..))).))))))))..)).)))(((((...)))))..................((((((((...)))).)))).)))))))((((((..((.(.((.((.(((.((((.(((..(((((((((............)).)))))))))).)))).))).)).)).).))....))))))....((((..(((..(((((.(((....((((((((...(((.....)))..))))..))))......))).)))))...)))..).)))((..(((((...)))))...))...))))))))).....))))))....)))...)))..)))).)))).))))(((((.((((((((((.((((((((((......(((........)))..((((...(((...((((........)))).....)))...)))).........))))))((((..(((..(((((.((((.....................((((((((......)))))..)))...)))))))))...)))..))))...))))...))))))).))).))))).......)))))))...)))))))).........)))))(((((...((...((((((((((.................(((((((((((((((.((..........((((((....)))))).........(.(((((.....((....))....))))).)........((...((((......))))...)).(((((((((((((.(((((.((....)).)))...)).)))).)))))))))(((......)))..((((((.(((.((.....)).)))..(((((...(((....)))..)))))(((((......))).)).))))))..)))))).))))).)))))))))))).((((..((((((.(((........))).))))))..)))).((((.((((((((.(.....(.((((((((..(((........))).((.(((((.((....))..))))))).)))))))))...).)).)))))).))))((((((((.((.((((((((.......)))((.((((......)))).))))))))))))))).))...........((.((.(((((.((((...)))).))))).))))......(((((.(((((...(((((..(((((((((..((....((((((...)).))))...))((((.((((((..(((....)))..)))))).))))((((....)))).......((.(((((.....))))).)).(((((((.(((((....))))).)))))))((((((((..((.(((((....))))).))......))))).)))....((((((......))))))((((((((............)))))))).....)))))))))..)))))..))))))))))...((((((..((((((((((...)))))...)))))...)))))).(((((....))))).))))....))...))))).........((((.....(((((....))))))))).........................))))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

..(((((((((((((((.....)))).).))))|((((((..{((.(((.(((((((......))))))).))).},}}}))))))}((((((({{{.(((((((,((({({{{,,{{{(,{{{{||,,.{{||{(,((,.({((((({{{{.(({.(({({{{,{{{..,|,..,|||..}},,}}},{{{....}},....(((((((((.((...............)).)))))))},},},|,}}}},})}})}),}{{(({...}))}|,,,,....}})})},,..{(((((((...)))).)))}.)))))))}}|{{{{{.....,,.)))}}}..(((((((((((((((((,,{{,,,,,...,||,,,,||{((({{{{{{.{{{{{,((,,{(....}}))).||,,,.,{|{..(((,,((((({(({....(((({(({...(((.....}}}..}},,..}|||{{,...,,,.}}},,...,,,}}},))}{((.,(((({{,||}|||..,{..,((((,....}}},{{||,|{{,,.|||{{{||,..||{,..,,.}}),.(((((.((((((((((.((((((((((......(((........)))..((((...(((...((((........)))).....)))...)))).........))))))((((..(((..(((((.((((..,............,.....(({(((((......))))),.,}},..)))))))))...}))..))))...))))...))))))).))).)))))..,.,({|((((,{.{{(({(({.{.,.......,},))).))))}.}|.......((((((,,,..............(((((((((((((((.((..........((((((....)))))).........{.(((((..,..((....))..,.))))}.}........((...((((......))))...)).{((((((((((((.(({((.((....}}.)}},,.}),)))),,)))))))|(((......))),.((((((..((,.({,....)}),,.,(((((...(((....)))..})))),|(((......))),),.))))))..)))))).))))),}))))))))))).{(((..((((((.(((........))).))))))..)))}.{,((,{{{({,,,....,....(((((((,..,{{..}},))}}{{{((.,{,,,.,..}}}))..))))))),)),||,||{,....))})}))}}.}|||{{.,({{{,,..,|}|||{{,}.....}}}|,,|)}}}}}}.,))))},)))),,|,,||||||.{(((({,.,...((.((.(((((.((((...)))).))))).))}),......,})}))}}}}..}}}}},.,,}}}.}})|})}}}),,|||,|},,,)),))))}))))||||,|||{||.,{||,,,,))),.||||},.,,,}.||}}..,}}},.......,,.))))))))).)))))))).(((((((.(((((....))))).))))))){{{{{{{,,,((,{{{{{,,,,)}}||.}|,{{,,|||}||,|}},,.,((((((......))))))|,||{{{{,,.,,,,,,,..||||}||,....,))}})))})))))})),.))))))),)).)}||||||..{{({{{((((...}}}}||,,|}}}}.|,||||||.,((({...,||||}|{{{,..,{|....,...)}},.}}}},,|||}},},{((((....))))),},|,,........},,,},,,......,))))}.