Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001206797.3

Sequence Length

2083 nt

GC Content

0.5699

GCACAGCAGCUGCACGCGCCGUGGCUCCGGAUCUCUUCGUCUUUGCAGCGUAGCCCGAGUCGGUCAGCGCCGGAGGACCUCAGCAGCCAUGUCGAAGCCCCAUAGUGAAGCCGGGACUGCCUUCAUUCAGACCCAGCAGCUGCACGCAGCCAUGGCUGACACAUUCCUGGAGCACAUGUGCCGCCUGGACAUUGAUUCACCACCCAUCACAGCCCGGAACACUGGCAUCAUCUGUACCAUUGGCCCAGCUUCCCGAUCAGUGGAGCUGAAGAAGGGAGCCACUCUCAAAAUCACGCUGGAUAACGCCUACAUGGAAAAGUGUGACGAGAACAUCCUGUGGCUGGACUACAAGAACAUCUGCAAGGUGGUGGAAGUGGGCAGCAAGAUCUACGUGGAUGAUGGGCUUAUUUCUCUCCAGGUGAAGCAGAAAGGUGCCGACUUCCUGGUGACGGAGGUGGAAAAUGGUGGCUCCUUGGGCAGCAAGAAGGGUGUGAACCUUCCUGGGGCUGCUGUGGACUUGCCUGCUGUGUCGGAGAAGGACAUCCAGGAUCUGAAGUUUGGGGUCGAGCAGGAUGUUGAUAUGGUGUUUGCGUCAUUCAUCCGCAAGGCAUCUGAUGUCCAUGAAGUUAGGAAGGUCCUGGGAGAGAAGGGAAAGAACAUCAAGAUUAUCAGCAAAAUCGAGAAUCAUGAGGGGGUUCGGAGGUUUGAUGAAAUCCUGGAGGCCAGUGAUGGGAUCAUGGUGGCUCGUGGUGAUCUAGGCAUUGAGAUUCCUGCAGAGAAGGUCUUCCUUGCUCAGAAGAUGAUGAUUGGACGGUGCAACCGAGCUGGGAAGCCUGUCAUCUGUGCUACUCAGAUGCUGGAGAGCAUGAUCAAGAAGCCCCGCCCCACUCGGGCUGAAGGCAGUGAUGUGGCCAAUGCAGUCCUGGAUGGAGCCGACUGCAUCAUGCUGUCUGGAGAAACAGCCAAAGGGGACUAUCCUCUGGAGGCUGUGCGCAUGCAGCACCUGAUUGCCCGUGAGGCAGAGGCUGCCAUCUACCACUUGCAAUUAUUUGAGGAACUCCGCCGCCUGGCGCCCAUUACCAGCGACCCCACAGAAGCCACCGCCGUGGGUGCCGUGGAGGCCUCCUUCAAGUGCUGCAGUGGGGCCAUAAUCGUCCUCACCAAGUCUGGCAGGUCUGCUCACCAGGUGGCCAGAUACCGCCCACGUGCCCCCAUCAUUGCUGUGACCCGGAAUCCCCAGACAGCUCGUCAGGCCCACCUGUACCGUGGCAUCUUCCCUGUGCUGUGCAAGGACCCAGUCCAGGAGGCCUGGGCUGAGGACGUGGACCUCCGGGUGAACUUUGCCAUGAAUGUUGGCAAGGCCCGAGGCUUCUUCAAGAAGGGAGAUGUGGUCAUUGUGCUGACCGGAUGGCGCCCUGGCUCCGGCUUCACCAACACCAUGCGUGUUGUUCCUGUGCCGUGAUGGACCCCAGAGCCCCUCCUCCAGCCCCUGUCCCACCCCCUUCCCCCAGCCCAUCCAUUAGGCCAGCAACGCUUGUAGAACUCACUCUGGGCUGUAACGUGGCACUGGUAGGUUGGGACACCAGGGAAGAAGAUCAACGCCUCACUGAAACAUGGCUGUGUUUGCAGCCUGCUCUAGUGGGACAGCCCAGAGCCUGGCUGCCCAUCAUGUGGCCCCACCCAAUCAAGGGAAGAAGGAGGAAUGCUGGACUGGAGGCCCCUGGAGCCAGAUGGCAAGAGGGUGACAGCUUCCUUUCCUGUGUGUACUCUGUCCAGUUCCUUUAGAAAAAAUGGAUGCCCAGAGGACUCCCAACCCUGGCUUGGGGUCAAGAAACAGCCAGCAAGAGUUAGGGGCCUUAGGGCACUGGGCUGUUGUUCCAUUGAAGCCGACUCUGGCCCUGGCCCUUACUUGCUUCUCUAGCUCUCUAGGCCUCUCCAGUUUGCACCUGUCCCCACCCUCCACUCAGCUGUCCUGCAGCAAACACUCCACCCUCCACCUUCCAUUUUCCCCCACUACUGCAGCACCUCCAGGCCUGUUGCUAUAGAGCCUACCUGUAUGUCAAUAAACAACAGCUGAAGCACC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-772.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -814.50

Frequency: 0.0000

Diversity: 510.88

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((....((((((((((...))))..(((((..((..(((.(((.((......))..))).)))..))..)))))((((.((((..(((...(((..((((((.(.(..((((.(((.(((((((.(((.(((.(((((((.(..(((((((((((((..((......)).))).)))).(((.((.(((....(.(((((.((((.((.(.((((((..((.(((...........))).)).))(((((((.(.....).)))))))....(((((((((((.......((((.(((((....(((.(((.(((....(((.......))))))))))))((.....))....(((((...)))))..((((((((((..((..((((....))))..)).)))))))))).))))))))).(((......)))(.((((((.(....))))))).).....))))))))))))))).)...)).))))))))))..))).))))).))))))..)..).)))))).))))))))))).))))).))..))..).).)))))))))((.(((((.((((...........))))..)))))))..)))..)))).)))).(((...((((.((((..((((.(((((.((((......(((.((((.((.........)).)))).)))((((((..(((((((((........(((.(((.((((((..(((....(((((.((((.((..(((.((((..(((...(((.......)))..)))..)))).)))..)).))))..(((((((((((....(((((((.(((((.((((((.......))))))).(((((((..((....(((((...((((.....))))......((((((.(((((((((((((((..((......))))))))))...(((((((((.((.((((((..((((((...))))))...)))))).....((((((((.(((((((..(((.(((((...)))))......)))..)))))))...((((..((((((.....(((((((((.....(((................))).))))))))))))))).))))......))))))))((((((.(......).))))))...(((((((...((((.....))))..))))))).(((..((((.((..........))))))...)))..)).)))))))))..((((((....)))).))..)))).(((((((((.(.(((...(.(.(((((((((((...))))))))).)).).)(((((((.(((....((((((((.......))))))))))))))).))).....((((((.(.((.((.((..(.((((...(((.((.((.(((((((((((.....((((((.....)))))).......)))).)).)....)))).)))).)))..)))))..)).)))).))))))).(((((((...(((....((((...(((((..((((......))))))).))....))))..)))..)))))))))))))))))))).......))).)))))).....(((((((.(((((((((.(((((...(((....))))))))..))))))........(((((((((((......))).....((((..((((.(((..((((((((((...(((....)))...)))).....))))))..))).))))...))))(((((................)))))(((.((.((........))))))).))))))))))).)))))))....((((.(((((((..(((((..(.((((.............)))).).....)))))))))))))))))))))))..))))))))))).)).)))))))))))).))))))))).)))..))).))).))).)))))))).))))))))))....)))).))))).))))(((..((((((((....))..))))))..))).)))).))))....)))........))))))..))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

((....((((((((.(((({((((((((((.......,({((({.{.{{{{.||{,|,,.)))...)))),}))}|||.,,,{((((({((,{{..{(,,,,.{,{..,((,{((,{((,,,,,.,,|}|,|}|,||,({|{..,||||||||||||}.|......}})}))).)))).|||}|,,|((,,,.,.((((((((({.((.,.(((,(({,,,.((({(({.{{{{{.}||.||,||((((((({(.....).)))))))....,({((({{{{{{{{....(((({((,,.....,((..,..||...})))))}.}}},.|||||{|||||{{..{{,|..,..{{{||,,..})))},{((((({(((..({..{(((,,..)))),.}).))))}))))).})))}))),.}}}}}..)})))),,,}))).))).,,)),))))).....||||||||,,|}|||{{{,.|},||||,,,,)))})||{||||,{||||||{{{{,,{{||||}.||}|}},},||{|||||.||{{||....|.}|)))))}},}.))})}))},,..((((((((((.........))))}}))))).,)}}))).},.,},|})).}))))){(((.(((((.((((.,....(((.((({.((.........)).}))).)))((((((..(((((((((........(((.(((.((((((.{(({....(((((.((((.((..(((.((((..((({..(((.......)))}}}))..)))).)))..)).))))..((((((((((,...,(((((((.((({{.((((((.......))))))},(((((((..(,...,({(((,,.((((.....)))).,..,,((((((.(((((((((((((((..((......))))))))))...(((((((((.({.((((((..((((((...))))))...)))))){.(((.,(((...}}}..}))..((((((((((..((((({.,..,{{{.{(((..{(((((((((.,,{{(({.{,,(((((((((.....(({...........},...})}.))))))))))})),)},.)))}})))))).))))|||((({,......),))}}}}...|..}))))).))))))})){{,((((|,.,....,)}}}}},)),,{,..((((....))))...))..}).)))))))))..((((((....)))).))..)))).(((((((((,(.{{{....,,.(((((((((((...))))))))).)).},.(({((({{(((,...((((((((.......))))))))))))))),},).....((((((.(.((.((.((..(.((((...(((.((.((.((((,((((((..,,.((((((.....)))))).....,.)))).}}.)},..)))).)))).)))..)))))..)).))))}})))))).(((((((.,.(((..,,((((,..(((((,.{(((......))))))).))....)))).,)))}.))))))),))}))))))))).......))).)))))).....{((((((.,,,((((((.(((({..,(((....))))))))..))))))........(((((((({((......|||,.,,.((((..((((.(((..((((((((((...(((....)))...)))).....))))))..))).))))...)))),||,,.,|||,|,.,,.....}))},{{({((.((........))))))}.)))))))).}}.)))))))|,,,({{,{(((((((..(((((..{.((((..,,.........)))).}.....)))))))))))))))))))))))..))))))))))).)).)))))))))))).))))))))).)))..))}}))).))).)))))))).))))))))))}..,)))).))))).)))}.....)))))}.}}}}})}.,))))))},,})}))),})),|,,||}}......,,.))))))..))...