Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001206950.2
Sequence Length
2645 nt
GC Content
0.6469
GAGGCCGUGCCCCACAUCCAGGCAGCGCAGGCCGCGGGCCGCUCCCCUAGCCAGGAAGAGCCGCCGUCCGCACCGGGACCGGAGAGGAAGCGGAGGUCUGAAGGGGGACAGGUGAGGCGGAACCAACCCUCCUGGCCAUGGGAGGGGCCGUGGUGGACGAGGGCCCCACAGGCGUCAAGGCCCCUGACGGCGGCUGGGGCUGGGCCGUGCUCUUCGGCUGUUUCGUCAUCACUGGCUUCUCCUACGCCUUCCCCAAGGCCGUCAGUGUCUUCUUCAAGGAGCUCAUACAGGAGUUUGGGAUCGGCUACAGCGACACAGCCUGGAUCUCCUCCAUCCUGCUGGCCAUGCUCUACGGGACAGGUCCGCUCUGCAGUGUGUGCGUGAACCGCUUUGGCUGCCGGCCCGUCAUGCUUGUGGGGGGUCUCUUUGCGUCGCUGGGCAUGGUGGCUGCGUCCUUUUGCCGGAGCAUCAUCCAGGUCUACCUCACCACUGGGGUCAUCACGGGGUUGGGUUUGGCACUCAACUUCCAGCCCUCGCUCAUCAUGCUGAACCGCUACUUCAGCAAGCGGCGCCCCAUGGCCAACGGGCUGGCGGCAGCAGGUAGCCCUGUCUUCCUGUGUGCCCUGAGCCCGCUGGGGCAGCUGCUGCAGGACCGCUACGGCUGGCGGGGCGGCUUCCUCAUCCUGGGCGGCCUGCUGCUCAACUGCUGCGUGUGUGCCGCACUCAUGAGGCCCCUGGUGGUCACGGCCCAGCCGGGCUCGGGGCCGCCGCGACCCUCCCGGCGCCUGCUAGACCUGAGCGUCUUCCGGGACCGCGGCUUUGUGCUUUACGCCGUGGCCGCCUCGGUCAUGGUGCUGGGGCUCUUCGUCCCGCCCGUGUUCGUGGUGAGCUACGCCAAGGACCUGGGCGUGCCCGACACCAAGGCCGCCUUCCUGCUCACCAUCCUGGGCUUCAUUGACAUCUUCGCGCGGCCGGCCGCGGGCUUCGUGGCGGGGCUUGGGAAGGUGCGGCCCUACUCCGUCUACCUCUUCAGCUUCUCCAUGUUCUUCAACGGCCUCGCGGACCUGGCGGGUUCUACGGCGGGCGACUACGGCGGCCUCGUGGUCUUCUGCAUCUUCUUUGGCAUCUCCUACGGCAUGGUGGGGGCCCUGCAGUUCGAGGUGCUCAUGGCCAUCGUGGGCACCCACAAGUUCUCCAGUGCCAUUGGCCUGGUGCUGCUGAUGGAGGCGGUGGCCGUGCUCGUCGGGCCCCCUUCGGGAGGCAAACUCCUGGAUGCGACCCACGUCUACAUGUACGUGUUCAUCCUGGCGGGGGCCGAGGUGCUCACCUCCUCCCUGAUUUUGCUGCUGGGCAACUUCUUCUGCAUUAGGAAGAAGCCCAAAGAGCCACAGCCUGAGGUGGCGGCCGCGGAGGAGGAGAAGCUCCACAAGCCUCCUGCAGACUCGGGGGUGGACUUGCGGGAGGUGGAGCAUUUCCUGAAGGCUGAGCCUGAGAAAAACGGGGAGGUGGUUCACACCCCGGAAACAAGUGUCUGAGUGGCUGGGCGGGGCCGGCAGGCACAGGGAGGAGGUACAGAAGCCGGCAACGCUUGCUAUUUAUUUUACAAACUGGACUGGCUCAGGCAGGGCCACGGCUGGGCUCCAGCUGCCGGCCCAGCGGAUCGUCGCCCGAUCAGUGUUUUGAGGGGGAAGGUGGCGGGGUGGGAACCGUGUCAUUCCAGAGUGGAUCUGCGGUGAAGCCAAGCCGCAAGGUUACAAGGCAUCCUCACCAGGGGCCCCGCCUGCUGCUCCCAGGUGGCCUGCGGCCACUGCUAUGCUCAAGGACCUGGAAACCCAUGCUUCGAGACAACGUGACUUUAAUGGGAGGGUGGGUGGGCCGCAGACAGGCUGGCAGGGCAGGUGCUGCGUGGGGCCCUCUCCAGCCCGUCCUACCCUGGGCUCACAUGGGGCCUGUGCCCACCCCUCUUGAGUGUCUUGGGGACAGCUCUUUCCACCCCUGGAAGAUGGAAAUAAACCUGCGUGUGGGUGGAGUGUUAGGACCAACGGUUUCCUAGGAGUAUGUGGUUUUGCUGUGUGGCCUGUGUCCUGACUCGCACGUCUGCUGAUGGCCUGGCUGUUCCUACCGUGGCUCUGUCCUCGCCAGCUUUCCCUGCAGCGGCAUAGCAUUCGUAGCAGGGGCAGGCGCUGCAUGGAGGGGGCUGCGGGGCAGGUGCCUGGAGGCCGCUGUGCCAGGGUGGCCUCUGAAAUGUGCCAGGGAGCCCCUACGUGGUGGUUAGAUGGGAGCUGAGGUGGAACAAGCCACUUUAUUCACUGCUGUGUUUAAGAAACAGGACCCUCCUGCCUUCCCUUUUUCGCCCCUCUGCCUGGCUGGCAGUGUGCGUGGUGUGGUCAGUGCCCAGGGCUGGUCUUUGCACCCUGUCCUCCAUCCAGCCCGGCCCAGCGCUUGGGCUUGUCCUGGACACCUAACACCCACCUGCCCUCGUGGCCAGCAGUGGCCUGCGUGGCUGGGAGCCCGGUCAGAGGCCGCCGGGGCCCUCAGUAGGUGCGUCGUGGGCGCUGGGGACGGCAGCGGGUGCCCUGGCGGGCCGCGUGCAGCCGGAGAGAUGCCAUGUCCCUGCUCCUCUGCAAUGAAAAGCAAGCGAAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1257.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1303.98
Frequency: 0.0000
Diversity: 736.65
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((..((.(((((.(.(((((((((((((((((((((((((((((((..(((.(..(((((((((((((((...(((.(((..((((((..(((((.(((((((((....(((.(((.((.......)).))).))).(((((((((((((((((.(((((((((((((.(.(((((.......))))).).).))))))).(((((.......)))))..))))))))))).)))))))))))(((((((((..(((((......(.(((((...)))))).(((((((((((..((.((.((((((((.((.......((((.....))))))))).))))))).))..)).(((((((.(.((.((((((((.((......))))))...(((((((((((((...(((.((((((.(((..(((((((.(((.((((((((((..(((.......((((((......))).)))..((((((....))))))......(((((((((.(((.....)))..)))))))))))))))))))))).)...)).))....))))).))).)))))))))..))))))))))))).)))))).).))))))))))))))))((((((((((((((((.(.(((((..((((.(((((.((.....)).)))))...((((((...(((((((((((.((......)).)))...).))))).)).))))))..)))))))))...).))))).)))))))))))(((((((((...((((((....((((.......))))....))))))((((((((((((((....(((((((((((...)))))))))))..(((((.....)))))(((((.(...(((((((((.......((((...(((((.(((.........))))))))))))))))))))).))))))...............))))))..))))))))...)))))))))))))))))))))))(((.......)))....)))))))))..)))))...))))))..)))))).))))))..))).)))))).))))))).)).....)))))).)))))))).(((((........((...(((((((......))))))).))))))).....((((((((((.....))))))))))...........(((.(((...))))))))))))))..)))).).)).)))))..)))(((((((((((.(((((((.....)))))(((((.....((((((.....).)))))..))))).)).)))))))(((...)))((((((((((((....(((((((((.(...(((((((......)))))))(((((....(((((...((.((((..(((((.......((((((.(((((....(((((((((((..((.......)).)))))))))))))))).))))))...))))).)))).)).....(((((..(((...))).)))))...............))))))))))..).)))))).)))))))))))))))........))))..((((((((.((((((............((((((((.((..((((.((.(.((((.((.(((((((.(((((((...((.(((((..........((((((((((((((((((.(((....))).)))))((((((.(((((..((((((........))))))((((.....(((.((((....)))))))..))))((((.((((((((((((...)))))))((..(((((.(((.(.(((....))).)))).))).))..))((((((((.(((.(((((((((((((.((....((((..(((((.(((....((.(((((....)))))))....))).)))))))))....)).)))))..)))))))))))))))).))).))))).))))....)))))..))))))........((((((.(((.(((((((((((((((((((..((((...((..(.((((........)))).)..)).))))))))))))..((.((((....))))))..(((((((((.(((.(((((((...((.(((((((((((((((.((((........)))).))))))).))))....((((..(((((((.(..((((.((....((((((((((.......))))))))))...)).))))..).))))))).)))).)))).))...))))))).)))))))).)))))))))))))))))).).))))).....(((((...))))))))))))......(((((..(((.((((((((((.(((.(((((((((.(((.((((((((((((.((..((.................))..)).))))).)))))))))).))...)))))....)).)))))))).....))))))))(((((((.(.(((((((....))))))))))))))).)))))))))))..)).))).))....)))))))..))))))).)).)))).).)))))))).)).))))))((((..((.........))..))))..)))))).)))))))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
..{((((.((({(.(.(({{(((((((((((((((((((((((((((..(((.{..(((((((((((((((...(((.(((..((((((..(((((.((((((((({{{.(((.(((.((.......)).))).))).(((((((((((((((({{((((((((((((,.(.(((((.{....}))))).).,.))))))).(((((.......)))))..))))))))))).)))))))))))(((((((((,,(({((...,{,,.(((,,...)))})),(((((((((,...{((({.(((((({({{...,{{|.,((({....,,,)}))})}))||,.}})}...{{({,(({({,{((.{,,,,{,|,|,}}.}}.,)))||...(((((((((((((...(({,((((((.(((.{(((((((.(({.(((((((((({.(({.......|{,|{|,,....})).|||..((((((....))))))......(((((((((.(((,...,)))..))))))))),)).))))))))).}...)).))....))))).))).)))))))))..))))))))))))).))})))})})},))))))))))))}((((((((((((((((,({({,{{,||,{(,(((((,,({,||{||{{{|||{,.{{{{{,...|||||||||||,||......}},)}|,|,|.}}))),),,}}}}))}}}})))))))}..}.)))))}})))))))))){((((((((...((((((.,..{(((.......))))....))))))(((((((({(((((....(((((((((((...)))))))))))..(((((.....)))))(((((.(...(((((((((.......((((...(((((.(((.........))))))))))))))))))))).,)))))...............)))))}..))))))))...))))))))))))))))))))))),{{,......}})))..)))))))))..)))))...))))))..)))))).))))))..)))))})))).))))))).),....})))))).)))))))).{{{{{........(({..(((((((......))))))),}})))}}...{.(((((((((({...,)))))))))),.........,(((.(((...)))))))))))))),,)))}|),)}.))))|.((,{.(({(((((((.(((((((.....))))}(((((.{,..((((({.....).))))),}))))).)).))))))))).).}),}((((((((((((....(((((((((,(..{(((((((......)))))))|(((,...{(((((...((.((((..(((((.......((((((.(((((,...{((((((((((..((.....,})..)))))))))))))))).))))))...))))).)))).)).....(((((..(((...))).)))))....,.....,,,..)))))))))),.},))))))}}))))))))))))))...,..}})}}}..((((((((.((((({.......,{({,..{{.,},|((((((.((.(((....((((.(((((((((((.({(((({{{{.{{|,,||{{....}}||||}||{.,((((((.(((....))).))))))}||...,{|||{{((((((........))))),,)))},,..}}},})}}}.((((((,,(((({{(((((.(((({({{{((({((((({(({,({(({{((.(((.,.((({{{.|,,{{((((((((({.....,,{(,{{.(((.(((((((((((((.((....((((..{((((.{((.{{.({.{((({....))))))),.}}))).)))))))))....)).)))))..)))))))))))))))))))))))))).)),,..}|||||{,||},}}.,}}|}.......,,.{{{{|{||||||||.,,((((,({,{{{{|..|{.,|,||||,,,)),...))))).,))))}},||}|||}},}||||}}(((((((.((((((((.(((,({((((.(((((,..,,,.(((({(,..((((((.((((........}))).))))))(((({{{(({(..,...,,((((((((((((((((..,((((((((((.,...,.)))))))))),..,,(({((((({{((((|...{{|,|||,.,|,,(((.{{|({{((((......)))))|||..(((....)))..))}{,..(((((...)))))..,}}||....,{||}||,||(((.{{{{||}}|.|.|||,||{{{|||||||.|}},|{|||||.,,..|||},.})).,.....))))))}}}|))},)}},})))))}.,))))).)))....,,..))))))))).))))))).))))}}}))))).})))|))))))))))).)),))).))))))))).)))))))))),))))}))))))))))).)))))))))).,)))))).))))))...))))).))))....))).)).))))))}}}..}},)))))).)))))))).....
Back