Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001206957.2

Sequence Length

1740 nt

GC Content

0.5879

AAAGCCAGCGAAGCACGGGCCCAACCGGGCCAUGUCGGGGGAGCCUGAGCUCAUUGAGCUGCGGGAGCUGGCACCCGCUGGGCGCGCUGGGAAGGGCCGCACCCGGCUGGAGCGUGCCAACGCGCUGCGCAUCGCGCGGGGCACCGCGUGCAACCCCACACGGCAGCUGGUCCCUGGCCGUGGCCACCGCUUCCAGCCCGCGGGGCCCGCCACGCACACGUGGUGCGACCUCUGUGGCGACUUCAUCUGGGGCGUCGUGCGCAAAGGCCUGCAGUGCGCGCGACGAGCCUGUGGAGUGGGAGACACCUGACCUUUCUCAAGCUGAGAUUGAGCAGAAGAUCAAGGAGUACAAUGCCCAGAUCAACAGCAACCUCUUCAUGAGCUUGAACAAGGACGGUUCUUACACAGGCUUCAUCAAGGUUCAGCUGAAGCUGGUGCGCCCUGUCUCUGUGCCCUCCAGCAAGAAGCCACCCUCCUUGCAGGAUGCCCGGCGGGGCCCAGGACGGGGCACAAGUGUCAGGCGCCGCACUUCCUUUUACCUGCCCAAGGAUGCUGUCAAGCACCUGCAUGUGCUGUCACGCACAAGGGCACGUGAAGUCAUUGAGGCCCUGCUGCGAAAGUUCUUGGUGGUGGAUGACCCCCGCAAGUUUGCACUCUUUGAGCGCGCUGAGCGUCACGGCCAAGUGUACUUGCGGAAGCUGUUGGAUGAUGAGCAGCCCCUGCGGCUGCGGCUCCUGGCAGGGCCCAGUGACAAGGCCCUGAGCUUUGUCCUGAAGGAAAAUGACUCUGGGGAGGUGAACUGGGACGCCUUCAGCAUGCCUGAACUACAUAACUUCCUACGUAUCCUGCAGCGGGAGGAGGAGGAGCACCUCCGCCAGAUCCUGCAGAAGUACUCCUAUUGCCGCCAGAAGAUCCAAGAGGCCCUGCACGCCUGCCCCCUUGGGUGACCUCUUGUACCCCCAGGUGGAAGGCAGACAGCAGGCAGCGCCAAGUGCGUGCCGUGUGAGUGUGACAGGGCCAGUGGGGCCUGUGGAAUGAGUGUGCAUGGAGGCCCUCCUGUGCUGGGGGAAUGAGCCCAGAGAACAGCGAAGUAGCUUGCUCCCUGUGUCCACCUGUGGGUGUAGCCAGGUAUGGCUCUGCACCCCUCUGCCCUCAUUACUGGGCCUUAGUGGGCCAGGGCUGCCCUGAGAAGCUGCUCCAGGCCUGCAGCAGGAGUGGUGCAGACAGAAGUCUCCUCAAUUUUUGUCUCAGAAGUGAAAAUCUUGGAGACCCUGCAAACAGAACAGGGUCAUGUUUGCAGGGGUGACGGCCCUCAUCUAUGAGGAAAGGUUUUGGAUCUUGAAUGUGGUCUCAGGAUAUCCUUAUCAGAGCUAAGGGUGGGUGCUCAGAAUAAGGCAGGCAUUGAGGAAGAGUCUUGGUUUCUCUCUACAGUGCCAACUCCUCACACACCCUGAGGUCAGGGAGUGCUGGCUCACAGUACAGCAUGUGCCUUAAUGCUUCAUAUGAGGAGGAUGUCCCUGGGCCAGGGUCUGUGUGAAUGUGGGCACUGGCCCAGGUUCAUACCUUAUUUGCUAAUCAAAGCCAGGGUCUCUCCCUCAGGUGUUUUUUAUGAAGUGCGUGAAUGUAUGUAAUGUGUGGUGGCCUCAGCUGAAUGCCUCCUGUGGGGAAAGGGGUUGGGGUGACAGUCAUCAUCAGGGCCUGGGGCCUGAGAGAAUUGGCUCAAUAAAGAUUUCAAGAUCC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-760.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -788.99

Frequency: 0.0000

Diversity: 554.86

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((.((....(((.(((((....))))).(.((((((.(((((..((((((((((....((((((.(((.((((((((((((((.(((((((((.(((((.((((((((((.((((..((.((((((...)))))).)).(((.(((......))).)))....(((((...)))))))))...))).)))))))((((((((.(((((((....))))))).).)).))))).(.(((((((..((..(((((((((((..(.....)..)))))))))))..)).))))))).)((((.(((.(.((((..(((((((((((....((.(..((((..((.(((...))))).))))..).))....))))....)))))))..)))).)))))))).....(((((((.(........).))))))))))))))))).)))).))))..(((.(((((.((.....)).))))).))).)))))))))))))(((((((((((.......(((((.(((.........(((((.(((((.(((.((((....)))))))...(((((......))))).))))).)))))(((((((.(((((((((((.((.....)).))(((.....))).((((((((..(((((((.(((.(((.....)))))).))...)))))))))))))........(((.(....((((((.....))))))..)))).))))))))))))))))..)))))))))))))))))))...........(((((((.(((((........)))))((((.....)))).............((.(((.((((.((((((((((.(((((....)))))(((...(((((((....(((((..(((.((((.((....((((...(((((((((((((((((((((((((.(((.....)).).)))))).))..)))))...(((((((((((...)))).)))).)))..))))).)))))))..))))..)))))))))))))))))).))))))))))))..)))).))))))))))))))))...(((......))).)))))).............(((((((((((....)))))..))))))....((((........))))))))))))))..))))).)))))).)..((((.(((..((((...))))..))).)))).......(((((...(((((((.((....)))))))))...)))))(((((((((((..((...))..))))))))))))))...))(((((....)))))...))))))(((((((((((.((((((..((((((((((.(((((((..((((((.(((((.......(((..(((((((.(((.(((.........)))))).)))))))....)))......(((((....))))).((((((.....))))))))))).))))))...))))....))).))))))))))..)))))).)....((((((((.(((((....))))).))))))))................((((((..((((((((((((((.((..(.((((..((((((....)))))).......((.(((((((((.....((((....)))).....))))))))).))..)))).)..)).))))))))...)))))).))))))..........))))))))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

,{((((,({....{{{.(((((....))))).{.{(((((.{((((,,(((({((({({{{((({{,({(((.((((((((((((((.(((((((({{(((((.(((((((((({((({.{({,((((((...))))||.}}.(((,{((......}}}.}}),,{,,(({|.,,))))})))},,,})),,)))))|((((((({,(((((((....))))))).).)),))))),{.(((((((..((,.(((((((((((..(.....)..)))))))))))..)),))))))),}{({{.{{(,(.((((..(((((((|{||..|,{{.|..((((..((.(({...})))).))))..|.||...,}}.}..|.})))))}..}))).})))))))...}}|||||||.,.,},,,..),))})))})))))))))).)))).))))..(((.(((((.((.....)).))))).))).))))))))))}}}{||{,||||||.,.,,..{|||{,{||.,...,,,,(((((,(((((.{((.((((....))))))}.,,(((((..,.,.}}}}|,|||||,}|||,(((((((.((((((((((,,,..,,.,,,{({{({,,...})).((((((({..(((((({.(({,(((.....)))))).))...)))))))))))))..{{{,,,,,,.,...,|||||{.,.,,}))))),})))}.)))))))))))))))).,|||||||}||||||}}|}},,{{...,,{,|(((((({((({({{,,{{{{|,,||{(,|{,{|||||,............,,,.,{{,({(({{{({{(||((.(((((....)))))|||...|||||||}..,|||((,,,,,,((((,{,,,{,((({{..(((((((((((((((((((((((((.({{.....)}.}.)))))).))..))))).{,{({((((((((...)))).)))).)))..))))).)))))))..}|||||||}}}},||},},}}})},}})))))))}}|,|,|||{|,,,.....))))),}.,|{({,..,,.}}},}}}|||||,{{,{,,..{.(((((((((((....))))}..)))))),...((((........))))}}}}))))))},)))}}.)}}})}.}.|((((.(((..((((...))))..))).)))).,....{(((((...(((((({.{{....})})))))}...)))))|((((((((((,,,,...,),.))))))))))}||,...}}(((((....)))))...}}))))|||||||{{,.,||||{,{||||{{{((((,(({((((..{{{{{{.{{{{|..,....|||,,||||{{|.{||||{|,,,,,,,}}}))))}.|||||||..,.,,|,,,,,,(((((.,.,|||||.((((((.....))))))}}|||.}}}}||.,,))}}....))),)})}))))))))))}))),)|,..||||||{{.{{|||,,,,})))),)}))))})}},....,.....,,,||||||,,|||{{{{{{||{||,||,,,..,...,||||||,..,)))},,,}|,|{||||(({((({((.,,,.(((({,..,)))...}}})))}))})))},)}))))},.}),))))))))...)))))).)))))).......|,,}}}}}))))}