Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001207006.3
Sequence Length
716 nt
GC Content
0.4008
CUCAGUCAAGCUGAAGUGAAAACGAGACCAAGGUCUAGCUCUACUGUUGGUACUUAUGAGAUCCAGUCCUGGCAACAUGGAGAGGAUUGUCAUCUGUCUGAUGGUCAUCUUCUUGGGGACACUGGUCCACAAAUCAAGCUCCCAAGGUCAAGAUCGCCACAUGAUUAGAAUGCGUCAACUUAUAGAUAUUGUUGAUCAGCUGAAAAAUUAUGUGAAUGACUUGGUCCCUGAAUUUCUGCCAGCUCCAGAAGAUGUAGAGACAAACUGUGAGUGGUCAGCUUUUUCCUGCUUUCAGAAGGCCCAACUAAAGUCAGCAAAUACAGGAAACAAUGAAAGGAUAAUCAAUGUAUCAAUUAAAAAGCUGAAGAGGAAACCACCUUCCACAAAUGCAGGGAGAAGACAGAAACACAGACUAACAUGCCCUUCAUGUGAUUCUUAUGAGAAAAAACCACCCAAAGAAUUCCUAGAAAGAUUCAAAUCACUUCUCCAAAAGGUAUCUACCUUAAGUUUCAUUUGAUUUUCUGCUUUAUCUUUACCUAUCCAGAUUUGCUUCUUAGUUACUCACGGUAUACUAUUUCCACAGAUGAUUCAUCAGCAUCUGUCCUCUAGAACACACGGAAGUGAAGAUUCCUGAGGAUCUAACUUGCAGUUGGACACUAUGUUACAUACUCUAAUAUAGUAGUGAAAGUCAUUUCUUUGUAUUCCAAGUGGAGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-177.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -191.05
Frequency: 0.0000
Diversity: 152.11
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((...)))))..........((((....))))..(((((((...(((((..(((((((((..(((((....)).)))..))))).)))).((.(((((((((((((((((((((....((((......))))...)))))))).((((.(((.(((((((((.....((((((((...........))))))..)).....)))))))))..)))))))(((.(((...(((((.......)))))....))).)))..(((((((((((.(..((((((((((((((..(((((...........(((((........((.(((.(((........))).))).)).........)))))...........)))))...))).)))))))))))..((((.((((((............)).)))).))))..................(((((.....(((((((..((((((.((((......(((((....)))))))))...))))))))))))).....)))))........(((......)))..)))))))))))).............)))))).)))))))))...((((((..(((..(((....)))....)))..))))))((((((...))))))(((((((((((.......))))))))).))((((....))))...)))))...)))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{((({...})))}.,,.....,.((((....)))).,(((((({.,,{({{{..{{({(((((..(((((....)).)))..))))).||||.((({{{{{{{,((((((({{((((...(((((....{{{({,,{...{{{{{{(((,,.{{,.(((((((((.....((((((((...........))))))..)).....)))))))))..)))))))).,.})},,}}|.,)))))))))))))))))...,}}},.(((((((((({,,.,(((((((((((,{{..(((((.....,,....(((((........((.(((.(((........))).))).)).........)))))...,.......)))))...,}}.))))))))))).},{{,.,,,{{,...{{{{{.....)})))|.||||..,{.,............{{{{|,....(((((((..((((((.((((......(((((....)))))))))...))))))))))))).....))))}........{|{......))),}}}))))))))))...,,......|||||||,,,,,,,}})}}))){((((..(((.,(({....)))....}))..))))}{((((((...))))))|,(((((((((.......))))))))).}}{{{{.,,,))})}.}))})),..})))))),..
Back