Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001242589.3

Sequence Length

2050 nt

GC Content

0.4220

AGCAGUUGGAGCUGGUGCACAGGAAGGAUGAGGAAGACCAGGCUCUGGGGGCUGCUGUGGAUGCUCUUUGUCUCAGAACUCCGAGCUGCAACUAAAUUAACUGAGGAAAAGUAUGAACUGAAAGAGGGGCAGACCCUGGAUGUGAAAUGUGACUACACGCUAGAGAAGUUUGCCAGCAGCCAGAAAGCUUGGCAGAUAAUAAGGGACGGAGAGAUGCCCAAGACCCUGGCAUGCACAGAGAGGCCUUCAAAGAAUUCCCAUCCAGUCCAAGUGGGGAGGAUCAUACUAGAAGACUACCAUGAUCAUGGUUUACUGCGCGUCCGAAUGGUCAACCUUCAAGUGGAAGAUUCUGGACUGUAUCAGUGUGUGAUCUACCAGCCUCCCAAGGAGCCUCACAUGCUGUUCGAUCGCAUCCGCUUGGUGGUGACCAAGGGUUUUUCAGGGACCCCUGGCUCCAAUGAGAAUUCUACCCAGAAUGUGUAUAAGAUUCCUCCUACCACCACUAAGGCCUUGUGCCCACUCUAUACCAGCCCCAGAACUGUGACCCAAGCUCCACCCAAGUCAACUGCCGAUGUCUCCACUCCUGACUCUGAAAUCAACCUUACAAAUGUGACAGAUAUCAUCAGGUAUAGUUUCCAGGUCCCUGGGCCCCUGGUUUGGACACUGAGCCCUUUGUUUCCCAGUCUGUGUGCUGAGAGGAUGUGAAAGUGAGGGAAAGGGGAGGGUGGGGCAGGAGAAGACUUGAGUCACAUUAGUCUGGGUAGAAAUGUCCAGGGGAAGAAGGAAGUGGUGAUGGAGAAUAGGGGAGGCUCUCAGCCAGGCUGUCCUUCUCCCCAGUUCACCUUCUUUGUUUCCUUGCAACCUGAGUAUUAAAGAGAGGGAAAUGGCAUCUUCCCCAAGUUCCAGUGGAGCUCAUCCAACCCCAGGGGCCUGAUGGGCAGUGGGAAAGCACUCUGAGUGAGGGGCCCUGGAUCUAGUGUUGGCCUGACUAACUGAAUGUGACUUUGGGUGAGUCAGGAACCCUCUCUGGCUUUAGCUUCUUUGACAAUUCAGUAGGCAUGGUAGAAACCCAAAGCUGGAAGACAUUGUCCACCUAAUAACUCUCAGCAGGAGCUGGAGCUGGGGCUAAAUGCAGUAUUGGUUUUUGCCUUAUUGUUUUUUAAAUAACAUUGUUGCAUGUGCCCAAUUAUAGAUAAAUAGAAUCAGAAUUUUUGCAGAUGAGGUCCCUCUCAGUAUUUUUAAUAAGAUGUUUAGGAGAUUUCUAAUGUGUAGGCAAACUUAAGAACCACUAACUUAGCAAUUUCACACCUCUUUACAGUUAUUAAAUGUUGAUUUAUAUUAGAAUGUGUUUAUCAUUAAAUACUGAAUUAUCAGGAUGGAAAUACUUUUCCACAUCACCACUAGUCUAACAUGUCUUUUUUCUCAUAUUCUCUUCUAGUCUUUAUUCAUGUUUAUACAUAUUUUAAUAUGGCAGUAAGUCUAAUUAUACAUGUUUUUAUUCUUUUCCUUGCUGAAAUUAUUCUUUGAUGCUGCUACCUAAAUUUCAUAAAUAUAAUUUCAAUGAGUGCAUAUUUUUCUAUCAAUUGGGAAAGCCAUAACUUACAUAACCAUUGGCCUGUUCUUAGACAUUGAUAUAGUGUUGAUAACUCUGAGAUAAACAUAUUCUUGCAGAUAUAUUUUUCUUCUUUUAAAUAAUUAACUCGAAAUUUCCAUGAGAUAAUUUAAACACUGAUAUCAUUUUGUAUACAAAUAGCAUCUACCAAUGGUCUUCCAAAAGAUUGGAAACAAUUUGCAGUGUGAUCCAUUAAGCAUAAAUAAAGCAGUGUCAUGGCAGGCUUACAGACACGGAUUUAGUCUUUUAAAUCAUUAAAUAGUGUGAGUUAAAUCACAUUCCUGCUAAAACAAAUGUGAACUGGUGCCUGCUCUAAUUUCUCUAUGAGUGUAGACUCCACCUCCAUAUGGGUAGUGGCAGUGCCUUUUUCCCCAUUAUGUUGUUUGGGGAACAAAGUGCUCAUUAAACUUCUGUGGAAUAAAUCAAACGAAUGAUCUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-580.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -620.99

Frequency: 0.0000

Diversity: 470.50

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((.(((((((((.(((((.(((.........((((((((((((((...)))))...(((((((((..(((((((((((...((((...........((((..((((((((((((((((((((((((((.....))))((.((((((((.((.(((((((.((((((.((((((((..(((......))))))))))).....(((((((.((((((((.((((((((((.((((.(((..(((((.........(((((((.........))))))).((((((..(((....)))..))))))..))))).))).))))))...((((((.((.((((((((..........((((...))))((((((((...((((((((...))))........))))...)))))))))))))))).))))))))))))))))(((((..((((((((((....)))..((((((((((((((((..((((....(((((.((.(((((....((((...(((..((((.(((((.(((((....(.((((.(((((..(((.........((..(((((((.(((............................)))..)))))))..)))))..)))))...))))))))))...))))).))))((((..(((((((......((((......)))))))))..))...)))).)))...))))..))))))).)))))....))))...)))))...)))))))))))....)))))))...((((((((((.((.((.((((.(((((((....((((...))))....))))))).)))).)).)).))))))))))....)))))...................)))))))).))...)))))...(((.((((((.....((((((.(((..(.((.((((......)))))).)....))).))))))(((((..((((((((((((.(((.((.......)).))).)))))))......(((((((((((((((((((((........((((..(((..((...(((....)))......))..))))))).......)))).))))))))))))))))).((((.((((((..(((....))).))))))..))))....((((......))))..)))))..)))))......................)))))).)))((((...((((((....))))))....)))).)))))).))))))).))...(((((.........)))))..)))))))))).)))).)))))....(((((......)))))((((((((((((((........((((....))))..((((((....)))))).((((.((((((((....((((((...................(((.(((..((((((((............))))))).)..))).))).......((((.(((((............(((((((((....(((................))).....)))))))))))))).))))..(((((((.....)))))))((((................))))........)))))).))).))))).))))........))))))))))))))......)))))))))))))..))))........))))....)))..))))))))..................((((....)))).)))))))))...)))))))))...((((((....))))))((((((.....))))..)).........(((.(((..(((((((............(((((((....))))))).......(((((((......))))))))))))))..)))..)))...)))))))).))))))))).))....((((....))))....((((((.(((((((((((....(((((((((((..........))))))).))))))).))))..)))).))))))....((((......))))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

,,.(((((((((.(((((.(((,,.,{{{,,((((((((((((((...)))))...(((((((((.,(((((((((({...((((.,.........((((..(((((((((((({(((((((((((((.....)))}((.((((((((,(,.(((((((.((((((.((((((((,,,{{......))))))))))).....(((((((.((((((((.{(((((((((.((((.(((..(((((.........(((((((.........))))))).((((((..(((....)))..))))))..))))).))).))))))...(((((,,((.(((((((((.,,...,{,(,,,...||||{((((({{...{{({((((...))))..,,,,,,)))),},))))}),))))))))).)))))))))))))))}{((((..((((((((((....}}}..((((((((((((((((..((((.{(.(((((.((.(((((....((((.{.((((((,({({((((({{(((,,(((.((..(((((((...((((((((...((((({({{{.{((.,,{({...{(,.,,{....,{,{....))),.,)))})),,}})}...,}}..,{{|}..,}}}))}...)))))))).....))))...)))..)).))))))).).)))).,.,,.})})..)))).)).},)))}...))))))).))))),}..)))}...)))))...)))))))))))....))))))),,,(((((({,((.((.((.((({.(((((((....((((...))))....))))))).}))).)).)),}},))))))),...|||}}...........}}},....)))))))),))...)))))...(((.((((((.....((((((.(((..(.((.((((......)))))).)....))).))))))(((((..((((((((((((.(((.((.......)).))).)))))))...,,,{{{{(((((((((((((((((........((((..{((,.,....|{{....}}}......}},,))))))).......)))).))))))))))))))))).,{{(.((((((..(((....))).))))))..}},,...,{{{,....,,}},}},)))))..)))))....,,,{.......,}}}}..)))))).)))|(((,,,((((((....)))))),,..}))).)))))).))))))).,....,{{{{.........}))))}.))))))))))})))).)))))..,{(((,,..}},,),},,((((((((((((((.,,,....((((....)))),.((((((....)))))),((((.((((({{{....(((({{.....,.,,..........{{{.{{{..{{((((({.,..........})))))}.|{,|||.}}}...,,,.,,,,...,,,.......||||.(((((((((..,.(((................))).....))))))))),}))).,.,...{((((((.....))))))}((((................))))..,,....)))))},)}}.))))).)))).....,,,))))))))))))))......}))))))))))))..)))).....,,.))))....}}}..})))})}}.........,{,,,.,..,,}),..,)))}.)))))))))...)))))))))...{(((((....)))))}{{,,{({...,},},..||,........|||.{{{..(((((((....,,,.,,,.(((((((....))))))).......{((((((......))))))}}}))))}..}}}..)))...)))))))).))))))))}.|,....{{{{.,,,}|||,,,.{(({{{.{||{{||||.|||({(((((((((((..........))))))).))))}))}))))..,))),))))))....{(({......}))}...