Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001242825.2

Sequence Length

1077 nt

GC Content

0.5330

GGGAACUACUCGACCCACAGAGCCGAUCGCGGAGCGGAUUCUGCUUUUAGGAGUACCCGCCAACAAGCGGGACCGAGCAGGAAUCCGUAUCUGGGAACAGGUCCUGGAGUACAAUGCCAUUGGAGGCAAGUAUAACCGGGGUUUGACGGUGGUAGUAGCAUUCCGGGAGCUGGUGGAGCCAAGGAAACAGGAUGCUGAUAGUCUCCAGCGGGCCUGGACUGUGGGCUGGUGUGUGGAACUGCUGCAAGCUUUCUUCCUGGUGGCAGAUGACAUCAUGGAUUCAUCCCUUACCCGCCGGGGACAGAUCUGCUGGUAUCAGAAGCCGGGCGUGGGUUUGGAUGCCAUCAAUGAUGCUAACCUCCUGGAAGCAUGUAUCUACCGCCUGCUGAAGCUCUAUUGCCGGGAGCAGCCCUAUUACCUGAACCUGAUCGAGCUCUUCCUGCAGAGUUCCUAUCAGACUGAGAUUGGGCAGACCCUGGACCUCCUCACAGCCCCCCAGGGCAAUGUGGAUCUUGUCAGAUUCACUGAAAAGAGGUACAAAUCUAUUGUCAAGUACAAGACAGCUUUCUACUCCUUCUACCUUCCUAUAGCUGCAGCCAUGUACAUGGCAGGAAUUGAUGGCGAGAAGGAGCACGCCAAUGCCAAGAAGAUCCUGCUGGAGAUGGGGGAGUUCUUUCAGAUUCAGGAUGAUUACCUUGACCUCUUUGGGGACCCCAGUGUGACCGGCAAAAUUGGCACUGACAUCCAGGACAACAAAUGCAGCUGGCUGGUGGUUCAGUGUCUGCAACGGGCCACUCCAGAACAGUACCAGAUCCUGAAGGAAAAUUACGGGCAGAAGGAGGCUGAGAAAGUGGCCCGGGUGAAGGCGCUAUAUGAGGAGCUGGAUCUGCCAGCAGUGUUCUUGCAAUAUGAGGAAGACAGUUACAGCCACAUUAUGGCUCUCAUUGAACAGUACGCAGCACCCCUGCCCCCAGCCGUCUUUCUGGGGCUUGCGCGCAAAAUCUACAAGCGGAGAAAGUGACCUAGAGAUUGCAAGGGCGGGGAGAGGAGGCUCUCAAUAAAUAAUCGUGUAACCUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-389.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -407.15

Frequency: 0.0000

Diversity: 223.05

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((...(((.(((.....((((((..((.(((((((((((((((((....(.((.(((((......))))))))))))).)))))))).)))).))....((((((((((.((.((((((((....)))........(((((((.((((((((((..(((((((((((((((((((.((((((((...((((.(((..((((.((((((.((((((.....)))))).))...))))...))))..))).))))))))..)))).(((((.(((...))))))))......)))))))((.((....((.(((((((.(((.(((....))).))).))))))).))....))))...))))))))...))))..)))))))).).).))))))).(((((((..(((((((......((.(..(((((.(((((((......)))))))..)))))..).))...)))).....((((...(((((...((((....))))...((((((((....))))))))...((((((((.........(((((........))))).......((((((((.(((((((.........(((((....)))))))))).....))..))))))))...((....))((((..((((.(.(((((..((((((....))))))..))))).).))))..)))))))))))))))))..)))))))..)))))))...))))).)))).))))))))..........((((..((.((.((((((((((.((.(((((((((......((((.((....((((((......)).)))).....))..))))....)))))))))..)).)))))))..(((((..(((((.....))))).((.(((((........))))).))......(((((.....)))))))))).))))).))..))))..((((((((...((.(((..((((((((((...(((...........)))....))))..))))))))).))..))))))))......))))))..........))).))).))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((...{{{.{{{.,,..(((((({.((.(((((((((((((((((...,(.{(.(((((......)))))))))))))))))))))).)))).)).,..((((((((((.((.(((((.,(,,{{,........||(((((((.,.((((((((..(((((((((((({(({({,.((({{(((,..((({.(({{.((((.((((((.((((((.....)))))).))...)))),,,))})},}}).}}}))))),})}}),|,,{,{((({,.|||}||||{....,|||||}||,...,|{{{{.{({{{{|.|{{.||,,,,.,)).)},,))))}}),),,}))))}}...)))))))),..,)))..)))))))).,.|.}}|||||.,{{{{{{,,||{((((.{,...((.(..(((((.(((((((......)))))))..)))))..).)),,.)))),,,,}||||.,,|||((,..((((....))))...((((((((....))))))))...{(((((((.........{((((........))))}.......((((((((.((,((,,,,..{{...(((((....))))))),,),.}}.))..))))))))...{{....))((((..((((.(.(((((..((((((....))))))..))))).).))))..))))))))))))|||}}.,)))}}))..}}}))},...))))).)))).))))))))......,,..({{{{{(({{{{((((((((((.({.(((((((((......((((.((...,(((({(......)).)))).,...))..))))....))))))))).,||.})))))}..{{{{{,.(((((.....))))).((.(((((........))))).))......{((({.....)))))))))}.}},},,}},.)}}).,((((((((...((.((({.{(((((((((.,.(((...........)))....))))..))))))))).))..)))))))),{{{..}}))))..........,,).)),.}},.