Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001244974.2
Sequence Length
1521 nt
GC Content
0.4451
CUUCUCGUGGUUCCAGUGGGGAGAGAAGGAGGAAGUAGGGAGCGGGGUGGCAGGGGGGGGACCCGCCGCGGCUGCUGCCACCGCCGCCACCACCGCCUCUGCUCGUGGCGUGGGAAAGGAGGUGUGAGUCCCGGGCGCGAGCCGGCGGCGGCGCCGCUGCGGGAGGGUCGGCGGUGGGAAGGCGAUGGCGGAUUUAGAUAAACUCAACAUCGACAGCAUUAUCCAACGGCUGCUGGAAGUGAGAGGGUCCAAGCCUGGUAAGAAUGUCCAGCUUCAGGAGAAUGAAAUCAGAGGACUGUGCUUAAAGUCUCGUGAAAUCUUUCUCAGUCAGCCUAUCCUACUAGAACUUGAAGCACCACUCAAAAUAUGUGGUGACAUCCAUGGACAAUACUAUGAUUUGCUGCGACUUUUUGAGUACGGUGGUUUCCCACCAGAAAGCAACUACCUGUUUCUUGGGGACUAUGUGGACAGGGGAAAGCAGUCAUUGGAGACGAUCUGCCUCUUACUGGCCUACAAAAUAAAAUAUCCUGAGAAUUUUUUUCUUCUCAGAGGGAACCAUGAAUGUGCCAGCAUCAACAGAAUUUAUGGAUUUUAUGAUGAAUGUAAAAGAAGAUACAACAUUAAACUAUGGAAAACUUUCACAGACUGUUUUAACUGUUUACCGAUAGCAGCCAUCGUGGAUGAGAAGAUAUUCUGCUGUCAUGGAGGUUUAUCACCAGAUCUUCAAUCUAUGGAGCAGAUUCGGCGAAUUAUGCGACCAACUGAUGUACCAGAUCAAGGUCUUCUUUGUGAUCUUUUGUGGUCUGACCCCGAUAAAGAUGUCUUAGGCUGGGGUGAAAAUGACAGAGGAGUGUCCUUCACAUUUGGUGCAGAAGUGGUUGCAAAAUUUCUCCAUAAGCAUGAUUUGGAUCUUAUAUGUAGAGCCCAUCAGGUGGUUGAAGAUGGAUAUGAAUUUUUUGCAAAGAGGCAGUUGGUCACUCUGUUUUCUGCGCCCAAUUAUUGCGGAGAGUUUGACAAUGCAGGUGCCAUGAUGAGUGUGGAUGAAACACUAAUGUGUUCUUUUCAGAUUUUAAAGCCUGCAGAGAAAAAGAAGCCAAAUGCCACGAGACCUGUAACGCCUCCAAGGGUUGCAUCAGGCCUGAACCCGUCCAUUCAGAAAGCUUCAAAUUAUAGAAACAAUACUGUUCUAUACGAGUGACCGAUUAUGCUUUCUUUGGCCUACAUUCUUUAUUCUGCGGUGAAGUUGAGGCUUAUAAGUUAAAACAAAGGAACUAACUUACUGUCCACCAGUUUAUACAGAACUCACAGUACCUAUGACUUUUUUAAACUAAGAUCUGUUAAAAAAGAAAUCUGUUUCAACAGAUGACCGUGUACAAUACCGUGUGGUGAAAAUGAAUUCAGACUUAUUAAAUGAUGAACUUGUUAAAUCUUCUCAGUGUCUAUUUAUCAGCACAAUACACACAGGAGAACUGUUGAUGGCAUAUUGAAUAGAUUUUCCUGAAUAAAUUGCUCUGGAAACCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-475.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -504.40
Frequency: 0.0000
Diversity: 320.84
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.......(((((((((.((.((.((((.(((((((((((.(((((.(((((.(((......))))))))..)))))((((.((((.(((((.(((((((((((((((.(.(((((.............))))).))))))))(((((((...)))))))..)))))..))).)))))...)))).)))).......((((((((...(((.((((((((((((((..((((((((..((((.((((((..((((.(((.........)))))))...(((((.((..(((..(((((........)))))..)))..)).))))).....)))).)).)))).......(((.((((((((((((..((((((((.(((.((((......)))))))))))))))...))))))))..)))).))).((.((((.(((((......))))).)))))).....((((((((...(((((((((...((((.(.....).))))..(((((..(((..........(((((((((........))))))).))..........))))))))(((((..((((((....)))))).)))))..((((........)))).(((......)))(((....)))...)))))))))..))))))))...))))))))....)))))))..........))))))))))..)))))))).(((..((((((((((((((((..........(((((.((((((((.((..((((((((((.((((.(((((((((((((......))))(.((((((...(((....)))....)))))).).....)))))))))...))))...))))))))))..)))))))))).)))))))))))).((.((((..((.(((.......))).)).)))).))))))))))))))..............(((((((((((((((((((((((((((((.(((.........))).))))...)))).(((((((........((((.((((...(((((....)))))...)))).))))....)))))))........(((((.....(((..((....((((((.(((...))))))))))).)))(((((........)))))...)))))....(((((((.((....))))))))).)))))))))))..))).))))))).))))).)))))).))))(((((.(.((((((((.....(((((............)))))((((((.....(((((.....))))).)))))).......(((((((((.(........))))))))))......))))))))...).)))))..........((((((((...((((((..((((.........(((...........)))........))))))))))...)))..))))).(((((((((((((.(........).))))).))))))))......)).)))))).)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.......{((((((((.((,({.((((.(((((((((((.(((((.(((((.(((......))))))))..)))))((((.((((.{(,((,((((({({(((((({,(.(((((.........}...))))).})))))))({(((((,..}})))))}.)}}}),.}))})))))...)))).)))),,.....((((((({,..(((.(((((({(((((((..((((((((,.,{(,{(((({({{{(({{((({{.,..,{,||}|||,...(((((.((..(((..(((((........)))))..)))..)).)))))....}}}||,}}.}}})}}...,,|{{,((((((((((({..{(((((({.{{,{((((......))))))}}))))))},..))))))))..))||,}||{((,{,(({(((((......))))))))))))},,,,((((((((...(((((((((..,((({.,,.,,}|,}}}}..(((({..{{{..........{((((((((........))))))).)).....,,...})}))))){{{{{..{{{{{{,,,,)})))}.}|}||..((({........)))}.|||,.....,}}||....,)))},.)))))))))..))))))))...))))))))....))))))){{{....}}}))))))))))..)))))))).(({.,((((((((((((((((..........(((((.((((((({,((..((((((((((.((((.(((((((((((((......)))){.((((((.,.(((....)))....)))))).).....)))))))))...))))...))))))))))..)))))))))).)))))))))))).{(.((({..((.(((.......))).}),)))).))))))))))))))..............(((((((((((((((((((((,,{(((((,(({.........))),)))}.,,,,|..(((((((........((((.((((.{.(((((....))))),..)))).))))....)))))))........(((((.....(((..{{....((((((.(((...))))))))))).)))(((((........)))))...)))))....(((((({{((....))))))))).)))))))))))..)))}})))))).))))).)))))}.))))(((((.{.((({{(((...,,{{{{{...,...,,...}}})}|{((({.....(((((.....))))).})))),.,,.,..((((((({{{(........))))))))))..{|{{||}}}})),,,).})))},,.....,,.{((({{((...{(((((..((((........,(({{{,..,.....},}}}}}}}..)))))))))).,.)))..,}}}}.(((((((((((((.(........).))))).))))))))......}).)}))))}}}))}
Back