Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001252051.1
Sequence Length
1646 nt
GC Content
0.4283
GCGGCGUCACAGAGCGCAUGCGUGCCGCGGGGGAUGCCGGGAGCGCGCAGUGGCGGCAGCGGCGGCGACGGCAGUAACAGCGGCAGCUACAGCGGGGACGCGAGCGGGGCGGUGACGGUGUGGGAGGUGGUCUCACUCUUGGGAAAACUGCUGGGCACCGUCGUCGCGCUGAAGGUGGUUCUGUACCUGCUCCGAGUGUGCUUAGCGAUGGCCUGGAAAUCCGGCGGCGCCAGCCACUCGGAGCUAAUCCACAAUCUCCGCAGUUUCCAAGCAACAAUCAGUGCUCCACACAUGCAUGCAUAUGCGCUAGAACUUCUAUUUGAUCAGUUGCAUGAAGGAGCUAAAGCUCUUGAUGUAGGAUCUGGAAGUGGAAUCCUUACUGCAUGUUUUGCACGUAUGGUUGGAUGUACUGGAAAAGUCAUAGGAAUUGAUCACAUUAAAGAGCUAGUAGAUGACUCAGUAAAUAAUGUCAGGAAGGACGAUCCAACACUUCUGUCUUCAGGGAGAGUACAGCUUGUUGUGGGGGAUGGAAGAAUGGGAUAUGCUGAAGAAGCCCCUUAUGAUGCCAUUCAUGUGGGAGCUGCAGCCCCUGUUGUACCCCAGGCGCUAAUAGAUCAGUUAAAGCCCGGAGGAAGAUUGAUAUUGCCUGUUGGUCCUGCAGGCGGAAACCAAAUGUUGGAGCAGUAUGACAAGCUACAAGAUGGCAGCAUCAAAAUGAAGCCUCUGAUGGGGGUGAUAUACGUGCCUUUAACAGAUAAAGAAAAGCAGUGGUCCAGGUGGAAGUGAUUUUAUCUUCUGCUCUUUCUUCUUCCACACAUGCAAGGGAUGAAUUGUAAAAGCAACAUCAGCUUGACCAGUAUAAAAUUACAGUGGAUUGCUCAUCUCAGUCCUCAAAGCUUUUUGAAAACCAACACCAUCACAGCUUGUUUUGGACUUUGUUACACUGUUAUUUUCAGCAUGAAAAUGUGUGUUUUUUUAGGGUUUCUGAUUCUUCAAAGAGGCACAGAGCCAAAUUGGUAGAGGAAGGAUGCAAAGUAUAAAUUUGUGUAAUAUUACUUUAACAUGCCCAUAUUUUACUUGGAAAUAUUAAAAGAAAGGGUUCUGUAAAAUGGAAAACUUAGUUUGUGAAUUGAUUUUGAGGAGUGGUUUUUCUUUUCUUGGACACUUAAUUCUGUUCUGAUAUUAAUUUAUCAGAUUGCUUUUGUGCAUUGGAUAACACCACCAUUCACAAGUUAAGAUUCUUGGUAUUUGGAUAUCUGUUAGAUGCUACUAAGAAAAUAGAGAUGAGCUUUCUUUUUAAAGCUUUUGAUGUGGUGUCAUAGAAUAGCAUGUUGUAGAUACAAUCAGCUGCUUUGUUACCUUAAAACUAGGCAUUUGUAAAUAUUAAACCAUAAGAUGGCAGGUGAUGUCCUGUAAACACUCAGCUGUUCAGAUUGGACAUAACUGACUUAGUUCUUCCCUUCUCUCUCUCUCAAAAUUAUAGGAGACUUGUAGUUUAGUGUGGUUUUCUGUUUCUAAUUUGCUGCUGAUAAUGUAUAUGAACUUAACAUGCUGUGUAAGCUGUGUCCUAGUUCUUGAACAGUUUAUGCAGUGCUGCUUUGCCAAAUAAAGUUAAAAGUAAAAGAGGCAAAAAAAAAAAAAAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-502.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -532.72
Frequency: 0.0000
Diversity: 386.01
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.((((......)))).((((((((.(((......))).).)))))))((.((....)).))(((((.((((((..(((((((((((((.(((((((......(((.(((((((((((((.((.(((..(((((....)))))..))).))..))))))))))))).))).(((((......)))))((((((((((.(((..(((.(.(((.((....))))).)))).)))))))))))))..........))))))).)).....)))......((((((((((..(((((.((((((((((.(((...((((((((((((..((((((..((((((....)))))).))))))))))...))))))))...))).))))))...)))).)))))..)))).))))))....((..((((((...((((((((((((..((.(((...((((............))))(((.......)))....(((((((....((((((((....((.(((.((((((((.((((((...((((..((((....((((((.(((((......))))).))).)))(((((....))))).((((.(((..((((......))))..))).)).))...........(((((((.......))))))).........(((((((((((((((.((..(((..(((.(((..(((....)))..))))))..)))...)).))))).)).))))))))............)))).))))..(((((((.........))))))))))))).))))))))))).))((((((.((((((...((((.......)))).....(((......)))...(((..((((((((((((((...(((((...(((............))).))))).....))))).((((((((..((((.((..((((.....(((((.(((((..((((((...))))))..))))).)))))..((((...)))).........))))..)).))))....))))))))........(((.(((((((((((.....))))))).........))))..)))...........((((((((((((((.......((((((........))))))..(((........)))..(((((((......))))))).(((......))).(((......)))..)))))))))))))).((((((((....((.(((((...)))))))))))))))....)))))))))..)))...((((((..(((((...(((((.((.((((...)))).))))))).)))))..))))))...(((.......)))(((((.................)))))(((((......)))))......((((.((((((...))))))...))))..)))))).))))))..)))))))).......)))))))))).))..))))))))))))))))))..))....))))))))...((((.((......))))))((((((((((((((..............))))))))))))))))))))))))).......................))..................
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({{((((.,...||||.((((((((.(((......))).).)))))))||}||},}.)},))|{||,,{(((((,.((((((((({{,,.(((((((.,,,..(((.(((((((((((((.((.(((..(((((....)))))..))).))..))))))))))))).))).(((((......)))))((((((((((.(((..(((.(.(((.((....))))).)))).)))))))))))))..........})))))).)),.,..,)}.....,((((((((((..(((((.((((((((((.{((...((((((((((((..{(((((.{((((((....)))))).)))))})))),,,))))))))...}}}.)))))),..}))).)))))..)))).)))))),...{{..(((((({..((((((((((((..((.(((...((((............)))),{{.{{,...}}}....{{{{{((,{{,((((((((....((.(({{((((((((.((((({..,(({{.,((({....((((((.(((((......))))).))).))),|{{(,{{,||}},,(({(,(((..{(({...,,,|||}..}||.}}.))..,,}}|,,.,|((((((.,.....)))))))}...,,,..(((((((((((((({.(,..(({..(((.(((..(((....)))..))))))..}}),.,),.))))).))}})))))))..........,,))}}.}))).{(((((((......,..))))))))))))).))))))))))).))((((((.((((((....,({,{{{{{{||||,.{{,(((......))).,.(((..((((((((((((((...(((((...(({............})).))))).....))))).,{{{((((...{(((((({...})))))}}{|({(((((({((((({,,,|}}}}},.}}))))))}}|,,(((,...}}}|,,,,..,..{{({{{{,,,....}}}))))},},...}|||.,||.{{(({{,((((,....}}},}}}.........})))}}))).,,,.||,...((((((((((((((.{...,,{(((((.{{....,)}}))),}}}|,{,.......,,,(((((((......))))))).(((......))).(((......))).,)))))))))))))).|{(((((({,,,{(.{{{{{..,)))))))))))))))....)))))))))..)))...{{{{((..{{{{{.,.(((((.((.((((,,.}})),}}))))),))}}).,)))))},..{{{.......)))|,,||,,.............,...,)))||||}}}}}}}}))}......{(((.((((({...})))))...))))..}))))).)))))).,))))))}},......}}}))))))).))..))))))))))))))))))..))....))))))))...((((.,,......},})))((((((((((((((............,.))))))))))))))))))))|||||......................}))},................
Back