Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001252386.2

Sequence Length

2698 nt

GC Content

0.5882

ACUUCCUCGUCCUCGGCCCGGGUGCCCUGCCCCCGUCCAGGAGCCCUAGGAGUGCUACGGGGGGCCGGAGCCUUGCCCGGGCCGCUGCCCCGUCCCUGGAUUCGGGGCUGGACGCAGCAAGCGGGGCGCUGUGUCCCCAAGCUCCCCGUCCUCGGGGGAGCUUUUGGAAGAGUCCCAGAUGGAAGCGACCAGGCUCCGGCAGAAGGCAGAGGAGCUAGUGAAGGACAACGAGCUGCUCCCACCACCUUCUCCCUCCUUGGGCUCCUUCGACCCCCUGGCUGAGCUCACAGGAAAGGACUCAAAUGUCACAGCAUCUCCCACAGCCCCUGCAUGCCCCAGUGACAAGCCAGCACCAGUCCAGAAGCCUCCAUCCAGUGGCACCUCCUCUGAAUUUGAAGUGGUCACUCCUGAGGAGCAGAAUUCACCAGAGAGCAGCAGCCAUGCCAAUGCGAUGGCGCUGGGCCCCCUGCCCCGUGAGGACGGCAACCUGAUGCUGCACCUGCAGCGCCUGGAGACCACGCUGAGUGUGUGUGCCGAGGAGCCGGACCACGGCCAGCUCUUCACCCACCUGGGCCGCAUGGCCCUGGAGUUCAACCGACUGGCAUCCAAGGUGCACAAGAAUGAGCAGCGCACCUCCAUUCUGCAGACCCUGUGUGAGCAGCUUCGGAAGGAGAACGAGGCUCUGAAGGCCAAGUUGGAUAAGGGCCUGGAACAGCGGGAUCAGGCUGCCGAGAGGCUGCGGGAGGAAAAUUUGGAGCUCAAGAAGUUGUUGAUGAGCAAUGGCAACAAAGAGGGUGCGUCUGGGCGGCCAGGCUCACCGAAGAUGGAAGGGACAGGCAAGAAGGCAGUGGCUGGACAGCAGCAGGCUAGUGUGACGGCAGGUAAGGUCCCAGAGGUGGUGGCCUUGGGCGCAGCCGAGAAGAAGGUGAAGAUGCUGGAGCAGCAGCGCAGUGAGCUGCUGGAAGUGAACAAGCAGUGGGACCAGCAUUUCCGGUCCAUGAAGCAGCAGUAUGAGCAGAAGAUCACUGAGCUGCGUCAGAAGCUGGCUGAUUUGCAGAAGCAGGUGACUGACCUGGAGGCCGAGCGGGAGCAGAAGCAGCGUGACUUUGACCGCAAGCUCCUCCUGGCCAAGUCCAAGAUUGAAAUGGAGGAGACCGACAAGGAGCAGCUGACAGCAGAGGCCAAGGAGCUGCGCCAAAAGGUCAAGUACCUGCAGGAUCAGCUGAGCCCACUCACCCGACAGCGUGAGUACCAGGAAAAGGAGAUCCAGCGGCUCAACAAGGCCCUGGAGGAAGCACUGAGCAUCCAAACCCCGCCAUCAUCUCCACCAACAGCAUUUGGGAGCCCAGAAGGAGCAGGGGCCCUCCUAAGGAAACAGGAGCUGGUCACGCAGAAUGAGUUGCUGAAACAGCAGGUGAAGAUCUUCGAGGAGGACUUCCAGAGGGAGCGCAGUGAUCGUGAGCGCAUGAAUGAGGAGAAGGAAGAGCUGAAGAAGCAAGUGGAGAAGCUGCAGGCCCAGGUCACCCUGUCAAAUGCCCAGCUAAAAGCAUUCAAAGAUGAGGAGAAGGCAAGAGAAGCCCUCAGACAGCAGAAGAGGAAAGCAAAGGCCUCAGGAGAGCGUUACCAUGUGGAGCCCCACCCAGAACAUCUCUGCGGGGCCUACCCCUACGCCUACCCGCCCAUGCCAGCCAUGGUGCCACACCAUGGCUUCGAGGACUGGUCCCAGAUCCGCUACCCCCCUCCCCCCAUGGCCAUGGAGCACCCGCCCCCACUCCCCAACUCGCGCCUCUUCCAUCUGCCGGAAUACACCUGGCGUCUACCCUGUGGAGGGGUUCGAAAUCCAAAUCAGAGCUCCCAAGUGAUGGACCCUCCCACAGCCAGGCCUACAGAACCAGAGUCUCCAAAAAAUGACCGUGAGGGGCCUCAGUGAGACCAGAUUGUGUCAUUUGGCUCCACCUUCAUCUUGCAGAGCCAGCUGAUCUCAGAUUGCCAAGAAACUAGAAGCCACUUGCACGGUGUGGCCAGAGCCUCAGCUGGAUGAGAGGCUGAGAUGGGUGGCCAGCUUGUACACCAGUCCCUGAACUGAGCUGUUUACAGGACUGGGGAGGCUCCACCCAGAAGGCUUUCAUUUGUACUCUGCUGGGAGUGACUGGGAAAAACUCCUUCCCUGCUGCUGAGUGGAGAGAGGCCUCAUCCGGCUUUGACCCACCAUCCGUUGCAGAAGCCUCCAGGAGCAGCAAUCCUAAGAGUGGGAGGCAGCCAAGACCCCCUUCCUUCAAAACCUCCCGGAAGUGGUUUCAGGCCCUCUAGUUGCCAUGACCAAUUUGUGUGUGUGUUUAAUUUUUGCUUCAAGCUCUGUAGCAGGACCUGCCCCACGCACACCCCUACCCCUCUGUGAGGAGCUGUGGGAAGUGUGGGUUUGUCUCCAGAACAGAAGAGAAUGAUGGAUAUUCUGGCUCUGGGGCCCUCUCCACCACCACUCACAGUAGCCUUGCUGAAGCCAUCACAGAUGGGAGAAGGCCAUGCCAGCCACGUCCGCCGAGGGGCGCCAGCCUGAAGCUGCCAGGCCCUGAGGUUCAGACCCUGGACCCCAUAGCUGGAGGCCUGUGGUGCCAGAAGCCCAGAUUAGGGUGGCUGUCCAUCCCUGGAUAGCUAUUUGCACGAAUCAUGGACAUAAAUCCAAGUUGAAGAAGAUCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-1065.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -1106.26

Frequency: 0.0000

Diversity: 728.03

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((((.((((((.((((((((((((((.((((((.((((((...))).)))........)))))).)).))...))))))))))..((((((..........)))))).))))((((((.((((((.(((((((((..(((((((((.......)))))))))..))).((((((.....(((.((......)))))((.((((((....(((((.(((...(.....)..)))))))).....)))))).))(((((((((((..(((......)))..))))))).))))..))))))..((((....))))....))))))))))))....((((((.((...((((((..(((.((((((((((((((((((.....((((((((((......((((((.((((((..(((.....)))..))).)))((((.(((((((....)).)))))))))(((.....)))((((....))))...((.(.((((((....)))))).).)).))))))((.(((((.((((((.(((((((.((.(....))).))))))).....((.(((((....))))).)).(((((..(.....(((((...)))))....)..))))).))))))...))))).)).....((((....)))).))))).)))))...(((((((((.(((((...((((.....(((((((..(....)..))))))).))))..(((((.((((((...(((((((((((..(..((((((....))))))..).........((((.((((((....)))))).))))..(((((((((((....((.((..((.((((((((..(((((((...((.(((((((..(((....((((((.((((((((((((((((......))))).....((((...((((((..((((((((.......)))))))...((......))((((((..((((....(((((...(((.(((((....(((........)))....))))).)))...)))))(((.....)))..(((((((..((((((...(((...((((..(.((..((...))..)).)..))))...(((((((....(((........)))....))))))).((.....)).((((((....((....)).....)))))))))...))))))..))))))).......))))..))))))....)..))))))...))))............(((((.((((......)))))))))(((.((.....)).))).......)))))))))))..((((......))))..((((....)).)).))))))(((((........))))))))))))))))).....)))))))...))))..(.((((.(((((...))))))))))...(((.(((..(((.(((((.((.((((...(.((((..((....(((.....))).((((((..(((((..(((.((((....))))......))))))))....((.(((...........))).)).........((((...........))))...(((..(((....((((.((((......((((.(((((...((((.....)))).)))))))))....)))))).)).)))..))).((((((((((...))))))))))((..(((....)))..))))))))..))..)))).).)))))))))))..))).)))))))))).))...)).))..)))))))))))(((((.......))))).((.(((((.....)))))..))...........))))).)))))).......)))))).))))).))))).......((..(((..........)))..)).((((((..(((((.((......)).))))).)))))).......(((((....((...(((....)))...)))))))........(((((.........)))))))))))))).)))))))).))))))....(((((((..(((((.....(((((((.(((((......)))))..)))))))..))))))))))))(((....))).)))).))).))))))..)).))))))..............))))))((.((((.(.((((((......))))))..)))))))..(((.((((((((.((((((.(((((.(((((((...((((.((((.((((((((..(((((.............))))).)))))((((((.((((((((.............(((((((((......(((((((.((.....)).))))))).......)))))))))..((.(((.(((((((((.((((((((..(((((((...(.(((((((.(((((..............)))))..))))))).)...)))).)))..))))))))(((...)))....)).))))))).)))))..((((.((.((((((.((.((((....))))...)).))..)))).)))))).((.(((((((...))))))).))))))))))))))))))))))).....))))..))))))).))))).....))))))..))).)))))))).....((((......))))....)).)))).....

Thermodynamic Ensemble Prediction

.((((.((((((.((((((((((((((.(((((((({{(({..,|}}.)),...,,})})))))).)).))...))))))))))..((((((.,........)))))).))))|||(((.((((((.(((((((((..(((((((((.......)))))))))..))).((((((.....((,,((......)))))((.((((((..{.(((((.(((...(.....)..)))))))).....)))))).))(((((((((((..(({......}))..))))))).))))..))))))..((((....))))....)))))))))))).}},,,,,(({,(,,.{,,((({{(,,.(((.,((((((({{{{((((,..(((((((({,...,..((((((.((((((.,(({.....}))..))).)))((((.(((((((....)),}))))))))(((.....))}((((..,.,|)}|..((.{.((((((....)))))}.,,||.}}}}}|((,({{{{,((((((,{{(((((,((.{..,,|}}.))))))).....{{.(((((....))))).)).{{{{{..|,.,||||{||,..))))).},.,..}}}}).)))}}}}},})}})|)),,...{{{{....))))|}})))},)))),,{,,(((({,...}}||..}}}},...{((((((((..{{((,,..{((((((({{....|||{,,((((((....{((({,((((...,.{(((((..,,)))}}}|})..},.,...((((.((((((....)))))).))))...((.(((((((.{..((.....,|},|||((((.....|}}}{{{((..((((((((..({{{{(((((({,,,,|||,|||}}|(((({.(((({.{{.{..(((,.,((((((((..(((((((.......)))))))...,{,.....,},.|.,..))))))}}}|{,,({{{(..{((((({{{{((.{{....{{|||{{{.|||,|.{{....((((((((((({......(((((({.{((((((...(((...((((..,,{({,((...,},.})})..))))...(((((((....{,(,{{...,,))}....))))))).((.....)).((((((....((....)).....)))))))))...)))))}.}))))))).})))))))).})),,((((((.{....}.)))))).{{.|.....||,,.(((((.((((......)))))))))(((.((.....)).)))...||,.||},||,})))|.((({......)))),.{{{{.,..}}.)).})))}|(((((..,.....}))}||||,|||}||||..,..,)))))),..))))..,,{{{{.|||{{..,)))))))))}.)),),}|},}}||}}||,|..||.}}||...((((,(((((..(((((((({,.((((.(((....((((.((((((,,,{{{{,,,{{{,,{{((...,,.....))}}}...{((((.((((,,(((..(((..,,((((...........))))...{{{..(((....((((.((((......((((.(((((...((((.....)))).)))))))))....)))))).)).}}}..})).((((((((((...))))))))))..{,((,,,(,,..|,}.}}}}},,,}..,))),.....}))},}}||.||....)),,},,,,.,,...)))..)))))))))))))(((((.......))))){{{{...((((((.(((((({,.........,,.,,|||.,.,,}),,}))})))),))))))..}))},,........|,.|||,........,))).}))}.))))))))))....))}..}))).)).))))))))..))))).))))({{{{(({((((({.{{{,|.,|,,,......,,....(((((.......,.))))),.))),,))})))))|||{|||,|{....(((((((..(((((.....(((((((.(((((......)))))..))))))),.))))))))))))..}}.}))))}),,,.,))}))),||{{||.,,,,,,....}}}}}}...}))))))}..||||}..|,{|||}}.}}})))),)}.))))))..}||}}|||,,|||}|,{,{(.((,((..(((((....||||},|}.}}|..,.,,})))))).}}....}}}}}}}||.|{||||.((((((.(((,((({.......,,,,..(((((((((......(((((((.((.....)).))))))).......)))))))))..,,.(((,(((((((((.((((((((..(((((((...(.(((((((.(((((..............)))))..))))))),....})))}}))..)))))))){{{...}}}....)).))))))).)))))}.)))).}}.,})))}},|}({({....)))).,}))}))}.))))}))))))}},.(((((((...))))))),)}},},)))))))))))))))),....,|||...,,,)))){|||||{{,....))))}}))).})))))),.....((((......)))).,.,)).)))).....