Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001253900.1

Sequence Length

2471 nt

GC Content

0.4630

AAAAGUCGGUGCCCACUCGCUCCGCGCUGCCGCGGCAACCAGCACACCCCGGCACCUCCUCUGCGGCAGCUGCGCCUCGCAAGCGCAGUGCCGCAGCGCACGCCGGAGUGGCUGUAGCUGCCCGGCGCGGCGCCGCCCUGCGCGGGCUGUGGGCUGCGGGCUGCGCCCCCGCUGCUGGCCAGCUCUGCACGGCUGCGGGCUCUGCGGCGCCCGGUGCUCUGCAACGCUGCGGCGGGCGGCAUGGGAUAACGCGGCCAUGGUGCGCCGAGAUCGCCUCCGCAGGAUGAGGGAGUGGUGGGUCCAGGUGGGGCUGCUGGCCGUGCCCCUGCUUGCUGCGUACCUGCACAUCCCACCCCCUCAGCUCUCCCCUGCCCUUCACUCAUGGAAGUCUUCAGACUCUGUGGGUGUGGUUGGAAGUCCAGAGAUAGUUGUGCUUUUACACGGUUUUCCAACAUCCAGCUACGACUGGUACAAGAUUUGGGAAGGUCUGACCUUGAGGUUUCAUCGGGUGAUUGCCCUUGAUUUCUUAGGCUUUGGCUUCAGUGACAAACCGAGACCACAUCACUAUUCCAUAUUUGAGCAGGCCAGCAUCGUGGAAGCGCUUUUGCGGCAUCUGGGGCUCCAGAACCGCAGGAUCAACCUUCUUUCUCAUGACUAUGGAGAUAUUGUUGCUCAGGAGCUUCUCUACAGGUACAAGCAGAAUCGAUCUGGUCGGCUUACCAUAAAGAGUCUCUGUCUGUCAAAUGGAGGUAUCUUUCCUGAGACUCACCGUCCACUCCUUCUCCAAAAGCUACUCAAAGAUGGAGGUGUGCUGUCACCCAUCCUCACACGACUGAUGAACUUCUUUGUAUUCUCUCGAGGUCUCACCCCAGUCUUUGGGCCGUAUACUCGGCCCUCUGAGAGUGAGCUGUGGGACAUGUGGGCAGGGAUCCGCAACAAUGACGGGAACUUAGUCAUUGACAGUCUCUUACAGUACAUCAAUCAGAGGAAGAAGUUCAGAAGGCGCUGGGUGGGAGCUCUUGCCUCUGUAACUAUCCCCAUUCAUUUUAUCUAUGGGCCAUUGGAUCCUGUAAAUCCCUAUCCAGAGUUUUUGGAGCUGUACAGGAAAACGCUGCCGCGGUCCACAGUGUCGAUUCUGGAUGACCACAUUAGCCACUAUCCACAGCUAGAGGAUCCCAUGGGCUUCUUGAAUGCAUAUAUGGGCUUCAUCAACUCCUUCUGAGCUGGAAAGAGUAGCUUCCCUGUAUUACCUCCCCUACUCCCUUAUGUGUUGUGUAUUCCACUUAGGAAGAAAUGCCCAAAAGAGGUCCUGGCCAUCAAACAUAAUUCUCUCACAAAGUCCACUUUACUCAAAUUGGUGAACAGUGUAUAGGAAGAAGCCAGCAGGAGCUCUGACUAAGGUUGACAUAAUAGUCCACCUCCCAUUACUUUGAUAUCUGAUCAAAUGUAUAGACUUGGCUUUGUUUUUUGUGCUAUUAGGAAAUUCUGAUGAGCAUUACUAUUCACUGAUGCAGAAAGACGUUCUUUUGCAUAAAAGACUUUUUUUUAACACUUUGGACUUCUCUGAAAUAUUUAGAAGUGCUAAUUUCUGGCCCACCCCCAACAGGAAUUCUAUAGUAAGGAGGAGGAGAAGGGGGGCUCCUUCCCUCUCCUCGAAUGACGUUAUGGGCACAUGCCUUUUAAAAGUUCUUUAAGCAACACAGAGCUGAGUCCUCUUUGUCAUACCUUUGGAUUUAGUGUUUCAUCAGCUGUUUUUAGUUAUAAACAUUUUGUUAAAAUAGAUAUUGGUUUAAAUGAUACAGUAUUUUAGGUAUGAUUUAAGACUAUGAUUUACCUAUACAUUAUAUAUAUUUUAUAAAGAUACUAAACCAGCAUACCCUUACUCUGCCAGAGUAGUGAAGCUAAUUAAACACAUUUGGUUUCUGAAUAAAUUGAACUAAAUCCAAACUAUUUCCUAAAAUCACAGGACAUUAAGGACCAAUAGCAUCUGUGCCAGAGAUGUACUGUUAUUAGCUGGGAAGACCAAUUCUAACAGCAAAUAACAGUCUGAGACUCCUCAUACCUCAGUGGUUAGAAGCAUGUCUCUCUUGAGCUACAGUAGAGGGGAAGGGAUUGUUGUGUAGUCAAGUCACCAUGCUGAAUGUACACUGAUUCCUUUAUGAUGACUGCUUAACUCCCCACUGCCUGUCCCAGAGAGGCUUUCCAAUGUAGCUCAGUAAUUCCUGUUACUUUACAGACAGGAAAGUUCCAGAAACUUUAAGAACAAACUCUGAAAGACCUAUGAGCAAAUGGUGCUGAAUACUUUUUUUUUAAAGCCACAUUUCAUUGUCUUAGUCAAAGCAGGAUUAUUAAGUGAUUAUUUAAAAUUCGUUUUUUUAAAUUAGCAACUUCAAGUAUAACAACUUUGAAACUGGAAUAAGUGUUUAUUUUCUAUUAAUAAAAAUGAAUUGUGACAAAAGUGGAAAAAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-804.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -845.39

Frequency: 0.0000

Diversity: 691.07

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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