Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001256530.1
Sequence Length
1116 nt
GC Content
0.6102
CUCCUGCCCAUUCCGCGGAUGGGCAAUCCCAGGCGGAACUCCCUUGAGGGUCUCAGAAUAUCUGGGAGACCUCGGGCUCUUGAUCUCCGAGACACCCCGUUUCGUAGUGGAGAACAGUCCAGAUCGGGGAAGUUUAUUUUGCCCAAAGCCGGUUAGAGGCCCCCUGGCCCUCGAUUCCCAGUGCGGGGCUCAGGUGCGUUGCAGCCUAGACGGGUCUUACUGUGAGCCGAGCAGCCUCUGGGACCUGUCUGCUUCCCCUACCCCUUGCAAAGAAGCCGGAGCCCAGAGCUCCCCUGAACAGCAGCUGCAGCAGCCAUGGCCCCGCCCUGGGUGCCCGCCAUGGGCUUCACGCUGGCGCCCAGCCUGGGGUGCUUCGUGGGCUCCCGCUUUGUCCACGGCGAGGGUCUCCGCUGGUACGCCGGCCUGCAGAAGCCCUCGUGGCACCCGCCCCACUGGGUGCUGGGCCCUGUCUGGGGCACGCUCUACUCAGCCAUGGGGUACGGCUCCUACCUGGUCUGGAAAGAGCUGGGAGGCUUCACAGAGAAGGCUGUGGUUCCCCUGGGCCUCUACACUGGGCAGCUGGCCCUGAACUGGGCAUGGCCCCCCAUCUUCUUUGGUGCCCGACAAAUGGGCUGGGCCUUGGUGGAUCUCCUGCUGGUCAGUGGGGCGGCGGCAGCCACUACCGUGGCCUGGUACCAGGUGAGCCCGCUGGCCGCCCGCCUGCUCUACCCCUACCUGGCCUGGCUGGCCUUCACGACCACACUCAACUACUGCGUAUGGCGGGACAACCAUGGCUGGCGUGGGGGACGGCGGCUGCCAGAGUGAGUGCCCGGCCCACCAGGGACUGCAGCUGCACCAGCAGGUGCCAUCACGCUUGUGAUGUGGUGGCCGUCACGCUUUCAUGACCACUGGGCCUGCUAGUCUGUCAGGGCCUUGGCCCAGGGGUCAGCAGAGCUUCAGAGGUGGCCCCACCUGAGCCCCCACCCGGGAGCAGUGUCCUGUGCUUUCUGCAUGCUUAGAGCAUGUUCUUGGAACAUGGAAUUUUAUAAGCUGAAUAAAGUUUUUGACUUCCUUUAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-500.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -515.83
Frequency: 0.0000
Diversity: 264.73
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((((((((...)))))))))....((((((...(((((.((.(((.(((((....((((((((.((((.(((((((....(((.(((((((((((..(..(((((((.....(((((((.(((.(((.....))).)))...((((((..(((((((..((((........(((((.((((((((..(((..((((((((..((((((((((((((((.......))))....))))))))))))(((((................))))).(((((.....)))))...........)))))))).)))..)))))))).))))).....)))).)))))))..))))))(((((((...(((((((.(((((((.........)))))))((((((((.((.((.(((......))).)).)).)))))))))))))))((((....)))))))))))...))))))).....)))))))..)..)))))))..((......))..))))))))))))))..)))))))).))))...((((((((((((..((((((.((.((((.(((((((.((((......))))..((((((((((.....((((...))))...)))))..)))))..(((((.......((.((((((((((.((.((((((((((....)))).)))...)).).))..))))))))))))))))).(((.(.((((((((((((((((.((.((....((.(((.((.((.....)).)).))))))).)).))).)))))).)))))))).))))))))))..)))))).....))))))...))))))))))))(((((....))))).(((((....)))))((((.(((((((.((((((..(((((.(((((((.....((((....))))...))))))).)))))..)))))....).))))))))))))))))))).))...)))))...)).))))........(((((((...)))))))....)))....((((..(((.(((((......))))).))).))))............................................
Thermodynamic Ensemble Prediction
.({{(((((((((...))))))))).{(((((((((....,|{..((((.(((((({...}))))))..)))){(((({((,,,{(.((((((.....)))))}.,||{||}....,)))|||,,(((.(((.....))).)))...((((((..(((((((..((((....,...(((((.((((((({,,(((..((((((((..((((((((((((((((.......))))....))))))))))))(((((...........,....))))).(((((.....)))))...........)))))))).))).,)))))))).))))).,...)))).)))))))..))))))(((((((...(((((((.(((((((.........)))))))((((((((.((.((.(((......))).)).)).))))))))}))))))((((....))))))))))).}})))))))}...(((((..{(((((({(((({...},,))},..))).))))..))))){(((.(((({,.,,,....((((((((({(({{((((((,{..(,((,(((((((,((((......))))..((((({(((,.....,|||.{{||||.,.}})))|.)))))..(((((.......((,(((((((((({((((({({(((({....}}}|||||...,)})}),..))))))))))))))))).|{|,,.((((((((((((((((.((.((,...((.(((.((.((.....)).)).))))))).)).))).)))))).)))))))..}})))))))),,,)))}}.}||,)),,,,...))))))))))))(((((....)))))((((((....)))))){((,(({{(((.,(((({..(((((.(((((((.,,..({{{....))))...))))))).)))))..)))))....,,|}})))}))))))))))))))).,,(((((({.,,,.|||}||,,,,.{{(((({...})))))),,..))}....((((..(((.(((((......))))).))).))))............................................
Back