Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001256584.2
Sequence Length
1836 nt
GC Content
0.5594
CCUCUCGCCGCCGAGGGUCAGGAGCCCGGGAGCGCGACCCUCCCCCGGCCCGGCCUGGCCCGGCCUGGCCAGUCCCCGCGGUCUCUGCCCGGGCUGACGCCCAGGAAUGUGGUCGACGAGAAGCCCCAACAGCACGGCGUGGCCUCUCAGCCUCGGAAGUCUCCAAGGACCCCCAUGAAACACCUGCAUUUCCUGUCAUGAUUUUGAGGCUGAAAUCAUCUUCCUCCUCCCAGAACACCUAGGUGUUCUAGUCUGAAGCCAUCCUCACUCUCAACUCCCCUCCUUCGAGCCCUCACCCUGUGCCUGAAUUCUUCCUUCUUUGCUGGGACAGAUGGACAGGAGGAAGACAGGAAGUGGGGAACCCCUUCAACAACUCCUAUGGCAGAGGGGAGCCAUAGGAGAUGGGCCGGGAAAUGUAAAGACCAGCCCACGCAGGAAAAAAAGAGAACUUUUUAGCACAGUGUCAUCUGAAAAUGCAAGAGAAGAGAGGCUCUUGGUGGCAACAGAGGAGUGUGACUUCCAGCCUCAGGGCUAGCACCUGACCCCUGCUCUCCGUCCACAUCUGAAAAAUACCACUGGCCCUGAGAAUCCAUUGCAACUGAGGUUCUGCACCCCAACAGCUGCACUCAAGCUGCCAACUGAAGCAGAGAGCACUGCCCGCACUGCAGGGUUGUGCCUGUGUGCCCCGCUGCCUCCAGGGGUGGCUGCCUUCUGCCAGAGAAUGGACAGCUGACAUCCUGAGGACAUAGAGAGUUAGUAGGAAUGACUGUAGCCAAUGGCAAAUCCCAUGGAUGAAAAGCCACUCCCAACUCCACAAAGAUGAGCAUAGUGAAGGCUGCAGUUUAGUUGGUUCGUGGUUCCCCAGAAGGCUUUCAAACAUUCAGCAGUUGUCAUUCAGUGCCAGGCACCCAGUCUAAUGCUGAGUAUAGAGUUGUGAGCAAGACAAGCCUGAACGUGUGGAGCUUCCUGUCUGAGCCUGAUCCGGGGAUGGCCUCUGCCUCCACCACAAUGCAUACUACCACCAUUGCAGAGCCUGAUCCAGGGAUGUCUGGAUGGCCGGAUGGCAGAAUGGAGACCUCCACCCCCACCAUAAUGGACAUUGUCGUCAUUGCAGGUGUGAUUGCUGCUGUGGCCAUCGUCCUAGUCUCCCUCCUCUUCGUCAUGCUGCGCUACAUGUACCGGCACAAGGGCACGUACCACACCAAUGAGGCCAAGGGCACGGAGUUUGCUGAGAGUGCAGAUGCAGCCCUGCAGGGAGACCCUGCCCUCCAAGAUGCUGGUGAUAGCAGCAGAAAGGAGUACUUUAUUUGAGGGACAACAGACUUCACUUCCCUGAAUGCCUCCCCCAUCUCCAUCAGGAAAAAUACACCCCAUCGCCCAGCACCCCUGCUGAUACCACCAGACAGAGAGAGAGAGCACUUGAUUCUUCCCGAGAUAGCCACCUGGAAACACUAGGUGCCUGCCCAGGGAGGAACGGAGGAGGACUCGCGCUACAAGAGGCCACUCCCAGGGACCCAGGGAGGCGAUGGCCACCCCAGAGGCCACCUUUUGCUCCACGGAGGUGGGAGAAAAUCUGGGCACAUGGGGCCCCCUGGGCAGUGCAGGACAACAUCAGCUCACUGGCAGGAAAGUCCUUGUUGAGGGUGAGGGGGUGCUGGGGUACCCGGGGGCUGGGGAAGCAAGGAAAUAAGUCAUCUGUAUGCUGACUGGGGAUAAUGGCAUCAAAUGUCAGUCCUUGACAUUUGGGGGGAACAGCAGGUGCCAGAGCUAAAAGGUACCUUUGUCUGCCAUUGAUCCAGCUCAGAACGAUUGGAAAUAAAUUUGAAAUGUAACCGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-667.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -702.22
Frequency: 0.0000
Diversity: 600.30
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((((((((..((((....((((((((((...(((((......((((.((((......)))).)))).......).)))).)).))))))))...))))..)...)))).))).)))...(((((.((((((((.(((((...(((((((((.(((((....((((....((.(......)))....)))).....))))))))))))))......(((((((((((((((((((....))))))).............(((((((((((((...(((((((((((((((...((((((.(((..(((((((((((.(.(((...)))).))).))))))))..)))((((.(((...))))))).....((((((((((........)))))))))).(((((.((............)).)))))))))))............((((((.((((((......)))....)))..)))))).((((((...(((.(((.(......)))).)))...)))))))))))).............(((((((..((((((((((......((((((((.....((((((((.......)).)))))).....))).(((((.......)))))((((((((.(((.((.((((.((((........)))).)))))).)))(((((..........)))))(((((((((((.....)))).)).)))))..(((((((..(((.......)))..)))).)))(((((((((..((((..((((...)))).....))))..........(((.............)))..)))))))))))))))))...)))))....))).((((((((.......((((..((((.((((((((..((((.....))))..)))))))))))).)))).......)).))))))....))))))).(((.(((((((..((((((..((((((((..(((((((((.......((((............))))..(((..(((((((....)))))))))).))).)))))).((((....))))....((((.(((((.((......)))))))..))))....(((((((((.((((.((((........((((......((..((((((.((...(((....)))..)).))).)))..))......))))...(((((.....((((((.......))))))...)))))((((((...)))))).......)))).)))).)))))))))....((((.....(((((.(((((..............)))))))))).)))).))))))))))))))...................(((((....))))).......))))))).))).))))))).....((((((((..(.(((.(((((((.....))))))).))).)..))))))))))))))))).(((.........)))((.((((((((((.((((.(..(((....)))..((((((..((((((((........)))))))).......))))))..).))))...))))))).)))))(((((....((.(((....)))..))..))))).)))))))))))))((((((....)))))))))))..)))))))...........)))))))))..))))..))))).((((((((((((((((((.....)))))))))).....((((.(((((((..........))))))))))).)))))))).(((((.((.....)))))))......................
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((((((({,.(((({.,,,(({{{{{,|,,.|||||}}||{,((((,((((,,,,,.})}},||||,{{{{{{|.||||,|||||}||||,...)))).})...|}||.}},.}}}..,{{{{{.{{{{{{((.(((((,{{(((((((((((((((....((((....({.{......,}}....)))).....)})))))))))))}......,{(((((((((,(((((((....))))))).{.,,{,,(,({({(((,(((({,,{...((,((,,,((((((((..((((((((((..{((((((((((.{,(((...}}},.}}}.))))))))..)))|{{(.(((,..,)))}}}.....((((((((((........)))))))))).(((((.((............)).)))))))))))..{(((((....)))))}.((((((......)))....))).,,,|..)}}.}||}}..||,}}...,}}}}}}),))}.))}},}}}|{((((,,,....}}}}}....{((((((.,{((({{{{{{......{{{{{{((,.,||(({{{{{{..,,...||.|||}}}.,|..}},.(((((.......)))))((((((({.(((.((.((((.((((,,...,,.)))).)))))).)))(((((.,,{,,,.,,}||||(((((((((((.....})}}.)).)))}|,,{,{{{{{..{({.....,.)))..}})),.,|(((((((((..((((..((((...)))).....)))).......,{,,,,...,..},,....}}}..))))))))))))))))).,,})}}},...))),(((((({{...,.{,((({..((((.((((((({..((((.....))))..})))))))}}}}.}}}},..,...)),)))))),...})))))),||{,(((((((.,((((({..((((((((,.(((((((((.......((((............)))),.(((..(((((((....)))))))))),))).)))))).((((,...}))}...,((((.,{({,(((......)))}})}..)))).}.,{((((((((.((((.((((...{{{{{(({|{,,...{{|{({{(((,{{.,,|((,{{|||},.,}|||},||,..,,....,,)}))},.,{|||.,}|.{{{|||....,,,)))))),}.)}}}}|||}||}}}),,}},.......)))).)))).))))))))),...||||...,,,,,{{.(((({....,,......,}))))),}}},,}))).))))))))})))))...................(((((....})))).......))))))).))).)))))))...,.((((((((..(.(((.(((((((.....))))))).))).}..))))))))})))))))),,{,.........)))|}|||{|||||||,|||.|||.|{{...,))).{((((..,{((,..{(({.{(((((....))))}}},})}..,})))...))))},{||||}|},}}}||(({((....{{.{{{,..,))),}},..))))},))}},}))))))))))}||}}}}},,))))))))}})))),,},.,}},.....}}}}}}}}}.,}|||,,||||}.{((((((,,(((((((((,...,)))))))))}..{{,{(((.(((((((..........)))))))))))))))))))}.|||||.||,,..,))}}))}......................
Back