Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001256760.3
Sequence Length
4834 nt
GC Content
0.4092
GAGGUAGGCGCUCUGGUGCUUGCCGAGGACGCUUCCUUCCUCAGAUGCACCGAUCUUCCCGAUACUGCCUUUGGAGCGGCUAGAUUGCUAGCCUUGGCUGCUCCAUUGGCCUGCCUUGCCCCUUACCUGCCGAUUGCAUAUGAACUCUUCUUCUGUCUGUACAUCGUUGUCGUCGGAGUCGUCGCGAUCGUCGUGGCGCUCGUGUGAUGGCCUUCGUCCGUUUAGAGUAGUGUAGUUAGUUAGGGGCCAACGAAGAAGAAAGAAGACGCGAUUAGUGCAGAGAUGCUGGAGGUGGUCAGUUACUAAGCUAGAGUAAGAUAGCGGAGCGAAAAGAGCCAAACCUAGCCGGGGGGCGCACGGUCACCCAAAGGAGGUCGACUCGCCGGCGCUUCCUAUCGCGCCGAGCUCCCUCCAUUCCUCUCCCUCCGCCGAGGCGCGAGGUUGCGGCGCGCAGCGCAGCGCAGCUCAGCGCACCGACUGCCGCGGGCUCCGCUGGGCGAUUGCAGCCGAGUCCGUUUCUCGUCUAGCUGCCGCCGCGGCGACCGCUGCCUGGUCUUCCUCCCGGACGCUAGUGGGUUAUCAGCUAACACCCGCGAGCAUCUAUAACAUAGGCCAACUGACGCCAUCCUUCAAAAACAACUGUCUGGGAAAAAAAGAAUAAAAAGUAGUGUGAGAGCAGAAAACGUGAUUGAAACACGACCAAUCUUUCUUCAGUGCCAAAGGGUGGAAAAGAAAGGAUGAUAUGAUGAACCUAGCCUGUUAAUUUCGUCUUCUCAAUUUUAAACUUUGGUUGCUUAAGACUGAAGCAAUCAUGGUGAACCUGAGGAAUGCGGUGCAUUCAUUCCUUGUGCACCUAAUUGGCCUAUUGGUUUGGCAAUCUGAUAUUUCUGUGAGCCCAGUAGCAGCUAUAGUAACUGACAUUUUCAAUACCUCCGAUGGUGGACGCUUCAAAUUCCCAGACGGGGUACAAAACUGGCCAGCACUUUCAAUCGUCAUCAUAAUAAUCAUGACAAUAGGUGGCAACAUCCUUGUGAUCAUGGCAGUAAGCAUGGAAAAGAAACUGCACAAUGCCACCAAUUACUUCUUAAUGUCCCUAGCCAUUGCUGAUAUGCUAGUGGGACUACUUGUCAUGCCCCUGUCUCUCCUGGCAAUCCUUUAUGAUUAUGUCUGGCCACUACCUAGAUAUUUGUGCCCCGUCUGGAUUUCUUUAGAUGUUUUAUUUUCAACAGCGUCCAUCAUGCACCUCUGCGCUAUAUCGCUGGAUCGGUAUGUAGCAAUACGUAAUCCUAUUGAGCAUAGCCGUUUCAAUUCGCGGACUAAGGCCAUCAUGAAGAUUGCUAUUGUUUGGGCAAUUUCUAUAGGUGUAUCAGUUCCUAUCCCUGUGAUUGGACUGAGGGACGAAGAAAAGGUGUUCGUGAACAACACGACGUGCGUGCUCAACGACCCAAAUUUCGUUCUUAUUGGGUCCUUCGUAGCUUUCUUCAUACCGCUGACGAUUAUGGUGAUUACGUAUUGCCUGACCAUCUACGUUCUGCGCCGACAAGCUUUGAUGUUACUGCACGGCCACACCGAGGAACCGCCUGGACUAAGUCUGGAUUUCCUGAAGUGCUGCAAGAGGAAUACGGCCGAGGAAGAGAACUCUGCAAACCCUAACCAAGACCAGAACGCACGCCGAAGAAAGAAGAAGGAGAGACGUCCUAGGGGCACCAUGCAGGCUAUCAACAAUGAAAGAAAAGCUUCGAAAGUCCUUGGGAUUGUUUUCUUUGUGUUUCUGAUCAUGUGGUGCCCAUUUUUCAUUACCAAUAUUCUGUCUGUUCUUUGUGAGAAGUCCUGUAACCAAAAGCUCAUGGAAAAGCUUCUGAAUGUGUUUGUUUGGAUUGGCUAUGUUUGUUCAGGAAUCAAUCCUCUGGUGUAUACUCUGUUCAACAAAAUUUACCGAAGGGCAUUCUCCAACUAUUUGCGUUGCAAUUAUAAGGUAGAGAAAAAGCCUCCUGUCAGGCAGAUUCCAAGAGUUGCCGCCACUGCUUUGUCUGGGAGGGAGCUUAAUGUUAACAUUUAUCGGCAUACCAAUGAACCGGUGAUCGAGAAAGCCAGUGACAAUGAGCCCGGUAUAGAGAUGCAAGUUGAGAAUUUAGAGUUACCAGUAAAUCCCUCCAGUGUGGUUAGCGAAAGGAUUAGCAGUGUGUGAGAAAGAACAGCACAGUCUUUUCCUACGGUACAAGCUACAUAUGUAGGAAAAUUUUCUUCUUUAAUUUUUCUGUUGGUCUUAACUAAUGUAAAUAUUGCUGUCUGAAAAAGUGUUUUUACAUAUAGCUUUGCAACCUUGUACUUUACAAUCAUGCCUACAUUAGUGAGAUUUAGGGUUCUAUAUUUACUGUUUAUAAUAGGUGGAGACUAACUUAUUUUGAUUGUUUGAUGAAUAAAAUGUUUAUUUUUGCUCUCCCUCCCUUCUUUCCUUCCUUUUUUCCUUUCUUCCUUCCUUUCUCUCUUUCUUUUGUGCAUAUGGCAACGUUCAUGUUCAUCUCAGGUGGCAUUUGCAGGUGACCAGAAUGAGGCACAUGACAGUGGUUAUAUUUCAACCACACCUAAAUUAACAAAUUCAGUGGACAUUUGUUCUGGGUUAACAGUAAAUAUACACUUUACAUUCUUGCUCUGCUCAUCUACACAUAUAAACACAGUAAGAUAGGUUCUGCUUUCUGAUACAUCUGUCAGUGAGUCAGAGGCAGAACCUAGUCUUGUUGUUCAUAUAGGGGCAAAAAUUUGACAUUGUCAGAAUGUUGUGUUGGUAUUUACUGCAAUGUCUGUCCCUAAACAUAGUGGUAUUUUAACAUAGCAGCUGGUUAACCGGGACUACAGAAGUGGAAGGAUAAUGAGAUGUAAUACACCAAAUAGCUUUUCACUUCUUAAGGACAGUGUUCAAAUUCUGAUUAUUACAACAAGCAAACUGAAAUUAGUGUUUUCAUUCUGGUCCUUAGUAAAUUCCUAAUUCUAUGAUUAAACUGGGAAAUGAGAUCCCAGAGUUAUUUCCCAACCCAGGAUUCAACAUCAAUUGGGUUUUGAUCUCAGCAUCCUGGAAAUUUGUGUGCUUCACACAAAGUGAAAUUAGUAUUUUGAGCCUUAUUAAAAUAUUUUCUUAAUUAUGGUACCUCUGUCUAUAGGACUUAAUUUAGCAGUCCAUUUUUGAGUAAAACUUGUAUUGGAAGUAUAGAUGGUAGAAACUUUGGAAGUUUUACUUGAUUAAGGACUACAGAAUUGGGCCCUUAGAAUGUGAAAAAAAAAAGUAAUUAAAAAGACACUUUUACCGAACUCGGGAUUACAGAAACACGGAGUUUCCAUUUGGAUUUUAAACAAAAUUUAUGUCAUUUUCAGAUCCUUCCAAACUCUCUAGUGCAGGAAAAGGCUGCAGCUAAUUUGUGAAAGUGGCAAGCUCUUCAUUGCACUGCAGUUAUUUACCAGAAGUUUAAAUCUUUGUUAAAAUAUAGUGUUGUGUUACAAUAAGUGUUGGCCAUCAUUUCAUUCGUGGGCCUGCUGCUCUCUAAGAAUUCAGUAGCAUUUUAAUAGUUUCUAAACCAUGAAAAGUUUUCAAGCAUUGCUAAAGUCAGGCCAUUCAGUCUAUGCUGUGUGCAGAGUAUACAAGUGUUUCUAGUAACAGUAUUUCCAUACGUGCCCAUUUCACACAACUGUGGAUAAAUUUUGGAAGAAUUCAUGAUGCUAGUUCUUACGCUUGACAGUUACUUACACACCUGAGAAUGUGCCUCUCAGUAUCUUAAAAUUGGUUAAUGAAAAAUCUGAAUUUCUAAAACCCUUGGUCUGUGUUCUCAACACACAGUAUAGAUAAAUCCAAUAGUCUGCCACAAGGGCAGUGGAAGAGCUGCUGUAUUUGAGGAAACUCAUACAGUCUCUAUUUGAUUUGCAACACUGCCAAACAUCAGUCAAUUGCUUGAGCAUGCCCAAAUAUAACAUGAAAGUCAAGUCUACCUGCCUUGCCUGUUAGGUCUGUUGAAGUGCAUGUUAAAAUAAUUAUAUGAAGCAGAAUGAGAUGAUUUAAUUCUUACCGAAAUGAAAAUGGCUGAAGAAACACAGCAUGCAUUUAGCAUGAGUUCUGCACAUACAGAUGGUGUCCUGCAUGUAUGCCAUGUAUGUUGCAUGAAUCCAUCGAUUUGUAUUAAUGUAGGGCAGAAUAGCUGAUAGAAGAAGGACUGAAGAAAAUCCUUCAGCAAUCCUUAAAAAGACCAUGCAUUCAGAUCUGAAGUAGUGUGAGUGUUAGAAAAAACUGGAAACAUCUGAUUUCUGAACUAUCAGGGCAAGCUCAUAGCACAUGUUUUACAAAGAAACAAAAUAUAAAUCACAGAUUUCCAAAAGUACUAGCAAUAAGUUGAAUGAUAAUAGCUCACAGCACAUUUGUUAAUGAUUCUUGUGUCAUCAAGUAGUAGUACUUAAUAGUACCCAACCUGGUAAUUAUCCUCAAGUUGUGUGCUAUUCGUAAGUUCUGUGCAGUUUGGUAUGAAACAAAUAUACUCAUUUGGAUAUAAAUCUUACCCUUCAAUGUUAAAUCUACAAACUUUUAUAAAUGUUUUAAAGAAGUCCAUGUGAUAAUUGUAAAGGUGAUGAAUUUACCAUCAAACAAAUCAUUUUGAUGUAUUAUUAUAUAUGUAUAUCUGUGUAAGACACGUGCAACAGACUGCCUUAUAUUAUUUUCUGUAAUUCUUCUCCUUUGUCAAAUGGUAUUUUUUGUGAAUGGUUGCAAAGUGUUGUCUUAUUCCUAAUUCCUGUAUGUUAUCCACUACAGGUUUUAUGAGACUUCCUAUUAAUUUAUUAAAUUUAUUAAAUGUUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1389.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1482.31
Frequency: 0.0000
Diversity: 996.66
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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