Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001256802.2
Sequence Length
1341 nt
GC Content
0.4952
CCUUUCCUUUCAGCGGAGCGCGGCGGCAAGAUGGCAGUGCAAAUAUCCAAGAAGAGGAAGUUUGUCGCUGAUGGCAUCUUCAAAGCUGAACUGAAUGAGUUUCUUACUCGGGAGCUGGCUGAAGAUGGCUACUCUGGAGUUGAGGUGCGAGUUACACCAACCAGGACAGAAAUCAUUAUCUUAGCCACCAGAACACAGAAUGUUCUUGGUGAGAAGGGCCGGCGGAUUCGGGAACUGACUGCUGUAGUUCAGAAGAGGUUUGGCUUUCCAGAGGGCAGUGUAGAGCUUUAUGCUGAAAAGGUGGCCACUAGAGGUCUGUGUGCCAUUGCCCAGGCAGAGUCUCUGCGUUACAAACUCCUAGGAGGGCUUGCUGUGCGGAGGGCCUGCUAUGGUGUGCUGCGGUUCAUCAUGGAGAGUGGGGCCAAAGGCUGCGAGGUUGUGGUGUCUGGGAAACUCCGAGGACAGAGGGCUAAAUCCAUGAAGUUUGUGGAUGGCCUGAUGAUCCACAGCGGAGACCCUGUUAACUACUACGUUGACACUGCUGUGCGCCACGUGUUGCUCAGACAGGGUGUGCUGGGCAUCAAGGUGAAGAUCAUGCUGCCCUGGGACCCAACUGGUAAGAUUGGCCCUAAGAAGCCCCUGCCUGACCACGUGAGCAUUGUGGAACCCAAAGAUGAGAUACUGCCCACCACCCCCAUCUCAGAACAGAAGGGUGGGAAGCCAGAGCCGCCUGCCAUGCCCCAGCCAGUCCCCACAGCAUAACAGCCUCUUCCAUGAGUGGGGAGCCCGCUGCUUGUCUCCAGCUCCUAGCAGUGAGUCCUGAUAAUCUCAAAUUUAAGGACAGUAACUUUGUCUGGGAUGAGUGUGGGAAAGGAUGUGUUUGGGAACAGACGCGAGCCUGCAGAGGUGUUUGUAACCAUCUCUUUCUAAGUGGUGGGAAGCAGACAUUUUAUUCUUUAACUGUUAAUAUAUAUAGUGUGUGUUUUUUAUGCAUGAAAUAUUUUAUAGUUUUUAAAAAUGCCCACACUACUAUUUUGAAAGUAAAUGAGGUAAUGUAUGUGUCAGAACCCAAUACCCAAAGCGAUCGUAGUAAGAGGUGGGGCCUUUGGGAAGGCAUUAAAUUGCUUAGGGAAUGAGGGUGGAACCCUCAUGAAUGAGAUUAGAGCCUUAUAGGAGAGGUUGGAGGGAGUUGCCUGGCCUCCCUCUCCCAUGUGAAGACUCAGCAAGAAAACAUUAUUUAGGAAGCAGAGAGCCCUCAUCAAACACCAGAUCUGCUGGCCACCUGAUCUGGCACUUUCCAGCCUUCAGAACUGUGAGAAAUAAAUUUCUGUUGUCUAUAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-472.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -495.17
Frequency: 0.0000
Diversity: 286.23
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..........((((((((..((((...((((((.((((((((((.(((.......))).))))).)))...)).))))))....))))..))((((..(((((((((((.((((.(((((......))))))))).))(((((((((.((......((.....)).......))..)))))))))((((((((((.....))))).))))).....((((((((((((.((((((((.(....))))))).(.((((......)))).).((((((...(((((((((..((((.....(((((((((.((....))))).)))))).....))))))).))))))(((((((((.(((..(.((((((((((((.(((.(((((.((((((((.((....)).))))))))))..((((((...((((.((..((((((((((((((((...(((((.(((((..(((((..((((((((...)))))))))))))..)).)))....))))).)))(((((((......)))))))((((.((((..((((((..(.((((.(((((...((((((((.((.(((....))).)).))))).(((..((((((....)).))))))).....)))))))).))))))))))).)))).))))............)))))))))...((((((...(((......))).))))))..))))...)).)))).....)))))))))..))).)))))).......(((.((((((.((((((...))))))(((((((.((((..(..((......(((((................))))).....))..).))))))))))))))))).)))..(((((((....))))))))))))).)..))).)))))))))..(((((((((((((((((.((.(((.(((((...(((.((.(((.((((.(((..(((((((.((((((((.(((((((....))))).))...)))))).)).))))))).))).)))).))).)).)))..))))).))).))....(((....(((((((.(.((.((........)).)))))))))).(((((......))))).))).((((((((...))))))))...........((((.((((((((((((..((.(((.....)))..))..)))))))..))))).).)))..........)))))))))))))).)))..))))))........)).))))))))))))..((((...(((........))).))))....)))))))))..))))))))))........
Thermodynamic Ensemble Prediction
....,{,.,,{{{{|,|{,,({{{.|}((((((.((((((((((.(((.......))).))))).)))}..,}.))))))....))))|,||||{{,,{{.(({{((((.((((.(((((......))))))))).)))},)}||{|,..,,,.}}}}....{,{((((((((...,.(((({.,((((((((((.....)))))}})))).....((((((((((((.(((((((,{(,.,,|}}}}}).{,{{{{{{..,{||||||.((((((...(((((((((..((((.....(((((((((.((....))))).)))))).....))))))).))))))(((((((((.(((..{.((((((((((((.(((.(((((.((((((((.((....)).))))))))))..((((((...((((.((..((((((((((((((((...(((((.(((((..(((((,.,(((((({...}))))))))))))..)).)))....))))).)))(((((((......)))))))((((.((((..((((((..{.((((.(((((.,{,(((((((.((.(((....))).)).))))).(((..((((((....)).)))))))..,,.,))))))).))))})))))).)))).))))............)))))))))...((((((...(((......))).)))))),.})))...)).)))).....)))))))))..))).))))))}......|((|{{(({,.{{{{{|,,,|}|||}(((((((.((((,....||,|||..(((((,...,.......,},.})))}.....},,,),))))))))))))))))}.}}}.,(((((((....))))))))))))).)..))).)))))))))..(((((((((((((((((.({.(((.(((({.,,(((,((,(((.((((.{((..(((((((.(({((({{.(((((({....})))).))...}))))).}).))))))).))}.)))).))).,,,))),.))))}.})).))....{{|,...(((({{{,,.((.{{.,....,.)),)}}}}))))){((((,,{,...},|||{....((((((((...))))))))...}}}}.,},|,|}}||,,.(((((((..((,(({.....)))..))..)))))))..|||||.,.,)),.},......)))))))))))))).))),.))))))........)).))))))))))))..((((.{{(({.....,,,)}}.)))).....))))).,,..))))))))).,.......
Back