Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001260511.2

Sequence Length

918 nt

GC Content

0.3867

AGUCCCUGCAUUGCGCGCGACCCGGCGGCGGGACAGGCUUGCUGCUUCCUCCUCCUCGGCCUCACCACCAAAAUUGAAAAAAUGGUUGACCUCACCCAGGUAAUGGAUGAUGAAGUAUUCAUGGCUUUUGCAUCCUAUGCAACAAUUAUUCUUUCAAAAAUGAUGCUUAUGAGUACUGCAACUGCAUUCUAUAGAUUGACAAGAAAGGUUUUUGCCAAUCCAGAAGACUGUGUAGCAUUUGGCAAAGGAGAAAAUGCCAAGAAGUAUCUUCGAACAGAUGACAGAGUAGAACGUGUACGCAGAGCCCACCUGAAUGACCUUGAAAAUAUUAUUCCAUUUCUUGGAAUUGGCCUCCUGUAUUCCUUGAGUGGUCCCGACCCCUCUACAGCCAUCCUGCACUUCAGACUAUUUGUCGGAGCACGGAUCUACCACACCAUUGCAUAUUUGACACCCCUUCCCCAGCCAAAUAGAGCUUUGAGUUUUUUUGUUGGAUAUGGAGUUACUCUUUCCAUGGCUUACAGGUUGCUGAAAAGUAAAUUGUACCUGUAAAGAAAAUCAUACAACUCAGCAUCCAGUUGGCUUUUUAAGAAUUCUGUACUUCCAAUUUAUAAUGAAUACUUUCUUAGAUUUUAGGUAGGAGGGGAGCAGAGGAAUUAUGAACUGGGGUAAACCCAUUUUGAAUAUUAGCAUUGCCAAUAUCCUGUAUUCUUGUUUUACAUUUGGAUUAGAAAUUUAACAUAGUAAUUCUUAAGUCUUUUGUCUGAUUUUUAAAGUACUUUCUUAUAAAUUUGGAUCAUGUUAUGAUUUGUAACAUUCACACAACACCUCACUUUUGAAUCUAUAAAAGAAUUGCACGUAUGAGAAACCUAUAUUUCAAUACUGCUGAAACAGACAUGAAAUAAAGAAUUUAAAGAAUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-205.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -223.80

Frequency: 0.0000

Diversity: 287.33

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((((......((.(((......)))))))))).(((.(((((.((((((((((((..(((.(((.......((((((.((((((((((((.....))))...(((((..(((((.......)))))..))))).......)))))))).))))))....((((((...((((.(((((.(.(..((((...(((((.((((((...)))))).))))).))))..).))))))...((((((..........))))))((((.....(((((..((((.....(((((.(((((.((((((......(((((((..............((((((.....))))))((((....((((......(((.(((....))).))))))))))).....)).)))))....)))).))..)))))..))))).....)))).....))))).....)))).(((((.(((.((((((...)))))))))))))).(((((((.......)))))))..((((((((((((....))))......)))))))).............)))))))))).((((((.......((....))......))))))......(((....)))..........)))))).))))))..))))))....(((.((((.....)))).)))......)))))..)))......((..((((((((((((..((((((((..(((((((....((((......(((((........)))))......))))......))))))).))))(((((((.....)))))))...............((((((......))))))....(((.((((((((........)))).))))))).....))))..)))))).))))))....)).....

Thermodynamic Ensemble Prediction

.(((((.{{...{(,({{......)))))))))).(((.(((((.{(((((((((((..(((.(((,,{{...,{,,,..,,||||{{,,,{{,.,,|,||,,|((,{{.,(,((({({{{{{{|,,|((({|...})))},.,||||||.,,,,,..,}}}|||||,}}}}}}}}|{{,.({(({((((...(((((.((((({...}))))).))))).},,)}}..)))))),.,((((({..........}))))}{,,{|||||||....}||||...,.(((((.(((({.,(((({,.....{{{,,,,..............((((((.....)))))){(({...,((((......(((.(((....))).))))))))}}}..|,}}..|||,|{{..,,,)}))}})))))..))))),...,}}))}|...,,}},.....,,,,.{{((({(({.{(((({..,||}}}},}}}}}}|.{((((((.......))))))}.{((((((({((((....}}}}......})))))}},,....,,..,},}})))))}}),.})}))}}.{{{{(({{,,|,{{{..,,...........}}}}.,.}))))))).....)))))).))))))..)))))}....{({.((((.....)))).))}......)))))..)))....,.{{,.((((((((((((..((((,,(({{,,,,,,.....,{{{{{{{{{{{{((,,,,{{,,|||||,.,{{{,,,,..,},.,}},,}||||,.(((((((.....)))))))..............,{||,||,.,...,}})))},,,||{.((((((((........)))),})))}})}})..))))..))))))}))))))....}),,,..