Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001260512.2

Sequence Length

1069 nt

GC Content

0.3817

AGUCCCUGCAUUGCGCGCGACCCGGCGGCGGGACAGGCUUGCUGCUUCCUCCUCCUCGGCCUCACCAUUCCAGACCAAAAUUGAAAAAAUGGUUGACCUCACCCAGGUAAUGGAUGAUGAAGUAUUCAUGGCUUUUGCAUCCUAUGCAACAAUUAUUCUUUCAAAAAUGAUGCUUAUGAGUACUGCAACUGCAUUCUAUAGAUUGACAAGAAAGGUUUUUGCCAAUCCAGAAGACUGUGUAGCAUUUGGCAAAGGAGAAAAUGCCAAGAAGUAUCUUCGAACAGAUGACAGAGUAGAACGUGUACGCAGUCAUUGUAAAGCUGUUACGAUUAGCAUAUUUGAACGGCAGAGCCAGAAUGGGGCUACAAAUGAAGUGAAAAGUAUGCUUUACCGUGUGCAACAAUUGUGAAAGUUAAUACAUACACAUAUGGAACAAUUAACUAAAAACUUAAGAGCCCACCUGAAUGACCUUGAAAAUAUUAUUCCAUUUCUUGGAAUUGGCCUCCUGUAUUCCUUGAGUGGUCCCGACCCCUCUACAGCCAUCCUGCACUUCAGACUAUUUGUCGGAGCACGGAUCUACCACACCAUUGCAUAUUUGACACCCCUUCCCCAGCCAAAUAGAGCUUUGAGUUUUUUUGUUGGAUAUGGAGUUACUCUUUCCAUGGCUUACAGGUUGCUGAAAAGUAAAUUGUACCUGUAAAGAAAAUCAUACAACUCAGCAUCCAGUUGGCUUUUUAAGAAUUCUGUACUUCCAAUUUAUAAUGAAUACUUUCUUAGAUUUUAGGUAGGAGGGGAGCAGAGGAAUUAUGAACUGGGGUAAACCCAUUUUGAAUAUUAGCAUUGCCAAUAUCCUGUAUUCUUGUUUUACAUUUGGAUUAGAAAUUUAACAUAGUAAUUCUUAAGUCUUUUGUCUGAUUUUUAAAGUACUUUCUUAUAAAUUUGGAUCAUGUUAUGAUUUGUAACAUUCACACAACACCUCACUUUUGAAUCUAUAAAAGAAUUGCACGUAUGAGAAACCUAUAUUUCAAUACUGCUGAAACAGACAUGAAAUAAAGAAUUUAAAGAAUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-239.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -263.40

Frequency: 0.0000

Diversity: 269.03

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((((......((.(((......)))))))))).(((.(((((.((((((((((((..(((.(((..............((((((.((((((((((((.....))))...(((((..(((((.......)))))..))))).......)))))))).)))))).((((((((.((((.((.((((..(((((((((...(((((.((((((...)))))).)))))....)))..))))))((((((.....(((((...(((......))))))))...)))))).....)))).)).)))).))).))))).....((((((.(((.........))))))))).(((((((..(((((((.........(((..((((((((..(...(((((.............(((((((.....((....)).....)))))))..........(((.(((......................((((((.....))))))))).)))(((((......(((.(((....))).))))))))..(((((((...((.(((.....))).))))).))))....))))).)..))))))))..))).......(((((.(((.((((((...)))))))))))))).(((((((.......)))))))..((((((((((((....))))......)))))))).................))).)))).)))))))((((((((....(((.(((...........)))))).)))))))).....)))))).))))))..))))))....(((.((((.....)))).)))......)))))..)))......((..((((((((((((..((((((((..(((((((....((((......(((((........)))))......))))......))))))).))))(((((((.....)))))))...............((((((......))))))....(((.((((((((........)))).))))))).....))))..)))))).))))))....)).....

Thermodynamic Ensemble Prediction

.(((((.({...{(,({{......)))))))))).(((.(((((,{(((((((((({.,(((.(((,.,,{,{((({...,,.....,.))))}|,,,({{.{{|,,,..))),))},|.((((((((((((..((((((...)))))}..{(((((........}))))}))},))))))))}{{..,.||{((((...(((((.((((({...}))))).))))).)}})|{{{||||||{{{((((((..........)))))){,,{,,{||}}..,,|||||{|...{{,....,),)))})}))),,,,,...((((((.(((.......,.))))))))),(((((((..(((((((......{,.(((..((((((((..,...(((((.......,|{,..(((((({.,.,.{,....)).....}))))))......,{,{(,{.,{,.......,..}}},,.......((((((.....))))))|||,,,,{((((......(((.(((....))).))))))))}}{((((((.,{((.(((.....)))}))))).)))}....))))).,..))))))))..))).......(((({,(((.((((((...)))))))))))))).(((((((.......))))))).,((((((((((((....))))......)))))))).,.....,.........))).)))).)))))))|{((((((,,,.{{{.,,,...........)))},,.}))))))}.....)))))),)))))),.))))}|.,..(({.((((.....)))).})}..,,..}))))..)))...,,.{{,.((((((((((({..((((,,(({{,,,,,,,....,{{{{{{{{{{{{((,,,,{{,,|||||,.,{{{,,....}},.,}},,}|{||,.(((((((.....)))))))..............,{{{{||,.....,}})))},,,||{.((((((((........)))),})))}})}})..))))..))))))}))))))....}),,,..