Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001261422.2

Sequence Length

2361 nt

GC Content

0.5413

AGAUUCUCUGCAUAAGAAGGGGAACGAAAGAUGGCGGCGGAAACGCUGCUGUCCAGUUUGUUAGGACUGCUGCUUCUGGGACUCCUGUUACCCGCAAGUCUGACCGGCGGUGUCGGGAGCCUGAACCUGGAGGAGCUGAGUGAGAUGCGUUAUGGGAUCGAGAUCCUGCCGUUGCCUGUCAUGGGAGGGCAGAGCCAAUCUUCGGACGUGGUGAUUGUCUCCUCUAAGUACAAACAGCGCUAUGAGUGUCGCCUGCCAGCUGGAGCUAUUCACUUCCAGCGUGAAAGGGAGGAGGAAACACCUGCUUACCAAGGGCCUGGGAUCCCUGAGUUGUUGAGCCCAAUGAGAGAUGCUCCCUGCUUGCUGAAGACAAAGGACUGGUGGACAUAUGAAUUCUGUUAUGGACGCCACAUCCAGCAAUACCACAUGGAAGAUUCAGAGAUCAAAGGUGAAUUCCUCUGUGACGAGGGUGCAGGUAUCUCUGGGGACUACAUCGAUCGCGUGGACGAGCCCUUGUCCUGCUCUUAUGUGCUGACCAUUCGCACUCCUCGGCUCUGCCCCCACCCUCUCCUCCGGCCCCCACCCAGUGCUGCACCGCAGGCCAUCCUCUGUCACCCUUCCCUACAGCCUGAGGAGUACAUGGCCUACGUUCAGAGGCAAGCCGACUCAAAGCAGUAUGGAGAUAAAAUCAUAGAGGAGCUGCAAGAUCUAGGCCCCCAAGUGUGGAGUGAGACCAAGUCUGGGGUGGCACCCCAAAAGAUGGCAGGUGCGAGCCCGACCAAGGAUGACAGUAAGGACUCAGAUUUCUGGAAGAUGCUUAAUGAGCCAGAGGACCAGGCCCCAGGAGGGGAGGAGGUGCCGGCUGAGGAGCAGGACCCAAGCCCUGAGGCAGCAGAUUCAGCUUCUGGUGCUCCCAAUGAUUUUCAGAACAACGUGCAGGUCAAAGUCAUUCGAAGCCCUGCGGAUUUGAUUCGAUUCAUAGAGGAGCUGAAAGGUGGAACAAAAAAGGGGAAGCCAAAUAUAGGCCAAGAGCAGCCUGUGGAUGAUGCUGCAGAAGUCCCUCAGAGGGAACCAGAGAAGGAAAGGGGUGAUCCAGAACGGCAGAGAGAGAUGGAAGAAGAGGAGGAUGAGGAUGAGGAUGAGGAUGAAGAUGAGGAUGAACGGCAGUUACUGGGAGAAUUUGAGAAGGAACUGGAAGGGAUCCUGCUUCCGUCAGACCGAGACCGGCUCCGUUCGGAGGUGAAGGCUGGCAUGGAGCGGGAACUGGAAAACAUCAUCCAGGAGACAGAGAAAGAGCUGGACCCAGAUGGGCUGAAGAAGGAGUCAGAGCGGGAUCGGGCAAUGCUGGCUCUCACAUCCACUCUCAACAAACUCAUCAAAAGACUGGAGGAAAAACAGAGUCCAGAGCUGGUGAAGAAGCACAAGAAAAAGAGGGUUGUCCCCAAAAAGCCUCCCCCAUCACCCCAACCUACAGGGAAAAUUGAGAUCAAAAUUGUCCGCCCAUGGGCUGAAGGGACUGAAGAGGGUGCACGUUGGCUGACUGAUGAGGACACGAGAAACCUCAAGGAGAUCUUCUUCAAUAUCUUGGUGCCGGGAGCUGAAGAGGCCCAGAAGGAACGCCAGCGGCAGAAAGAGCUGGAGAGCAAUUACCGCCGGGUGUGGGGCUCUCCAGGUGGGGAGGGCACAGGGGACCUGGACGAAUUUGACUUCUGAGACCAACACUACACUUGACCCUUCACGGAAUCCAGACUCUUCCUGGACUGGCUUGCCUCCUCCCCACCUCCCCACCCUGGAACCCCUGAGGGCCAAACAGCAGAGUGGAGCUGAGCUGUGGACCUCUCGGGCAACUCUGUGGGUGUGGGGGCCCUGGGUGAAUGCUGCUGCCCCUGCUGGCAGCCACCUUGAGACCUCACCGGGCCUGUGAUAUUUGCUCUCCUGAACUCUCACUCAAUCCUCUUCCUCUCCUCUGUGGCUUUUCCUGUUAUUGUCCCCUAAUGAUAGGAUAUUCCCUGCUGCCUACCUGGAGAUUCAGUAGGAUCUUUUGAGUGGAGGUGGGUAGAGAGAGCAAGGAGGGCAGGACACUUAGCAGGCACUGAGCAAGCAGGCCCCCACCUGCCCUUAGUGAUGUUUGGAGUCGUUUUACCCUCUUCUAUUGAAUUGCCUUGGGAUUUCCUUCUCCCUUUCCCUGCCCACCCUGUCCCCUACAAUUUGUGCUUCUGAGUUGAGGAGCCUUCACCUCUGUUGCUGAGGAAAUGGUAGAAUGCUGCCUAUCACCUCCAGCACAAUCCCAGUGAAAAAGGUGUGAAGCACCCACCAUGUUCUUGAACAAUCAGGUUUCUAAAUAAACAACUGGACCAUCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-849.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -889.65

Frequency: 0.0000

Diversity: 650.40

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

...((((((........))))))......((((((((((....)))))).((((((((.(((..(((.((((((..(.(((((..(((.....)))))))).)..)))))))))((((((((((......(((((((((((.((((.(((...(((.(((((((((((((((((.(((((((((((((((.(..((..(((((((.(.(((((.((.((((((((...........(((((...)))))..(((..(((((((((........))))))).))..)))(((.(((.....))).))).....((((((((..((((((..(((((((((....(.((((((.((...(.(((((((............(((((..((((..........))))..)))))(((((.......((((((........(..(((((...(((....((((((((((.(((((((..((((...(((((((...........(((.((((((....)))))))))......((((.((....)))))))))))))...))))..)))))))..((((((......))..(((((((..((.(((((((.((((.(((..((.......))..)))))))...))))))).))....(((.........)))...)))))))))))......)))))))))))))....)))))..).......))))))....((((...))))(((.(.((((((((.....)))..))))).).)))......))))).))))))).)...)))))))).).....)))))))))..))).)))))))))))..)))))))).))..)))))))))))))...))..)...)))))..((((.((((.......)))).))))))).))))....)))..))))).))))).....)))..))))..))).))).)))).))))).(((((.(.(((((((..(((((..(((((..((((((.(((.......)))...(((..((((((((......))))))..))..)))..((((((...((((((((((((((((((.((...(.((((((.((((.((((((.((.(((((.(((..(.((((.(((.(.......(((((.(...(.(((((...((((((.((((.((.....(((((((((.(((((((((.(((((.((.....((.((((....)))).))..)))))))..))))))))).(((((........)))))...........((..((((((...((((((.((.(((.(((((.(((((.((...........)).))))).)).)))..)))...))..))))))......(((.........))).))))))..))(((..(((((..((((.......(((...(((((.....((((.((((((...(((...((.((((((.((((........)))).)))(((....)))........))).)).)))(((.((((((((..((..((.((....(((....)))........((((((((...(((((....)))))..))))))))))))..))..).)))))))))).......(((((((((...((((....))))....))))))))))))))).))))...)))))))).......)))).)))))...)))..............)))))).)))..)))))).))))))..))))).)...).)))))(((((...(((((...(((...((((((((((..(((((..(((...)))..))))))).)).))))))....)))))))).)))))(((((..(((((...((((((((......)))))).......))...)))))))))).........).))))))).).))))).)))..)).)))))))))))))))).)....(((((((((((.....)))))))))))..(((.((.((((((((((((((((((....)))))))).......)))))))))))).)))..(((((((.(((((((((((((..(((((((...(((((......))))).))))))).))))..)))).))))).)))))))....)).))))))))....))))))))))...))))))..........))))))....)))))((((((......)))))).....((((.......))))....(((((....)))))...))))).))))....)))).)))))...(((((...)))))......))))))......)))))))))).....)))))))))))))))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

.,.((((((........)))))).,....((((((((((....)))))),((((((((((((..(({.((({((,,(,(({((,,((,.,,,,||,,||}}.),.}))))))})||||||||{{..,.},||{|||(((((.((((.(((...(((.(((((({((((((((((.((((((((((((.((((((({((((.{({....}||,|}}}}{((((((....,.....|.(((({...})))).,{((..({(((((((........))))))).))..)))))))))|.....,|((((..({.(((((.((((.{,((((.((((.(((((((...{(((,,(((.((((,,(((((,........(((.(((((..((((..........))))..)))))..)))))))}...((((.(({.,{((((...........)))))))),.))))...)))).))),,,,))))},))).)}.)).))}}.(((.((((((....)))))))))......{(((.({....}})))|((((((((,,.((.((,..((((((((((((((....,{,..(((((({{{({{|,{..((((((((.,...{(((,(((.((.({{{,,(......((((.{.....}))))....}..)))}..)).))).))}},.......)))))))))))))....{{{{,{{..,,..}}.))),...,{,{...|||,(((.(.((((((((.....)))..))))).).)))}}}...)).)).))))}.))........{(((((...((.....))...)))))))....))))...)))))))))).)).)).))))))))),))))})))).)))))..)}.))))).,,..))}}))},).))))),})))....)))..))))).))))),,...}}}..))))..))).))).)))).))))}.{||,{.{|{{{|||{..{(((((,{(({,..((((((,(((...,{{{|||.....,..||}}|||,.,,..}|||},|...|{{||,..|||||{...({({(((({{(((({{{{,|{,,.(.((((((.((((.((({{{.({{(((({{((({,,{((((,(((,{.,..,..(((((.(...(.(((((.{.((((((.((((.({.....(((((((((.(((((((((.(((((.((.....((.((((....)))).))..)))))))..))))))))).(((((........)))))......,....,{..(({((({{.{{{{({.({.,{,.(((((.(((((,((,,,.,,...,.)).))))).}).)))..))),..,...)))}}}......((({,.......}}}.})))))..||(((..{({{{|.{{{,.......(({..,(((((.....{(((,(((({(,.{(((,.,({...{(({.{(((........)))).}}},{{..,,)),,,..})).||,..,.}}}|((.((((((({..((..(({((....,,,...})))}.,,....((((((((...(((((....)))))..))))))))}|},..}),.,.)))))))))}.......{((((((((...((((....))))....)))))))))}))))),))}}...)))))))),,,....}})).)))))...}}),.............)))))).)))..)))))).)))))).}))))).).,.).))))){{{{{..,(((((,,.(({..,(({(((((((,.{((((..(((...)))..))))))).)),))))))....))})}))),)})))(((((..(((((..,((((((((......)))))).......})...)))))))))).,.......}.))))))).}.))))).)))..))})))))))))))))))).).,},(((((((((((.....)))))))))))...{{,({.(((((((((({(((((((....)))))))).,.,,..))))))))))}|,|}|,,(((((((.(((((((((((((..(((((((...(((((......))))).))))))).))))..)))).))))).))))))}....,}.,))))))},,,,}))))))))).,,)))})),,,,,,,,,.))))))....}))))((((((......)))))).}}))})},{{,{(((((((..{{(((((....))))).}}..))),}))))}}.,,}}.}}}},...(((({,..}))))}}}}..}})}}}......)))))))))).....)))))))))))})))..