Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001261423.2

Sequence Length

2295 nt

GC Content

0.5434

AGAUUCUCUGCAUAAGAAGGGGAACGAAAGAUGGCGGCGGAAACGCUGCUGUCCAGUUUGUUAGGACUGCUGCUUCUGGGACUCCUGUUACCCGCAAGUCUGACCGGCGGUGUCGGGAGCCUGAACCUGGAGGAGCUGAGUGAGAUGCGUUAUGGGAUCGAGAUCCUGCCGUUGCCUGUCAUGGGAGGGCAGACAAAGGACUGGUGGACAUAUGAAUUCUGUUAUGGACGCCACAUCCAGCAAUACCACAUGGAAGAUUCAGAGAUCAAAGGUGAAGUCCUCUAUCUCGGCUACUACCAAUCAGCCUUCGACUGGGAUGAUGAAACAGCCAAGGCCUCCAAGCAGCAUCGUCUUAAACGCUACCACAGCCAGACCUAUGGCAAUGGGUCCAAGUGCGACCUUAAUGGGAGGCCCCGGGAGGCCGAGGUUCGGUUCCUCUGUGACGAGGGUGCAGGUAUCUCUGGGGACUACAUCGAUCGCGUGGACGAGCCCUUGUCCUGCUCUUAUGUGCUGACCAUUCGCACUCCUCGGCUCUGCCCCCACCCUCUCCUCCGGCCCCCACCCAGUGCUGCACCGCAGGCCAUCCUCUGUCACCCUUCCCUACAGCCUGAGGAGUACAUGGCCUACGUUCAGAGGCAAGCCGACUCAAAGCAGUAUGGAGAUAAAAUCAUAGAGGAGCUGCAAGAUCUAGGCCCCCAAGUGUGGAGUGAGACCAAGUCUGGGGUGGCACCCCAAAAGAUGGCAGGUGCGAGCCCGACCAAGGAUGACAGUAAGGACUCAGAUUUCUGGAAGAUGCUUAAUGAGCCAGAGGACCAGGCCCCAGGAGGGGAGGAGGUGCCGGCUGAGGAGCAGGACCCAAGCCCUGAGGCAGCAGAUUCAGCUUCUGGUGCUCCCAAUGAUUUUCAGAACAACGUGCAGGUCAAAGUCAUUCGAAGCCCUGCGGAUUUGAUUCGAUUCAUAGAGGAGCUGAAAGGUGGAACAAAAAAGGGGAAGCCAAAUAUAGGCCAAGAGCAGCCUGUGGAUGAUGCUGCAGAAGUCCCUCAGAGGGAACCAGAGAAGGAAAGGGGUGAUCCAGAACGGCAGAGAGAGAUGGAAGAAGAGGAGGAUGAGGAUGAGGAUGAGGAUGAAGAUGAGGAUGAACGGCAGUUACUGGGAGAAUUUGAGAAGGAACUGGAAGGGAUCCUGCUUCCGUCAGACCGAGACCGGCUCCGUUCGGAGACAGAGAAAGAGCUGGACCCAGAUGGGCUGAAGAAGGAGUCAGAGCGGGAUCGGGCAAUGCUGGCUCUCACAUCCACUCUCAACAAACUCAUCAAAAGACUGGAGGAAAAACAGAGUCCAGAGCUGGUGAAGAAGCACAAGAAAAAGAGGGUUGUCCCCAAAAAGCCUCCCCCAUCACCCCAACCUACAGGGAAAAUUGAGAUCAAAAUUGUCCGCCCAUGGGCUGAAGGGACUGAAGAGGGUGCACGUUGGCUGACUGAUGAGGACACGAGAAACCUCAAGGAGAUCUUCUUCAAUAUCUUGGUGCCGGGAGCUGAAGAGGCCCAGAAGGAACGCCAGCGGCAGAAAGAGCUGGAGAGCAAUUACCGCCGGGUGUGGGGCUCUCCAGGUGGGGAGGGCACAGGGGACCUGGACGAAUUUGACUUCUGAGACCAACACUACACUUGACCCUUCACGGAAUCCAGACUCUUCCUGGACUGGCUUGCCUCCUCCCCACCUCCCCACCCUGGAACCCCUGAGGGCCAAACAGCAGAGUGGAGCUGAGCUGUGGACCUCUCGGGCAACUCUGUGGGUGUGGGGGCCCUGGGUGAAUGCUGCUGCCCCUGCUGGCAGCCACCUUGAGACCUCACCGGGCCUGUGAUAUUUGCUCUCCUGAACUCUCACUCAAUCCUCUUCCUCUCCUCUGUGGCUUUUCCUGUUAUUGUCCCCUAAUGAUAGGAUAUUCCCUGCUGCCUACCUGGAGAUUCAGUAGGAUCUUUUGAGUGGAGGUGGGUAGAGAGAGCAAGGAGGGCAGGACACUUAGCAGGCACUGAGCAAGCAGGCCCCCACCUGCCCUUAGUGAUGUUUGGAGUCGUUUUACCCUCUUCUAUUGAAUUGCCUUGGGAUUUCCUUCUCCCUUUCCCUGCCCACCCUGUCCCCUACAAUUUGUGCUUCUGAGUUGAGGAGCCUUCACCUCUGUUGCUGAGGAAAUGGUAGAAUGCUGCCUAUCACCUCCAGCACAAUCCCAGUGAAAAAGGUGUGAAGCACCCACCAUGUUCUUGAACAAUCAGGUUUCUAAAUAAACAACUGGACCAUCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-828.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -864.36

Frequency: 0.0000

Diversity: 765.33

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

...((((((........))))))......((((((((((....)))))).((((((((.(((..(((.((((((..(.(((((..(((.....)))))))).)..)))))))))((((((((((......((((((((.(((.(((.(......).)))......(((((.((.((......)))).))))).....(((.(((((..((((..........))))..)))))..)))........(((.(((..((((....))))..(((((((((((((......((((.......((((.(((......))).)))).....))))..(((.((...((((((((((((....((((.(((((((((......))))...((((((....).)))))....(((....)))(((.((((.(((((((((((((((((((.(((((((..((((...(((((((...........(((.((((((....)))))))))......((((.((....)))))))))))))...))))..)))))))..((((((......))..(((((((..((.(((((((.((((.(((..((.......))..)))))))...))))))).))....(((.........)))...)))))))))))......))))))))))))))...))))).)))))))...)))))))))((((...))))(((.(.((((((((.....)))..))))).).)))......(((((((........(((((.....(((....(((((..(.((((.(.(.(((...((((....))))....))).)))))).).)))))....)))....)))))(((.((((.......)))).)))......((((((.((........)).))))))..)))))))..((((((..(((((......)))))....))).)))....(((....(........)...)))....((((((........)))))))))))))))))).)).))).((((((((.(..((((..(((...((((((.........(((((.(.((((.((.....((((((((.(((((.(((((.((((((..((.(((((..((((((.((((.((.((....(((((...(((((.(((.....))).).)))).))))))).))...))))))))))(((((((((......((.((.(((.(.((((((.(((..((.(((((((.(((....((((((.(.(((((((((((((((...........((((((.....(((((............)))))...)))))).................((((((((((.............(((.(((.((((........(((.((((........)))).))).....)))).))).))).....((.((((((.((((((((..((..((.((....(((....)))........((((((((...(((((....)))))..))))))))))))..))..).))))))))).......(((....)))........(((((.((((((......((((((((((((..((((((.((.(((.((.((((..(((((.((....................)).)))))..)))).)).))).)).))..))))..))))))))))))))))))))))).))))))((((.((..(((((..(((...)))..))))))).))))..)))))))))))))))))))))))))..).))...))))....))))).)))))..))..))).)).)).))).))))).))....)))).))))).....)))))))..)))))).)))))))))).........(((((((((((.....)))))))))))...((((..((((((((((((((((((....)))))))).......)))))))))).(((.((((((((((.(((((((((((((..(((((((...(((((......))))).))))))).))))..)))).))))).)))))).........)))))))))))..))))))))))))))))))))))))))....)))....))))).))))))))..)))))..)))))))).(((.(((((((..(((((((....))))).))..))).)))))))...)))))).....(((((...)))))))))).))))))......)))))))))).....)))))))))))))))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

.,.((((((........)))))).,....((((((((((....)))))),(((((((({(((..(((.((((((,.{,(({((,,(({....,||,}}}}}.)..}))))))))|||||(((({...,,,((((((((,(({.(((.(.,...,|,|||..{,{{(((((.((.((......))}),))))).....(((.(((((..((((..........))))..)))))..|||,......,,...})),.|{{|..,,|||}..,{{,,,.||||||,,}}}}((((..,.,,.,{{|,||({{..{{|||,|,,,....,|{{|..((({(({..((((((((((({....{{((.(({{{((((......))))..,((((({....},}}|||....(((...,))}(((.((((.(((((((((((((((((((.(((((((..((((...(((((((.......,...(((.((((((....)))))))))......((((.({....}}))))}))))))...))))..)))))))..((((((......,|,.{((((((..((.((((((({((((,({{..,,.......,}..}))))}}...,)))))).))....({(,,.......)))...)))))))))))......))))))))))))))...))))).)))))))...}})))}}}}||||...{{{,(((.(.((((((((.....)))..))))).).))))}}...}}.},.}|||..},,}|{{{..,|||||...|||||,..|.,|||.},|},||.}}||{{.,.,)))).}}.))),}.))))})})))})}},,,,..,}})}}}||||,|{{,,,|,||||}|},}||{{{{.{(((,,,{{,{{,{{,..{|{{||,|..,|},.,},},.},))}))),,,}}}.))))}.))}}.}})))))}},,,|||||..{,,...,{(({,.{||...,((((((........))))))}}}}}}}))))).....{{{(({,,|||}|.,{,,,..,||...((((((.........(((((.({(((,.(({{({{(.((((((.(((((.((((((((({,{{.,({(((({,,({,({{,{({{.{({((,,..,{((({..{{{.{{({{,,.,.|||||||}}},||||,||.,}.{{{|{|{,,|{|{,,..,,||}...}}|)})|.{{|.,.,||||||{.,..{{{{{|{{{{||||,,,.{{{..,.}},}}))},|},)}}.|}}}},.,,..}}}}}}......(((((............))))).,((,{{{....,,}.,.,,.....{{(({{{..,|,....,}.|}||,(((.(((,((((.,,,...{(({.((((........)))).))).....)))).))}.))).,|,..|,|||(((.(((((((,..((..(({((.....,,...})))}.,,....((((((((...(((((....)))))..))))))))}|},..,),.,.))))))))),......{{{((((((({,,(({,{((,((|(,{(({,||||.(((((((((((({,,{({((.((.(((.((.((((..(((((.({.............,}.....)).)))))..)))).)).))).)).))..)))),.,)))))))))))|||||||||||{..,(({(((((((,.{((((..(((...)))..))))))).)),))))))....)))},)))))}))))},,..|{|{{...|||(((((|...,}.)))))))}})),})).))))))),)))}.)))}}.,}))})))))....))))),))),}))))).))))))))))}..,|,,,.(((((((((((.....)))))))))))...{||(|.(((((((((({(((((((....)))))))),,,,...)))))))))).|{{,({{(((((((.(((((((((((((..(((((((...(((((......))))).))))))).))))..)))).))))).))))))|.....,..})))}}}}}}}.,,,)))))))))))).))))))))))).}}})))....}}))){|||||}}}..,})))))}))}}}}},|{|{(((((((..{{(((((....))))).}}..))),}))))}},}}))}))}},...(((((...)))))))))}.})))}}......)))))))))).....)))))))))))})))..