Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001261835.2
Sequence Length
7671 nt
GC Content
0.6226
AAUUCUGAGGCUCAGCCCUCCUCGGAGCCCACCAUCUCGAGGCUCCUGGACUGUAAGGGACCCCUGCAGUCCCCAGAGCAGAGGCCAGCAGGGGCUGAGACUAUGAGGCAAGCAGCCCAUCGACCCAGGCCUCCUUAGGACCAGCCCAGCCACCCAGCAAGCGAAAGAGCAGCAGCAGAGAGCAGAGCCGGAGAUAAAGGACCACAGCGGACCACUGGGGAUCACCCCCAGCAGCUCCUGAAGCCUCUGGCCGGGCUGAGGGGUUGCGACAGACGGCCAGACCCACAGACACUGACAGACACACAACGACACCGAUGCACACAGCUGCACGACACUGACACACUCAGAUACAACCAGGGACAGCAUCACAUACUGCCACAGCCCUGCAAUACAGACACCCACACACACACACACAAACAACUGGCAACUCUGAAAUGGGCAGACAGUGACACACAGCACCACCCCCCUCAACACACAGAAGUGGGGGCACCCAUCUUCCCAACACAUGAGACAGCAUUGACCUGCACGGACAGACCUGGAGACACACACACGCACCCUCACCCAGGCGCAGCUGUCGGUGGCCUCUGCACAUCCUCCCUACCCCCACAGGGACACCCUCGCUCCUCCACAUACUCGCGCACACACACAGCUACCAGCAAACAUAGCUCACAUACCCCUGGCUCCAGCUCCAGCAGCCCUGGCGCCUUCUGCAGCCUCCUUUGUGGGUGGGGAAGAGCUCAGCCAACCUUGGAUGGAGCGUCGGUGAAGCAAGAGCUCAGAGGGGAGAGGGGCUGGCCUGGCAUGACCCUCGCCAGUCCCCCCACCUGGCUGGGUGAUGUCCCCCGGCCCGGGUUCUGGGGCCCCUUGGCAGUACCAUGGAGCAACUGACAACCCUCCCACGGCCUGGGGACCCUGGAGCCAUGGAGCCAUGGGCACUGCCCACCUGGCAUAGCUGGACUCCAGGUCGAGGGGGUGAACCUAGCAGUGCAGCCCCAAGCAUCGCUGAUACUCCUCCGGCAGCUCUGCAGCUUCAAGAACUGAGGUCUGAGGAGAGUUCCAAGCCCAAAGGAGACGGGAGCUCCAGGCCCGUGGGGGGAACUGACCCUGAAGGAGCAGAGGCUUGUCUGCCCAGCCUGGGCCAGCAAGCAUCCAGCUCUGGACCCGCCUGCCAGAGGCCAGAGGAUGAGGAAGUGGAGGCUUUCCUGAAGGCCAAGCUGAAUAUGAGCUUUGGGGACAGGCCCAAUCUGGAGCUGCUGAGGGCCCUGGGGGAGCUGCGGCAGCGCUGUGCCAUCCUUAAGGAGGAAAACCAGAUGCUGAGGAAGAGCAGCUUCCCUGAGACAGAAGAGAAGGUGCGGAGGCUGAAGAGGAAGAACGCCGAGCUGGCGGUCAUUGCCAAGCGCCUGGAGGAGAGGGCCCGAAAGCUGCAGGAAACGAACCUGAGGGUGGUGAGUGCCCCCUUGCCCCGGCCGGGGACCAGCUUGGAGUUGUGUCGGAAGGCCCUAGCCCGCCAGCGAGCCCGGGACCUCAGUGAGACAGCCAGUGCACUGCUGGCCAAGGACAAGCAGAUUGCUGCCUUGCAGCGGGAGUGCAGGGAGCUGCAGGCCAGGCUCACUCUGGUGGGCAAGGAGGGUCCCCAGUGGCUCCACGUGCGGGACUUCGAUCGGCUGCUGCGCGAGUCCCAGCGGGAGGUGCUGCGGCUGCAGAGGCAGAUCGCGCUGCGCAACCAGCGGGAGACGCUCCCGCUCCCGCCGUCCUGGCCCCCGGGCCCUGCUCUCCAGGCCAGAGCAGGGGCGCCUGCUCCCGGGGCCCCGGGAGAGGCCACGCCCCAGGAGGAUGCGGACAACCUACCCGUGAUUCUAGGGGAGCCAGAGAAAGAGCAGAGGGUGCAGCAGCUGGAAUCGGAGCUCAGCAAGAAGCGGAAGAAAUGCGAGAGCCUGGAGCAGGAAGCCCGGAAAAAGCAGAGGCGAUGUGAGGAGCUGGAACUGCAGCUGAGACAAGCGCAGAAUGAGAAUGCCCGCCUGGUGGAGGAGAACUCCCGGCUCAGUGGGAGAGCCACAGAGAAGGAGCAGGUGGAGUGGGAGAAUGCGGAGCUGAGGGGCCAGCUCCUGGGGGUGACACAGGAGAGGGACUCAGCCCUUCGCAAGAGCCAGGGCCUGCAGAGCAAGCUGGAGAGCCUGGAGCAAGUGCUGAAGCACAUGCGGGAGGUGGCCCAGCGGCGGCAGCAGCUGGAGGUGGAGCAUGAACAGGCUCGGCUCAGCCUACGGGAGAAGCAGGAGGAGGUCCGGAGACUGCAGCAGGCCCAGGCUGAAGCCCAGAGGGAACAUGAAGGAGCCGUGCAGCUGCUGGAGUCUACCUUGGAUUCCAUGCAGGCCCGGGUUCGAGAGCUCGAAGAACAGUGCCGCAGCCAAACCGAGCAGUUCAGCCUCCUGGCACAGGAACUCCAGGCUUUCCGCCUGCACCCGGGCCCCUUGGAUCUGCUCACAUCUGCCCUGGACUGUGGGAGCCUUGGAGACUGCCCACCACCCCCCUGCUGCUGCUCCAUUCCCCAGCCUUGCCGGGGGUCUGGCCCCAAAGACCUUGACCUCCCGCCGGGCUCCCCUGGGCGCUGCACCCCAAAGUCUUCCGAGCCUGCCCCUGCCACUCUCACUGGGGUCCCUCGAAGGACAGCCAAGAAGGCAGAGUCUCUCUCCAACUCCUCCCACUCCGAGUCCAUCCACAACAGCCCCAAGUCAUGCCCUACACCUGAGGUGGACACAGCCAGUGAGGUAGAGGAGCUGGAGGCAGACAGUGUCUCCCUGCUCCCAGCUGCGCCAGAGGGCAGCCGGGGAGGAGCCAGGAUCCAGGUCUUCCUAGCACGUUAUAGCUACAACCCCUUUGAGGGUCCCAAUGAGAAUCCAGAAGCAGAGCUUCCGCUGACAGCUGGCGAGUACAUCUACAUCUAUGGCAACAUGGAUGAGGAUGGCUUUUUUGAAGGAGAGCUCAUGGAUGGCCGAAGGGGCCUGGUCCCUUCCAAUUUUGUAGAGCGUGUGUCGGAUGAUGACCUCCUGACCUCCCUCCCUCCAGAGCUGGCCGAUUUGUCCCACAGCUCAGGCCCUGAACUCAGUUUCCUGAGUGUAGGUGGGGGUGGCAGCAGUAGCGGGGGCCAAAGCAGUGUGGGAAGGAGCCAGCCCAGACCUGAGGAGGAGGAUGCAGGGGACGAGCUCAGUCUGAGCCCAUCACCGGAGGGCCUGGGCGAGCCUCCUGCCGUGCCUUACCCCCGCCGUCUGGUGGUCCUCAAGCAGCUGGCCCACAGCGUGGUGCUGGCCUGGGAGCCGCCUCCUGAGCAAGUGGAGCUACACGGCUUCCAUAUCUGUGUGAAUGGGGAGCUGCGACAGGCCCUGGGGCCUGGGGCGCCACCCAAGGCCGUGCUGGAGAACCUGGACCUGUGGGCCGGGCCCCUUCACAUUUCUGUCCAGGCCCUGACUAGCCGGGGCAGCUCUGACCCACUGCGCUGUUGCUUGGCGGUGGGUGCCCGGGCCGGAGUGGUGCCCAGCCAGCUGCGGGUCCAUCGGUUGACAGCCACAUCUGCUGAGAUCACCUGGGUGCCCGGCAAUAGCAACUUGGCCCAUGCCAUCUACCUCAAUGGGGAAGAGUGCCCACCUGCCAGCCCCAGUACCUACUGGGCCACCUUCUGCCACUUACGGCCUGGCACACCCUAUCAGGCCCAAGUGGAGGCUCAGCUCCCACCCCAAGGGCCCUGGGAACCAGGCUGGGAGAGGCUGGAGCAGCGGGCUGCCACCCUGCAGUUCACCACACUCCCAGCAGGCCCACCUGAUGCCCCUCUGGAUGUGCAGAUCGAGCCUGGGCCCUCCCCUGGGAUCUUGAUCAUCAGUUGGCUCCCAGUCACCAUCGAUGCUGCUGGCACAUCCAACGGUGUCCGGGUCACAGGCUAUGCCAUCUACGCUGAUGGGCAGAAGAUCAUGGAGGUGGCCUCACCCACGGCAGGCAGUGUACUGGUGGAGUUGUCCCAGCUGCAGCUGCUGCAGGUGUGUCGUGAGGUGGUCGUGCGCACCAUGUCGCCCCACGGGGAGUCGGCGGACUCCAUCCCGGCUCCUAUCACUCCCGCCCUGGCUCCGGCCAGCCUGCCAGCCCGAGUCUCCUGCCCCUCACCGCACCCAAGCCCAGAGGCCAGAGCGCCCCUUGCUUCAGCCUCCCCAGGGCCUGGAGACCCCAGCUCUCCUCUCCAGCACCCUGCUCCCCUUGGAACUCAAGAGCCUCCAGGAGCACCCCCUGCAAGCCCUUCCAGAGAGAUGGCAAAAGGGUCCCACGAGGACCCUCCAGCACCUUGCUCCCAGGAGGAGGCUGGGGCAGCAGUGCUGGGCACCUCAGAGGAGAGGACAGCCAGCACAUCUACCCUGGGUGAGAAGGACCCUGGCCCCGCAGCUCCCUCACUGGCCAAGCAGGAGGCCGAGUGGACUGCAGGAGAGGCCUGUCCGGCCUCCAGCUCCACCCAGGGAGCACGGGCCCAGCAGGCGCCAAAUACCGAGAUGUGCCAAGGAGGAGACCCAGGGUCUGGGCUGAGGCCCAGGGCUGAGAAGGAGGACACAGCAGAGCUUGGGGUUCAUCUGGUGAACUCCCUCGUGGACCACGGCCGCAACUCAGACCUGUCAGACAUCCAGGAGGAAGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGCUGGGUUCCAGGACUUGCUCCUUCCAGAAGCAGGUUGCUGGCAACAGCAUCAGGGAGAAUGGGGCCAAGUCCCAGCCCGACCCCUUUUGUGAGACUGACAGCGAUGAGGAGAUCUUGGAGCAGAUCCUGGAGCUGCCCCUCCAGCAGUUCUGUAGCAAGAAGCUCUUUAGCAUCCCGGAGGAGGAGGAAGAGGAAGAGGAGGACGAGGAGGAGGAGAAGUCAGGGGCAGGCUGUUCUUCCCGAGACCCUGGCCCGCCUGAACCUGCAUUGCUGGGGCUGGGCUGUGACAGUGGUCAGCCCCGA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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-3411.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -3541.85
Frequency: 0.0000
Diversity: 2266.11
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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