Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001270468.2
Sequence Length
2581 nt
GC Content
0.4429
GCACUCGCUGCUCCUGGGACCGACGUUUAACUCUUGCCAAGUCUCGUCGCAGCCGCCGCGGCUGGCGGGCCUUGGGCUUCCCCUGAAGCAUGAGCCCUCUCGCCCGCAGCCACCCUCACCGCGUGGCCCGCGGACAGUGCGCGCCGGGGUCCCGGGUGCACAGCCUCAGGAUACCCCGUGCCCGCAGCUCGGGCGCCCGCGGCAGGCGAUCAGUGGGUGACCGCGGCUGCGAGGGACUUUGUCAUCCGUCCUCCAGGAUCUGGGGAGAAAGAGCCCCAUCCCUUCUCUCUCUGCCACCAUUUCGGACACCCCGCAGGGACUCGUUUUGGGAUUCGCACUGACUUCAAGGAAGGACGCGAACCCUUCUCUGACCCCAGCUCGGGCGGCCACCUGUCUUUGCCGCGGUGACCCUUCUCUCAUGACCCUGCGGUGCCUUGAGCCCUCCGGGAAUGGCGGGGAAGGGACGCGGAGCCAGUGGGGGACCGCGGGGUCGGCGGAGGAGCCAUCCCCGCAGGCGGCGCGUCUGGCGAAGGCCCUGCGGGAGCUCGGUCAGACAGGAUGGUACUGGGGAAGUAUGACUGUUAAUGAAGCCAAAGAGAAAUUAAAAGAGGCACCAGAAGGAACUUUCUUGAUUAGAGAUAGCUCGCAUUCAGACUACCUACUAACAAUAUCUGUUAAAACAUCAGCUGGACCAACUAAUCUUCGAAUCGAAUACCAAGACGGAAAAUUCAGAUUGGACUCUAUCAUAUGUGUCAAAUCCAAGCUUAAACAAUUUGACAGUGUGGUUCAUCUGAUCGACUACUAUGUUCAGAUGUGCAAGGAUAAGCGGACAGGUCCAGAAGCCCCCCGGAACGGCACUGUUCACCUUUAUCUGACCAAACCGCUCUACACGUCAGCACCAUCUCUGCAGCAUCUCUGUAGGCUCACCAUUAACAAAUGUACCGGUGCCAUCUGGGGACUGCCUUUACCAACAAGACUAAAAGAUUACUUGGAAGAAUAUAAAUUCCAGGUAUAAAUGUUUCUCUUUUUUUAAACAUGUCUCACAUAGAGUAUCUCCGAAUGCAGCUAUGUAAAAGAGAACCAAAACUUGAGUGCUCUGGAUAACUAUAUGGAAUGCUUUCUAAGAACAGCUGAAGCUAAUCUAAUUUAAAUUUAACAGCUUGAAGAGGUAGCUAGGUGUUUAAAGUUCCUCCAGAUACUUUUACCUGAGUGAUGCUUCCCUUCCUAAGGCUGACCAAGACCUGUUGAUCCUUUUAGAUUAAAAAUAAAAUGUCGCAUGUAAAGGCUGAAGUCGCGUUUUAUCAGAAUGCCUUGCCUUCUUAGGUUCUUUUCCAUUAUGUCAAAGGUCCAGGCUCCAGUAGGAGAGAAAGAACUCCUCAUAGGAAUACUGAAGAAGUGGGAAGGAACCAAGCUGACACAGGCCUCACUGCAAUUUGAUAUGCCUGCUGAUCAGAGUCUCUUGGGCAUUUUAUAUUUUGCAUUCUGAUGUACCUAGGAGUUUUGUUAAACAGAUGAUGUAUGUGAGUAUUUAUCCCAUUUUAUGCAAUUAACCAAAUCAACCAAAAAAAGUGACCAUGAAGUCCUGUAUUUGUCUUUUUACUACAUGUAGGAACUCUCAUGUGAAUGAGUACUGUAGUAAUCCAUUCUAUGGGAGCCUUAUUUCAGAAAUAUUUCAAACUGGUGCAAAUGGAAAAGACUUUCUCUUUUCCUUUAAAGCUAAAGACAAGAAUAUCAUGCUAUACAGGUGCAACUCAAUCCCCGUUAAUAAAAACCAAUGUAGGUAUAGGCAUUCUACCCUUUGAAAUAGCUGUGUCCCAACCUGUUGCCAUUGAUUUUUUGGAAAUGGCUUUAGAAAUAUCCAAGUUGUCCUUGAAUUGUCUAACCAUGGACAUAAACAGUUGUCUCCCUUCUACUGUGUAGAAUACUUUGACUUAAUUUUCUUCCAGAUACAGGGGGAUACCUGCCUGUUUUUCAAAGUGUUUAUUUACUGCUGUUACUAUUUGAUUAGAAUGUAUUAAAUAAAAAAAACCUGAUUUCUACAAGUUGCACUUAUUGAGUUCUAGAGAACGUACACUUUCAUGGUAAUAGAGGAUUGCCAUAAAAACUUACGUCAAGUGAAAUAAGCCAAUUAUUCAACAAAAGGUAGAACAUUACUUGCCAUUCUGUAAAGUUAUGGGCUGUACCUGCCCCCUUUGCAAUUUGGAAAGCAUGGUUUAGAAACUACAGGCAUUGUCAAGUGGCCGGGUCUUUUAUAAUUUGAAUAGGCAUAACACUGAUGUCCUCUGUGUUUCCAAAAACAUGGUUUAGAAACUACAAACAUUAUGACAUGGCCAGUCUUUUACAAGUUGAGUAGGCAUAAUACUAAAGAAAAAUACAAAGUUUUGUGGCCACUUAUUUUUUGCUAUGUUAGUCUGCAUAACUGUUAUAAAUGUACCAUCUUUUCUAGAGUCCAGACAUUAUUUAUUUUAUGGCUUUAAAAUUUUCCUGCAUAGCUACAAUCCUGUGGUGUGUCACCAUAAAGGUGGACCCUGUGUGAAUGAGAAAAUUCAGUUAUAAAUUGUAAUAAAACCUGCUUACUGGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-761.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -807.76
Frequency: 0.0000
Diversity: 526.44
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((.(((((((((..((((((((..(((((((...(((((((((..(((((((((((((.(((((...((((((............))))))....)))))))))).(((((((....(((((((((....((((((.((((....)))))))))).......((((((...((.((((((((((((.(((((((............))))))).))).))))))).)).))...)).))))((((....)))).(((((........)))))((((((((((....((((...(((((((((.(((((((((..((((...((((....(((((...(((.((((((........)))))).)))(((......)))((((...........))))))))).....))))..)))))))))))).)...)).....))))))).))))))))))))))))))).)))))))))))...((((((..(((......)))..))))))..)))))).)).))))).))))...)))))))((.((((((..((((.......((((((((((.((((((..(((((..((((((((((....(((((((...((((((.((.((((.....)))).)).)).).)))...........(((((.....))))).........(((((((.........((.((((((((.((.....))...)))).)))).))....(((((((.((((((((.............))))))))))))))).(((((((...((......)))))))))(((........)))....))))))).....(((((((..(((((((...........(((((...............))))).......(((((((.....))))))).....((((....))))...))))))).)))))))..)))))))...................(((((((((.........))))))))).....))))))))))))))))))...((((((((((.((((......))))..))))))....))))..........(((((.((((((.........(((..(((((....(((((.((..(((((.(((..(((((..........))))).)))))))))).)))))))))))))))))))))))).......))).))))))))))))))....)))))).)).....((((((......)))))).....)))))))).....(((.((.......)).)))(((((((((((..(((((.(((.((((((((((((((...(((....((((((((((....))))..........)))....)))....)))...)))))))))))))))))(((((((((((.(((........)))...))))).)).))))........)))))...........)))))))))))..)))))))))(((((...)))))........))))))((((((..((..(((((((((((((.....(((..((((.(((((.((((((((...(((((((.(((((((((((((.(((......(((((....)))))))))))))))).((((...))))........((((((((....(((((...(((((((..((((((((.....))))))))((((((((((....((((((.((((.((...((((((........................(((......)))...(((((.(((..........)))..)))))...)))))).))...))))))))))....))))))))))......((((.....))))...((((((....))))))...(((((.(........).)))))((((((((((((((...............((.(((((.((....)).))))).)))))))))))(((((((.(((.(((.(((......))))))))).))))))).............)))))...)))))))..))))))))).))))(((((...(((.((((((((.....)))))))).)))...)))))..((((...((.(((...((((((((.....((((((....(((.((((((((((((((....((((.......)))).)))))))......(((.((((.(((.(((((.(((((...(((((.(((.....((((((((.....)))).))))....))))))))...)))))))))).)))..)))).)))..................)).))))).))).))))))..))))))))))).)).))))))))).)))))))...)))))))).))))).)))))))....)))))).))))))).))..))))))...........(((((....(((...(((((((.(((((((((....(((((((((((((((((((.....(((((((...)))))))...))))...)))))))...).))))))).))))))))).)).)))))...)))....)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
..{{{(({.((((((((({{((((((({..(((((((...(((((((((,.((((((((((((,{(((((...((((((........,...))))))....)))))))))).(((((((....(((((((((,.{.((((((.((((....)))))))))).......(({{{{...((.((((((((((((,(((((((.,........,.))))))).))}.))))))).)).))...)).}}}}{(((....)))).(((((........)))))((((((({,{,,{(((((...((((((({{.,((((((((..((((...((((...{({(((...(((.((((((........)))))).))).,,,,,...))|((({...........))))))))).,...))))..)))))))))))).}....,.,...))))))).))))))))))))))))))).)))))))))))...((((((..(((......)))..)))))).})))))).},.}))))}})))...))))))){{.((((((.,((((.......((((((((((.((((({..(({((..{{((((((((....(((((({,,.,,{||..,,}||||{,,,,(((.{,{|||....},|}},,,.}}..{{(({.....})))}......,,,(((((((..,......((.((((((((.((.....))...)))).)))).)}....,{(((({.((((((((.............))))))))))))))}.(((((({..,{,......)}))))))){({..,.....|||,...))))))).....(((((((..(((((((.,,........{((({......,........))))).......|((((((.....))))))).....{{{|....,}})...))))))).)))))))..}))))}}...................(((((((((.........))))))))).....}})))))))}|}}},,}},.,{{{{((((((.((((,.....})))..)))))),..,)))),.,,......(((((.((((((.,,,,...,((({.,,,||}},.(((((.((..{((({,(((..(((((..........))))).)))))))))).))))),}))))}}))))))))))).....,,})).)))))))))))))}..,,)))))).)).....{(((((......)))))}.....})))))))...,,{{{,((....,,,}).}},{((((((((((..(((((.{{{.((((((((((((((...(({....({({{,,(((...{|||{........)))))....)))...,))}...))))))))))))))}}}(((((((((((.(((........)))...))))).)).))))........)))))...........)))))))))))..))))))))),{{{{...}}|}}.,.,|,..}}}}}|((((((..((..(((((((((((((.....(({..((((.(((((.((((((((...(((((((.(((((((((,..,.||||{..((((((((.((((({,(((....))).},})))))))))))).,,,,((((((({....{((({...(((((((..((((((((.....))))))))((((((((((....((((((.((((,(,...((((((,..,,.........{{,.......||,......|||,{{({{,({(........)}}.,.}}))})},,,.)))))).},,,.))))))))))....))))))))))......((((.....))))...{(((({....})))))...{((((.(........}.))))}((((((((((((((..............,|{.(((((.((....)).))))).}}))))))))|(((((((.(((.(((.(((......))))))))).))))))),...........,)))))...)))))))..))))))))}.}}}}{((((...{((.((((((((.....)))))))).))}...)))))..|||}}},||.(((...((((((((.....((((((....(((.((((({{(((((((....((((.......)))).)))))))..,{..(((.((((.{((.(((((.(((((...((((,{(((.....(((({(({.....}))}.))))....))))))))...)))))))))).}))..)))).)))..,,..............)}.))))).))).))))))..)))))))))))........,)))).)))))))..,)))))))).))))).)))))))....)))))).))))))).))..))))))},,,,,,,...{((((....(((...((((({{.(((((((((....,{(((((,{(((((({{{(...,.(((((((...))))))}..})))}...))))))}...),)))}})}.))))))))).}}.)))))...)))....))))}
Back