Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001270533.2

Sequence Length

1488 nt

GC Content

0.4328

CUCCCUCAGCGCCAUUUUGUGGCAGCGAGACCCACAAAUAAAGGGGAGCGCAGGGGUUGCGGCGGGACUAGGAGCGCGGCGGGGCCGGCGGCAGAGCUGUCCGGCUGCGCGGUGGCCCGGGGGGCCCGGGCGGCAGGGCAAGCAGCGCGGCCUCGGCCUAUGCGACCGGUGGCGCCGGCGCGGCUUCUGCCUGGAGAGGAUUCAAGAUGACCAACGAAGAACCUCUUCCCAAGAAGGUUCGAUUGAGUGAAACAGACUUCAAAGUUAUGGCAAGAGAUGAGUUAAUUCUAAGAUGGAAACAAUAUGAAGCAUAUGUACAAGCUUUGGAGGGCAAGUACACAGAUCUUAACUCUAAUGAUGUAACUGGCCUAAGAGAGUCUGAAGAAAAACUAAAGCAACAACAGCAGGAGUCUGCACGCAGGGAAAACAUCCUUGUAAUGCGACUAGCAACCAAGGAACAAGAGAUGCAAGAGUGUACUACUCAAAUCCAGUACCUCAAGCAAGUCCAGCAGCCGAGCGUUGCCCAACUGAGAUCAACAAUGGUAGACCCAGCGAUCAACUUGUUUUUCCUAAAAAUGAAAGGUGAACUGGAACAGACUAAAGACAAACUGGAACAAGCCCAAAAUGAACUGAGUGCCUGGAAGUUUACGCCUGAUAGAGGCCUGAUGGCGUCGGACUAUUCCGAAGAAGUGGCCACCUCCGAAAAAUUCCCCUUCUAGAACAUGUAGACACUUGAGAAAUGUUUCUGUUUGAAGAAAAUAGAGGGAGAAACAGAAGUCUUAAGUCUGUGGCACACUGUGUCUUCAGACAGUUUGAAGGAAUGAAAACCUAGAGAUUUUAAAUCAUGAAUUGAACAUGUAAAAUUCCAGUAAAAUGUAAAAACGGAAUAUGCAUCGCUCUUAACCUUGAGCAUAGUGACUUAGAGACACUGUGUAUCAGUUUUGCCAAUAAGACUGUGGACUUCAUGAUUGUUGUUGAACUUCUGGGUCAAAACUCAAAUGAGGUGAAUUUUGCCUUUAAAGGGUUUAUUUGCUGAGAACCAACUUUCAAUAGUCAUGAGAGAAUCAAAUAAUAGAUGUCCGUACAAGUAGCGCAUAUAUUUAACCAUUUAGUUUGGGGCUCUAUAUUACUUGCUUGAGCCUUAAUCAAUGUGGUUUUAUUCAAUGGUUUGUUCUUUGAAUGGUUGCAAAAACUGUAGAUAAUCUUACUGAGGACUGUACAAACAUGAAGGUGUGGUAUCAAACUUCAGGUUGAAACUGUUUGAAGCAUUAUAAACAUUCAUUUCACAACUAGAUUGUAUAAGGAUAUUAGCUGUGAUGAGACUCACUGCAUUAUUUUUUUUAGUGAAUUUUAUGAAAUCCCCGUUCCAUUCAACAGGCACAUGUUUAAAAGAGCUUUGUCGUUGGUGUUAAUGGGGGAAUGUGUUCCUUCAUUGUAUUUGGGCCUUUUGUAUUGCACUCUUGAUAUUAAAUUAAAUGUGCCUUGAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-429.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -459.57

Frequency: 0.0000

Diversity: 384.89

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((((.(((((((...))))).))))).(((.........))).((.((((((((((((.(((..(((.(..(((((((.((((((((((...)))).)))))).))).((.(((((((...))))))).)).(.((.....)).)(((....)))..))))..)..)))..))).))))))))))))))))))....((((((.........(((((...)))))...(((((((((((...((((((.(((((((...((((((..((((((.((((....(((((...)))))...(((((...)))))((((..((((....))))..))))......)))).))))..))..)))))).........)))))))((((...(((((((........((((((((((.(((((((((((((((((((((...(((.....)))..))))))....((..(((..(((.(((((..........))))))))..)))..))..(((((.....)))))........((((.....(((.....)))..))))....))))))))))...........(((((((....((((((.....((...(((.......)))...)).....)))..)))..)))))))((((.....))))......)))(((((....)))))...(((((((((.................((((.......)))).((((((((..(((((((.(((...........))).)))))))....))))))))..))))).))))(((.(((((((((((((.((...........(((.((.((((.((((((..(..(((((((((..(((((.((...........))))))).))))).((((........))))((((((.((...)).))))))....((((((((....)))))))).((((((((((((((((((((...((((.(((..((((((....(((((((...)))))))....))))))....))).)))).))))....))))))))))))...(((........)))))))........(((.(((..((..((((((.....(((((((((..............))))))))).....))))))..))...)))))).))))..)..))))))..)))).)).))).........((((((..(((((..((((....)))).))).))..)))))).)).))))))))))))))))..............(((((.(((((((.......))).)))).))))))))))))).))))........)))))))...)))).......(((((((....(((((.((((...((((....))))..)))))))))....)))))))...........))))))....))))))))))).....((((..(((((.....)))))..)))))))))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((((.(((((((...))))).))))).(((.........))),((.((((((((((((.(((..(((,{.,(((((((((((({{({{(...(((((((.(((((.(({.{((((...))))))).))))).)))),,)).))))))))))}}))..,))).}}..)))..))).)))))))))))))))))).,..((((((.........{,,(({{{||||,..,|||||||||{,,{{((({{,.{{{|||||,.((((((..(({{{{.{((({{,.{(((,...}))),...{((((...))))}((((..((({....})))..)))),...,.}))),)))}..)).,)))))){||{{{{,.,|}}}||{{(,...(((((((........((((((((((.({,(((({{({,,,(((((((,..{((,,,,,|}}..||||||{,,.({..(((..(((.(((((..........))))))))..))),,|}..(((((.....)))))...,,,..((((.....(((.....)))..))))..,,}))}}|}}}}...,{{{,,.|{{{{{|{|,.{((((((.,{{{(...,(({......,||}...,,..||.|||,.|||.,}||||||((({.....}}}}|,,..}}},{((((....))))}...{({(({{{{....,.....,||.,||{(((.,...,.}||||({{{((((..{{{|{((,{{{........},,))),})))}))...,)))),)))}}))}}},)})}{{{,(((((((((((((.{({{........}||{,(({{{,{,{{(((({,{,.{{,,{{({{..{((((.{,...........}}))))}.})))},((((........}}||((((((.({...}).))))))}}..((((((((....)))))))),((((((((((((((((({{(...((((.(({,{((((((....(((((({...}))))))....)))))}..,,))).)))).}}},...}))))))))))))...{((........)))))))|...,,|.|}}},,,.,||..((((((...{.(((((((((..............))))))))).}...))))))..}}}},}})})}}),))}))}.|}}|||,,|..,.})})}}....,,...((((((..(((((..((((....)))).))).))..)))))).,}.)))))))))))))))}......,.}}}},}|{{{{.{{||{||,|,,,},))).))}},)))),}})))))).))))........}))))))...}}}}......,(((((((.{{.(((((.((((.,.((((....))))..)))))))))}}..)))))))|,,....}}}})))))).,.,))))))),}}}.....((((..(((((.....)))))..)))))))))}.