Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001271611.2

Sequence Length

1157 nt

GC Content

0.6223

GCCCACAACCAAGAUGGCUGAGGAGAGGGCGGAAGUGUCCGCACGUCGGGCCUCCGAGGCUUCUCUUUCUCCCCUGGCGGUCCGGCUCUCGAUGGUGGCGUGACGGGGGCGGGGGUGGCGGCGCGUUCUCCUCGGUUGGGAGGGAACCAGCCCGCGAACCCAGGCCGGGAGGGGGGUUCGGCCUGGGGGGGAAGGGACUGACAUGUCUCUCGAAGACCCCUUUUUUGUAGUCCGAGGCGAGGUGCAGAAGGCGGUGAACACGGCCCGCGGGCUGUACCAGCGCUGGUGCGAGCUCCUGCAGGAAAGCGCGGCGGUCGGACGCGAGGAGCUGGACUGGACGACCAAUGAGCUGCGGAAUGGCCUGCGCAGCAUCGAGUGGGACCUCGAGGACCUGGAAGAGACCAUCGGUAUAGUGGAAGCCAACCCAGGCAAGCCAGCUGCCCAGAAGUCACCCAGCGACCUGCUGGAUGCCAGCGCAGUCUCGGCCACAUCUCGCUACAUCGAGGAGCAGCAGGCCACACAGCAGCUGAUCAUGGAUGAACAGGAUCAACAGCUGGAGAUGGUGUCUGGGAGCAUCCAGGUUCUGAAGCACAUGUCCGGCCGCGUUGGAGAAGAGCUGGACGAGCAGGGCAUCAUGCUGGAUGCCUUCGCCCAAGAGAUGGACCACACCCAGUCCCGCAUGGACGGGGUCCUCAGGAAGUUGGCCAAAGUAUCCCACAUGACGAGUGACCGCCGACAGUGGUGUGCCAUCGCCGUGCUAGUGGGGGUGCUUCUCCUCGUUCUCAUCUUACUAUUCUCUCUCUGACCCCAGCCCUCCCUGGCAGGCUGGUCCCUUAAGCCUGGGGAGCCACCAAGCACUUUGGAGCUGGCCUCGCCCCCUAGGAGGAGAGGGUCCCUCCUGGGUAGCUGGAGAGUAGAGGGUCCCGCCUGGGGAGCUGUCCCCAUGGCUCUCCCCUAGAGCCAGUGGGACCCUUCAGGACCCUGGGCUGGAACCACCACCACUGGUCCUGUCUCAAGUGCACUUAGGGGGUGGUGGAGGCAGGGACACCUGAGACACACCUGUCUCCAUUUCCAGUUCCAGGACCCCAAAGCCAUUUGCCCCUGUGCCUUAUACACGUGCCAACCUGGAAAUAAAAUGUCAGCCUUUUUUAUACGUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-503.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -523.53

Frequency: 0.0000

Diversity: 267.44

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..........((((.((((((.(.....(((((....)))))..((((((((.((.(((.............))))).))))))))..((.(.(((((((((..(((.(((((((((((((.(.(((((((..((((..((((((.((((((..(((((((...((....)).)))))))(((.(((((((..(((.(((.(((.(((((((..(((..(......)..)))))))).)).))))))..((((.((...((((((....))))))..)).)))).((((....(((....)))..)))).((((((((((((.((((.(((((((((((.((((...((((((....((((((((((..(.((((((((.....(((((...(((..(((((....((((...(((..(((......)))...)))..))))..........(((((.....))))).(((....))))))))..)))..))))))))).)))))..)).))))))))....))))))((((.((......)).))))............)))))))))).....))))).))))...))....))))))))))((((((((.(((.(((.(((...(((((((......)))))))))).))).((((((......((((.((((.....)))).)))).....((((...((...(((((((((.(((((((.(((((((((......)))).)...))))))).)..))))))))))))..))...))))))))))......))))))))))))))..))))))).))).)))))))))))).)))).)))))))).))......(((((((((((((((.((((...)).)).))))...((((((((((.(((.((((...(((((((((((.((((((....))))))(((((((.....))))))))))))))))))(((((((...((.(((.....)))))...))))))))))).)))..)))))))))).((((((((((((...............)))))))))))).)))))))))))........)))....)))))))).)))....)))..))).)))).)).......).)))))).))))........

Thermodynamic Ensemble Prediction

..........{(((.((((((.(,,,,,(((((....))))).,((((((((.(({{((............,),))).))))))))}}||..{((({(((((..(((.(((((((((((((.(.(((((((..((((..((((({{((((((.,({({(((,,,((,,..,}.}}}))))|||,|||((((.,(((,({{.{{{,|||||{{..{{|,,|......}..|||||}}|,}},||||||..,(((({,...,|.|})}}}.|||}|||||,,|{{||,|||{.,,||{.||.,,,..}))),{|{{{|||||({,((({{(((({(((({(,,(({...((((((....((((((((((..(.((((((((.....(((((...(((..(((((....((({..,(((..(((......)))...))).}))}).....,....(((((,...,))))).|{|,...)},)))))..)))..))))))))).)))))..)).))))))))..,.))))))((((.((......)).))))....,,,,,,.,|}}|||}|}|,,,,.}}}}}})))).,.)),,,,}))))))})}((((((({{(((.,(({((({.{(((((((......))))))))}}.|},.,,{{,(((({...(((.((((.....))))}))))}},,.{{,,...||,..(((((((((((,.,(((.(((({((((,....,)))).)...))))))).,..))))))))))))..})}}}))),..,,,.......)))))))))))})),,))))))).})).)))))))))))).)))).)))))))).))......{(((((((((({{{(,((((,,,||,||.}}}}..,||||||((((.(({.((((...(((((((((((.((((((....))))))(((((((.....))))))))))))))))))(((((((..,((.(((.....)))))...))))))))))).)))..)))))))))),}(((((((((((...............)))))))))))..))))))))))}........))),...)))))))).)))....))))})))).}},.,,.......,.)))))).)))}........