Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001271821.2
Sequence Length
789 nt
GC Content
0.5792
ACUCUGCUUCUGCCCUUGGCUGGGGAAGGGUGGCAUGGAGCCUCUCCGGCUGCUCAUCUUACUCUUUGUCACAGAGCUGUCCGGAGCCCACAACACCACAGUGUUCCAGGGCGUGGCGGGCCAGUCCCUGCAGGUGUCUUGCCCCUAUGACUCCAUGAAGCACUGGGGGAGGCGCAAGGCCUGGUGCCGCCAGCUGGGAGAGAAGGGCCCAUGCCAGCGUGUGGUCAGCACGCACAACUUGUGGCUGCUGUCCUUCCUGAGGAGGUGGAAUGGGAGCACAGCCAUCACAGACGAUACCCUGGGUGGCACUCUCACCAUUACGCUGCGGAAUCUACAACCCCAUGAUGCGGGUCUCUACCAGUGCCAGAGCCUCCAUGGCAGUGAGGCUGACACCCUCAGGAAGGUCCUGGUGGAGGUGCUGGCAGACCCCCUGGAUCACCGGGAUGCUGGAGAUCUCUGGUUCCCCGGGGAGUCUGAGAGCUUCGAGGAUGCCCAUGUGGAGCACAGCAUCUCCAGGGCUGAGAGACACGUGAAGGAAGAUGAUGGGAGGAAAAGCCCAGGAGAAGUCCCACCAGGGACCAGCCCAGCCUGCAUACUUGCCACUUGGCCACCAGGACUCCUUGUUCUGCUCUGGCAAGAGACUACUCUGCCUGAACACUGCUUCUCCUGGACCCUGGAAGCAGGGACUGGUUGAGGGAGUGGGGAGGUGGUAAGAACACCUGACAACUUCUGAAUAUUGGACAUUUUAAACACUUACAAAUAAAUCCAAGACUGUCAUAUUUAGCUGGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-319.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -331.56
Frequency: 0.0000
Diversity: 244.38
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.((((.(((...))).)))).)))))(((.....)))(((((((((..((.(((((((((((.((((...(.(((((..(((((..(((((....)))))(((((((.(((((((((((.((.(((....(((((.((((..((.((......))))..)))))))))))).)).))))).))))))(((((.(..(......)..).)))))....((.(((((..((((...))))..))))).))(((((((((.((((..(((((((....((((((.(((........)))))))))...))).))))..))))............((((((...)).))))......((((..((..(((.....)))..))..))))....))))))))).)))))))(((((((((((.(((((.((((((...((((((((.......))).)))))...)))))).)))))...((((((.((....))...)))))).))))))))))))))))..).)))))))))..))))).).))))).))..))))..))))).(((((....)))))....(((((.......((((((((((..((..((((((.....)))))).((.((((.(((....))))))).)).((((.((((..((((.(((((....))))).))))..)))).)))))).))))))))))......(((((...(((......((((.(((((((....))).))))...))))))).)))))......))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,{({(((,,,{({,..{{{{{{{,.{,(,((((((((.(((((((((((.((((.....((.....}}....)))).},|}}}}|{{{..,((((....))))|{{.||||.(((((((((((.((.({{..,,(((((.((((..((.{(,...,,,}))..)))))))))))}.)).))))).))))))}}|,|}|.....}))))))))))),).}..((.(((((..((({...})))..))))).)|(((((((((.{(((.,(((((((....((((((.(((........)))))))))..,))).)))),.}}}},.{,........{((({,...,}.)))}.,,...{{{({,{{.,((({{,.,,,,.}})}}))),.,.,))))))))){|||||||((({(((((((.(((((.((((((...((((((((.......))).)})))...)))))).)))))...((((({.((....))...}))))).))))))))||,|||||....,.|,|||........}},,))}}......))))).|||},.{||||,}}})))))}..)))}))).||,..{{{((({{{{,,|{..((((((.....)))))).((.(((,{(((....))))))).)).((((.((((..((((.(((((....))))).))))..)))).))))}}.}))}))))))..,,,,|{{{{.,.{{{,,...{((((.{{(({,......,,.,}}}...)))))}}.)))))..,,,))),)).
Back