Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001271952.2
Sequence Length
1392 nt
GC Content
0.5172
GCGAAGGGGAAGCUACGUCCCGGAGGUGCGGUGUGGGGCACCGGGCGGGGCCGCGGGAACCGGCGCCCCACGGAGCUGCUGCUGUCAGACCAACCCCGGGCCCCCAUCAUCACUGCGCCGCGCUUUCAGGCGCCGAGAACUACCGUUCCCGGCAUGCCAUGAAAUUGGCCUCGGCGCUGAGGCGGGGUCCGGCCCUCCACCCGCUCCCGCCGCGCGCGAAUCGCGGUCGCGAGCCAUGGAGGAGGAGGCAUCGUCCCCGGGGCUGGGCUGCAGCAAGCCGCACCUGGAGAAGCUGACCCUGGGCAUCACGCGCAUCCUAGGACUGUGAAGAUGAUGAGAUACCACACCUUGAUUAUGUUACAUUAAAUGGCAAAAGCAAGAUUAUCCAGAAUCUUCCCCAGGUGUGACUGAGGUGACCAUCAUAGAAAAGCCUCCUGCUGAACGUCAUAUGAUUUCUUCCUGGGAACAAAAGAAUAACUGUGUGAUGCCUGAAGAUGUGAAGAACUUUUACCUGAUGACCAAUGGCUUCCACAUGACAUGGAGUGUGAAGCUGGAUGAGCACAUCAUUCCACUGGGAAGCAUGGCAAUUAACAGCAUCUCAAAACUGACUCAGCUCACCCAGUCUUCCAUGUAUUCACUUCCUAAUGCACCCACUCUGGCAGACCUGGAGGACGAUACACAUGAAGCCAGUGAUGAUCAGCCAGAGAAGCCUCACUUUGACUCUCGCAGUGUGAUAUUUGAGCUGGAUUCAUGCAAUGGCAGUGGGAAAGUUUGCCUUGUCUACAAAAGUGGGAAACCAGCAUUAGCAGAAGACACUGAGAUCUGGUUCCUGGACAGAGCGUUAUACUGGCAUUUUCUCACAGACACCUUUACUGCCUAUUACCGCCUGCUCAUCACCCACCUGGGCCUGCCCCAGUGGCAAUAUGCCUUCACCAGCUAUGGCAUUAGCCCACAGGCCAAGGUAAGGGAGGAACACCUGCCAUUGUAAACUAUGGUAUAUUCCAAAAUCUACUGAGGAAAUGGUUACAUUGCAGGUUCCCAACUUCCCUAUCUGAUUCAGGAGAUCUAGGGUGGGGCCCAGGAACCUGCAUUUUCAAUAAGCAAGACAGAUGAUUCCAAUGGACAGCCUCACUUUACUCAUCUAGUUAAGUGGUUCCCAAACUUGACUGAUUCUCAGAAUUAACUGGGGAGUUUUAUUUUUAAUGAAAUUCUGUUGGAUAGUUUAUGUCCCAUGACUUGUUCUGGGUUGGCAGUACAUGCACCCAGGAAGAGUGAAAAGUCAGAUUCUCACUCCCCUGUUCUCCAAGUGUGCAUCCCCAGUGGCAGCUGCUAUUACGAGUUUCCUGUACGCCCUUCCCAAGAUACUCAUUGCACAUAAAGCAUGCAUGCACA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-476.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -502.48
Frequency: 0.0000
Diversity: 329.46
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((..((((.(.(((...((((((((((((((((.(((((((....))).....)))).)))))))........(((((.(((.(((.(((((((.((((.((.(((..((((((.((((((((((((((.((((....)))).))))..))).))))...)))..))))))))))).))))...(.((((((.((.((((.(((((((.......))))).)).))))...)).))))).).)......))))))).))).)))))))).))))))))))))).))))..))))((((((((((((..(((((((((((.((((((..((.((((......((((.((.(((((.......))))).)).))))..))))))..))))))..)))(((((((.(((((...............))))).........))))))).......)))))))).............))))))))))))......(((((.....)))))(((((.(.((.((((((((((((........)))))(((((((.(((((...(((......(((((.((.((........)))).)))))....)))....))))).)))).)))...((((((..(((((...(((..........))).....)))))..))))))...))))))).)).).))))).(((((........)))))....)))).(((((((...(((((.((...........(((((((((((((..((((((((((........(((((.((((.(((..(((......))).))))))))))))))))))...........)))))))))))............))))))........)).)))))......((((.((((((.....(.(((...(((((............)))))..)))).)))))).)))).(((((((...((((((.(.(((((.((((......((((............))))))))))))).)))))))......)))))))..(((...)))(((((((.(((.(((((.((((((.((........((((((((.((((......(((((((((...................(((((((((.........))))))))).(((((((......)))))))((((((((...))))))))))))))))).......))))...)).))))))(((((...(((.(((.((....((((..((((((.((......)).)))))).)))).....)).))))))...)))))((((....)))).....)).))))))...))))).))).)))).)))))))))).....(((....)))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((,((((..((((.{.(((...((((((((({{({(((.((((({(,.,,||},....)))),)))))})},.,,,.}(((((.(((.(((.(((((((,((((.((.(((..((((((.((((((((((((((.((((....)))).))))..))).))))...)))..))))))))))).)))),,|,.,((((({,,.((((.(((((((.......))))).)).))))..}))})),)},|||....,,))))))).))).)))))))).))))))))))))}.))))..))))((((((((((((..(((((((({{{.((((((..((.((((....,.((((.,{.(((((.......))))).},.)))).,))))))..)))))),,|||{{{{{{|,{{{((,....{{,,,|....||}}}..}.,....))))))).......)))))))).............))))))))))))...,..(((({,...|})}}},(((({(.((.,((((((((,,,....}}}}}||,((((((((.(((((...(((......(((((.((.((........)))).)))))....)))....))))).)))).))))}}{(((((..(((((...{((..,......})}}.....)))))..)))))}{{{|||}|||{||,}.|||||,.,((({.,..,,,,.,,}.,}}))}}.|,{||}}..,|,,||}||.,}}}}}...,(((((((((((((,.{(((((((((........((({{{((((.(((..(((......))).)))))))))))))))))).,,,.......)))}})))))),,,,........}})))).......})),),)))}}}...((((.((((((.....{,(((...(((((............)))))..)))),)))))).)))).(((((((,..((((((,(.((({{{((((......((((....,,....,,))))))))))))).})))))),,,...}})))))..(((...)))(((((((.(((.(((((.((((({.{(((.,,......,,}}|.|,,{{{{{{.{{.{{(((..,,|.,||,,....|,}||,{(((((((|{...||,.}))))))}||,.{{{{|......}))))((((((((({...}))))))))),||,(((((.....))))).,,}|||{{{{(((((,..(((.,,,.||}|},||||..((((((.((......)).)))))).}}}).....}}.)}))))...}}})}||||,,,,))))},..}))}))))))...))))).))).)))).))).,|||,......|||.,,.,))...
Back