Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001271953.2
Sequence Length
1302 nt
GC Content
0.5315
GCGAAGGGGAAGCUACGUCCCGGAGGUGCGGUGUGGGGCACCGGGCGGGGCCGCGGGAACCGGCGCCCCACGGAGCUGCUGCUGUCAGACCAACCCCGGGCCCCCAUCAUCACUGCGCCGCGCUUUCAGGCGCCGAGAACUACCGUUCCCGGCAUGCCAUGAAAUUGGCCUCGGCGCUGAGGCGGGGUCCGGCCCUCCACCCGCUCCCGCCGCGCGCGAAUCGCGGUCGCGAGCCAUGGAGGAGGAGGCAUCGUCCCCGGGGCUGGGCUGCAGCAAGCCGCACCUGGAGAAGCUGACCCUGGGCAUCACGCGCAUCCUAGAAUCUUCCCCAGGUGUGACUGAGGUGACCAUCAUAGAAAAGCCUCCUGCUGAACGUCAUAUGAUUUCUUCCUGGGAACAAAAGAAUAACUGUGUGAUGCCUGAAGAUGUGAAGAACUUUUACCUGAUGACCAAUGGCUUCCACAUGACAUGGAGUGUGAAGCUGGAUGAGCACAUCAUUCCACUGGGAAGCAUGGCAAUUAACAGCAUCUCAAAACUGACUCAGCUCACCCAGUCUUCCAUGUAUUCACUUCCUAAUGCACCCACUCUGGCAGACCUGGAGGACGAUACACAUGAAGCCAGUGAUGAUCAGCCAGAGAAGCCUCACUUUGACUCUCGCAGUGUGAUAUUUGAGCUGGAUUCAUGCAAUGGCAGUGGGAAAGUUUGCCUUGUCUACAAAAGUGGGAAACCAGCAUUAGCAGAAGACACUGAGAUCUGGUUCCUGGACAGAGCGUUAUACUGGCAUUUUCUCACAGACACCUUUACUGCCUAUUACCGCCUGCUCAUCACCCACCUGGGCCUGCCCCAGUGGCAAUAUGCCUUCACCAGCUAUGGCAUUAGCCCACAGGCCAAGGCAUGGGGACUGGCCACAAGCAAAGAGUCAGCAGCAUGAAGCCCCGGAGCUGUAGCGUGUGCAGCAGGCGCCAAUCCAACAGCAUGGGAACAACAGUGUCGCAAUCAUUCCUCAGUUAUGGCAAGAAUGUGCUAUUUUUCACUGUUAGGUGUUGCUUCUGAGAACUACAAAUAAAACUCUCCAACCAAGUGAACAGACUCUCUGCUGGCCAAGGGGACUCCAGAGAACCUUAGAAACUGAGUUUCUGACCAUAACAGGAUGGGAGGUCAGACACACCUCAUCAUACCCCCUCCCUUUUGUGGUUUUAGACACAACAACUGAUCAGCAUUGAUAUUAAAAGAGAGAUCAUAAGACUGACGGAACAACUUUGUGACAAUAAGAUACCAAAUAAUAAACAGGAUCUAAAGCCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-447.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -470.76
Frequency: 0.0000
Diversity: 316.58
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((..((((..((((.(.(((...((((((((((((((((.(((((((....))).....)))).)))))))........(((((.(((.(((.(((((((.((((.((.(((..((((((.((((((((((((((.((((....)))).))))..))).))))...)))..))))))))))).))))...(.((((((.((.((((.(((((((.......))))).)).))))...)).))))).).)......))))))).))).)))))))).))))))))))))).))))..))))((((((((((((...............((((((..........(((((..((((((.........))).)))..)))))..........))))))..............))))))))))))..((((((..............((((..(((...((((((.((.(...(((((((....(((.....)))....)))))))))))))))).)))..))))...)))))).....(((((((.(((...(((((((.(((((((((..(((((...(((..........))).....)))))..))))))......((((.(((((((((((((((.......((((.(((...))).)))).....)))).)))))..)))).)).)))).(((((((((..((((((((((........(((((.((((.(((..(((......))).))))))))))))))))))...........)))))))))))))............(((((......(((((.............(((((.((((..(((((((...)))).......)))..))))...))))))))))..))))))))))))))).....)))...)))))))..((.....))((((..(((((.((((.((...)).)))).......))))).))))........((((((((...((((((((((((((((......))))))......(((((((.(((((..((((((...............(((((......((.(.((((...)))).).))...)))))...((((((..(((((...)))))))))))(((((((.(((..(((.(((..((.........))..))))))..))).)))))))))))))..))))).)))).)))...((((.((......)).))))...)))))).)))).....))))))))...((((.((............))))))...))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
((..((((..((((.{.(((...((((((((({{({(((.((((({(,.,,||},....)))),)))))})},.,,,.}(((((.(((.(((.(((((((,((((.((.(((..((((((.((((((((((((((.((((....)))).))))..))).))))...)))..))))))))))).)))),,|,.,((((({,,.((((.(((((((.......))))).)).))))..}))})),)},|||....,,))))))).))).)))))))).))))))))))))).))))..))))((((((((((((............{({((((((.,.{{...,.(((((..((((((.........))).)))..)))))......,...)))))))}............)))))))))))),.,{{{(({,,.....}},.,.((((..(((.,,((((((.((.,...(((((((,{..(((.....)))....))))))),}})))))).)))..}}},.,.)),)))},...(((((((.(((...(((((({{(({((((((..{{{{{.,,||{.,{{{,,..||||{.,..||}||..}}},|,{{{,,.{(((,({({{(((((({{((,......{{{{.{{{,,,})}.})}}}),,.}))}.)))))..)))),}}.}|||.({(({{{{||,|{||{{||||.,....,,|((,{{((((.(((..(((......))).)))))))))}}}||}|||.{{{..,....||||,},}}},,,............})))...,..,|||||.,,,....||.,|{|(({|{{||..|||(({...{{{{{.......,,,..)))),..)))}})}))),,))))))))))))))).....)))...)))))))..{{.....))((((..(((((.({((,((,..}}.)))).......))))).))))........((((((((...((((((((((((((((......))))))......(((((((.(((((..((((((({(((((({......,,,,,......{{,,.,{{,.,,||||.}|}{,..||))....||||||..{((((,,,|}}}))))))),,,.....,{{,.(((,(((..{,.....,,,.}}..}}))))},)},})))))))))))))..))))).)))).)))...{(({.{{......}}.}))}...)))))).)))).....))))))))...((((.((............))))))...))..
Back