Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001271954.2

Sequence Length

1323 nt

GC Content

0.5253

GCGAAGGGGAAGCUACGUCCCGGAGGUGCGGUGUGGGGCACCGGGCGGGGCCGCGGGAACCGGCGCCCCACGGAGCUGCUGCUGUCAGACCAACCCCGGGCCCCCAUCAUCACUGCGCCGCGCUUUCAGGCGCCGAGAACUACCGUUCCCGGCAUGCCAUGAAAUUGGCCUCGGCGCUGAGGCGGGGUCCGGCCCUCCACCCGCUCCCGCCGCGCGCGAAUCGCGGUCGCGAGCCAUGGAGGAGGAGGCAUCGUCCCCGGGGCUGGGCUGCAGCAAGCCGCACCUGGAGAAGCUGACCCUGGGCAUCACGCGCAUCCUAGAAUCUUCCCCAGGUGUGACUGAGGUGACCAUCAUAGAAAAGCCUCCUGCUGAACGUCAUAUGAUUUCUUCCUGGGAACAAAAGAAUAACUGUGUGAUGCCUGAAGAUGUGAAGAACUUUUACCUGAUGACCAAUGGCUUCCACAUGACAUGGAGUGUGAAGCUGGAUGAGCACAUCAUUCCACUGGGAAGCAUGGCAAUUAACAGCAUCUCAAAACUGACUCAGCUCACCCAGUCUUCCAUGUAUUCACUUCCUAAUGCACCCACUCUGGCAGACCUGGAGGACGAUACACAUGAAGCCAGUGAUGAUCAGCCAGAGAAGCCUCACUUUGACUCUCGCAGUGUGAUAUUUGAGCUGGAUUCAUGCAAUGGCAGUGGGAAAGUUUGCCUUGUCUACAAAAGUGGGAAACCAGCAUUAGCAGAAGACACUGAGAUCUGGUUCCUGGACAGAGCGUUAUACUGGCAUUUUCUCACAGACACCUUUACUGCCUAUUACCGCCUGCUCAUCACCCACCUGGGCCUGCCCCAGUGGCAAUAUGCCUUCACCAGCUAUGGCAUUAGCCCACAGGCCAAGGUAAGGGAGGAACACCUGCCAUUGUAAACUAUGGUAUAUUCCAAAAUCUACUGAGGAAAUGGUUACAUUGCAGGUUCCCAACUUCCCUAUCUGAUUCAGGAGAUCUAGGGUGGGGCCCAGGAACCUGCAUUUUCAAUAAGCAAGACAGAUGAUUCCAAUGGACAGCCUCACUUUACUCAUCUAGUUAAGUGGUUCCCAAACUUGACUGAUUCUCAGAAUUAACUGGGGAGUUUUAUUUUUAAUGAAAUUCUGUUGGAUAGUUUAUGUCCCAUGACUUGUUCUGGGUUGGCAGUACAUGCACCCAGGAAGAGUGAAAAGUCAGAUUCUCACUCCCCUGUUCUCCAAGUGUGCAUCCCCAGUGGCAGCUGCUAUUACGAGUUUCCUGUACGCCCUUCCCAAGAUACUCAUUGCACAUAAAGCAUGCAUGCACA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-460.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -485.79

Frequency: 0.0000

Diversity: 310.65

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((((..((((.(.(((...((((((((((((((((.(((((((....))).....)))).)))))))........(((((.(((.(((.(((((((.((((.((.(((..((((((.((((((((((((((.((((....)))).))))..))).))))...)))..))))))))))).))))...(.((((((.((.((((.(((((((.......))))).)).))))...)).))))).).)......))))))).))).)))))))).))))))))))))).))))..))))((((((((((((...............((((((..........(((((..((((((.........))).)))..)))))..........))))))..............))))))))))))......(((((.....)))))(((((.(.((.((((((((((((........)))))(((((((.(((((...(((......(((((.((.((........)))).)))))....)))....))))).)))).)))...((((((..(((((...(((..........))).....)))))..))))))...))))))).)).).))))).(((((........)))))....)))).(((((((...(((((.((...........(((((((((((((..((((((((((........(((((.((((.(((..(((......))).))))))))))))))))))...........)))))))))))............))))))........)).)))))......((((.((((((.....(.(((...(((((............)))))..)))).)))))).)))).(((((((...((((((.(.(((((.((((......((((............))))))))))))).)))))))......)))))))..(((...)))(((((((.(((.(((((.((((((.((........((((((((.((((......(((((((((...................(((((((((.........))))))))).(((((((......)))))))((((((((...))))))))))))))))).......))))...)).))))))(((((...(((.(((.((....((((..((((((.((......)).)))))).)))).....)).))))))...)))))((((....)))).....)).))))))...))))).))).)))).)))))))))).....(((....)))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((,((((..((((.{.(((...((((((((({{({(((.((((({(,.,,||},....)))),)))))})},.,,,.}(((((.(((.(((.(((((((,((((.((.(((..((((((.((((((((((((((.((((....)))).))))..))).))))...)))..))))))))))).)))),,|,.,((((({,,.((((.(((((((.......))))).)).))))..}))})),)},|||....,,))))))).))).)))))))).))))))))))))}.))))..))))((((((((((((............{({((((((.,.{{...,.(((((..((((((.........))).)))..)))))......,...)))))))}............))))))))))))...,..(((({,...|})}}},(((({(.((.,((((((((,,,....}}}}|||,((((((((.(((((...(((......(((((.((.((........)))).)))))....)))....))))).)))).))))}}{(((((..(((((...{((..,......})}}.....)))))..)))))}{{{|||}|||{||,}.|||||,.,((({.,..,,,,.,,}.,}}))}}.|,{||}}..,|,,||}||.,}}}}}...,(((((((((((((,.{(((((((((........((({{{((((.(((..(((......))).)))))))))))))))))).,,,.......)))}})))))),,,,........}})))).......})),),)))}}}...((((.((((((.....{,(((...(((((............)))))..)))),)))))).)))).(((((((,..((((((,(.((({{{((((......((((....,,....,,))))))))))))).})))))),,,...}})))))..(((...)))(((((((.(((.(((((.((((({.{(((.,,......,,}}|.|,,{{{{{{.{{.{{(((..,,|.,||,,....|,}||,{(((((((|{...||,.}))))))}||,.{{{{|......}))))((((((((({...}))))))))),||,(((((.....))))).,,}|||{{{{(((((,..(((.,,,.||}|},||||..((((((.((......)).)))))).}}}).....}}.)}))))...}}})}||||,,,,))))},..}))}))))))...))))).))).)))).))).,|||,......|||.,,.,))...