Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001276347.2

Sequence Length

1268 nt

GC Content

0.5631

AGUCCCCGCUGAGACUGAGCAGACGCCUCCAGGAUCUGUCGGCAGCUGCUGUUCUGAGGUCACACAGCUCAUGAGGGGUGGAACUAGAUUCACCCUAGGCCUCGCUGAUCUCUGUACAACGGGGGCCAGAGCUCUUCUGAGGAAGGCAGGCUUCCCUUUGUACCUGCACUGACUUUUUUCUCCUUUUGGAGGGAGAGCAGAGACCAUGUCUGACAUAGAAGAGGUGGUGGAAGAGUACGAGGAGGAGGAGCAGGAAGAAGCAGCUGUUGAAGAGCAGGAGGAGGCAGCGGAAGAGGAUGCUGAAGCAGAGGCUGAGACCGAGGAGACCAGGGCAGAAGAAGAUGAAGAAGAAGAGGAAGCAAAGGAGGCUGAAGAUGGCCCAAUGGAGGAGUCCAAACCAAAGCCCAGGUCGUUCAUGCCCAACUUGGUGCCUCCCAAGAUCCCCGAUGGAGAGAGAGUGGACUUUGAUGACAUCCACCGGAAGCGCAUGGAGAAGGACCUGAAUGAGUUGCAGGCGCUGAUCGAGGCUCACUUUGAGAACAGGAAGAAAGAGGAGGAGGAGCUCGUUUCUCUCAAAGACAGGAUCGAGAGACGUCGGGCAGAGCGGGCCGAGCAGCAGCGCAUCCGGAAUGAGCGGGAGAAGGAGCGGCAGAACCGCCUGGCUGAAGAGAGGGCUCGACGAGAGGAGGAGGAGAACAGGAGGAAGGCUGAGGAUGAGGCCCGGAAGAAGAAGGCUUUGUCCAACAUGAUGCAUUUUGGGGGUUACAUCCAGAAGCAGGCCCAGACAGAGCGGAAAAGUGGGAAGAGGCAGACUGAGCGGGAAAAGAAGAAGAAGAUUCUGGCUGAGAGGAGGAAGGUGCUGGCCAUUGACCACCUGAAUGAAGAUCAGCUGAGGGAGAAGGCCAAGGAGCUGUGGCAGAGCAUCUAUAACUUGGAGGCAGAGAAGUUCGACCUGCAGGAGAAGUUCAAGCAGCAGAAAUAUGAGAUCAAUGUUCUCCGAAACAGGAUCAACGAUAACCAGAAAGUCUCCAAGACCCGCGGGAAGGCUAAAGUCACCGGGCGCUGGAAAUAGAGCCUGGCCUCCUUCACCAAAGAUCUGCUCCUCGCUCGCACCUGCCUCCGGCCUGCACUCCCCCAGUUCCCGGGCCCUCCUGGGCACCCCAGGCAGCUCCUGUUUGGAAAUGGGGAGCUGGCCUAGGUGGGAGCCACCACUCCUGCCUGCCCCCACACCCACUCCACACCAGUAAUAAAAAGCCACCACACACUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-448.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -469.08

Frequency: 0.0000

Diversity: 241.30

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((((((((.((.((..((...(.(((((..(.(((.((((((((((((.((((((((((...((.....)).((((((((......)))))))).)))))).(((.(((((((...))))))).))).((((((((..(((((.....)))))((((((((((...(((.((((((.((((....)))))))))))))..(((((.(((........))).)))))...)).)))))))).)))))))).))))..))))))))))))))).).))))).).(((((........)))))..))..)).)).))..)).)).)))....................................((.((((.......((....(((((((((((.......((((.((((.((((.(((((..(((.....(((((.........((((..(..((((....))))..)..))))..(((((.((((.((..(..((.((((......((((.((((((..((((..((..((((((((.......(((((((.........))).))))))))))))..))..)))).)).))))..))))..))))))...)..)))))).))))).......))))))))..).)))))))).)))))))).......)))))).....(((.(((((..(....((.((...(((.((((.(.(((((((.........((((((((........(((.((((((((....).))))))))))......))))))))....((.((((..(((((((.((.(((.((((.............)))).))).)).(((((.(((((((((((.((..((..((((.......))))....))..)).)))))..((((.(.((((((...(((....(((((((((......(((.((((((..((((((..........((......)).........))))))....)))).)))))............)))))))))......(((((((....((...((((((.(((....))).)))))).))))))).))..))))))))).)..)))))))))).)))))...)))).))).)))).)).)))))))))))).))).))))...)..))))).)))((...(((((.((.(((...(((((......)))))...))).)))))))...)).))))).....)).......)))).)).........

Thermodynamic Ensemble Prediction

.,((((((((.{..,{..{{...,.(((((..,.(((.((((((((((((.((((((((((...{{.....}).((((((((......)))))))).)))))).(((.(((((((...))))))).))).((((((((..(((((.....)))))((((((((((.{.(((.(((((((((((....)))))))))))))..(((((.(((........))).)))))...)).)))))))).)))))))).))))..))))))))))))))).}.))))).},|{||{.....{,,|||||..||.{{{{|,...,{{{{(,.{{|(.((((..............................,{.((((......}}}},..((((.,,,|||,......,|}}},|||},{||.,||{,..|||}}}}}}}}|{|,,.{{{,,,,{|,.|..{{,{,,,.}))}.....))))}.(((((.((((.((..,..((.((((......((((.(((({(..((((..((..((((((({......,{{,,((.(((......))).))))))))))))..))..)))).}).))))..))))..))))))...}..)))))).)))))..,.}})))).}}.|,.{{||,,,,,)}))||||,|{..{{{.||||||.....},|{,(({((,{..{,(({({...(((.((((.(.(((((((.........((((((((........(((.((((((({....}.))))))))))......)))))))).,..,{.((((..(((((((.((.(((.((((.............)))).))).)).(((((.(((((((((((.((..((..((((.......))))..,.))..)).)))))..((((.(.((((((...{{{....(((((((((......{(({({((((..((((((..,....,..{{......)).........))))))....)))).)),,}............)))))))))......(((((((....((...((((((.(((....))).)))))).))))))).))..,)})))))).)..)))))))))).)))))...)))).))).)))).)),)))))))))))).))).}}}}{((((((((((.,,,.....,,)))))))||))}.(((((...}}})).))))))))},))}))...})).))),.}}))})........,}}}.,,.........