Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001276373.2

Sequence Length

1760 nt

GC Content

0.5341

CCUUUUUCAACAUUUUCCUCGGACGCGGUCUUUCCGAGGCUUAUCCAUUGAAAAUUUUCCUUGGAUAGGAAAGGACUUAGCACUCAGGCCUGUGAAUCAGGAGAUACAAAGACCUCCAAAAAAGGACCAGUUCCUCGGAUGUGCCCCCUCACAGAGAGAUGAAGGGGCAGCAGAAAACAGCUGAAACGGAAGAGGGGACAGUGCAGAUUCAGGAAGGUGCAGUGGCUACUGGGGAAGACCCAACCAGUGUGGCUAUUGCCAGCAUCCAGUCAGCUGCCACCUUCCCUGACCCCAACGUCAAGUACGUCUUCCGAACUGAGAAUGGGGGCCAGGUGAUGUACAGGGUGAUCCAGGUGUCUGAGGGGCAGCUGGAUGGCCAAACUGAGGGAACUGGCGCCAUCAGUGGCUACCCUGCCACUCAAUCCAUGACCCAGGCGGUGAUCCAGGGUGCUUUCACCAGUGAUGAUGCAGUUGACACGGAGGGGACAGCUGCUGAGACGCACUAUACUUACUUCCCCAGCACGGCAGUGGGAGAUGGGGCAGGGGGUACCACAUCGGGGAGUACAGCUGCUGUUGUUACUACCCAGGGCUCAGAGGCACUGCUGGGGCAGGCGACCCCUCCUGGCACUGGUCAAUUCUUUGUGAUGAUGUCACCACAAGAAGUACUGCAGGGAGGAAGCCAGCGCUCAAUUGCCCCUAGGACUCACCCUUAUUCCCCGAAGUCAGAAGCUCCCCGGACGACUCGGGAUGAGAAACGCAGGGCUCAGCAUAAUGAAGUGGAGCGUCGCCGCCGAGACAAGAUCAACAACUGGAUCGUGCAGCUCUCCAAGAUAAUCCCAGACUGCUCUAUGGAGAGCACCAAGUCUGGCCAGAGUAAAGGUGGGAUUCUAUCCAAAGCUUGUGAUUAUAUCCAGGAGCUUCGGCAGAGUAACCACCGCUUGUCUGAAGAACUGCAGGGACUUGACCAACUGCAGCUGGACAAUGACGUGCUUCGACAACAGGUGGAAGAUCUUAAAAACAAGAAUCUGCUGCUUCGAGCUCAGUUGCGGCACCACGGAUUAGAGGUCGUCAUCAAGAAUGACAGCAACUAACUAUGGGGAUUCAGGGGCUUUGGGCCCAAGAACUGCAGAUAGCCCAGGAGCAACAGCCUAAUCCCGUGCCCCUUUCCUUCACUGCCCCACUUCUGGCAUGGGACAGGGGGAAGUUCAGAAGGUGUGUCCUUGAACUGAGGCCCUGUGAUAUGGCGGCCUGCAGUGGUGUGAAACACACAAUGUGGACGUGCACUGACAGCCUUGCCCACCCCCACCAUGCAGCCCCUGGGCCCUUGUGCUCCUCUCGCACAAUGCAUGUGCUGUCUCCAUGCUGGAUACUGGACACACUAAACUCUGGGGCUUGUCCUGUGCUUGCUUAGAGUGCCCAGCAGAGGUUUGCUGACAGGUGAUGCUCUGGCUUGCCCCAGGACUCUGGCACUUCCAUUGGUUCUUCCUUUCCCUGGAGCUGAGGUUUAGAUGUGCAACCUGUGGCUCAGGGGAGCAAGCUUACACAAGAAGUGAGGGAAGGAUGUUUAGCAGUGGCUGGUGCCCAUGAAGAGGAGAUUGGCCAGUGAGAAGCUGAGGCCUAUGCAGACAUCUCUGGAGCCAGAGAGAACAACAGGCAGGGGCCCACUUGGGGCCUUCCCCCUUGUGGGGGUCGUUUUUUUUUUUUCUUUUCUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUAAGAUAAAAUUGUUCAAAGCCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-646.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -680.68

Frequency: 0.0000

Diversity: 425.02

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((...........(((((((.........)))))))((((((((..(((....)))..)))))))))))))............(((...(((((..((((..........))))(((((((((((((((.......((((((((.(((........))).)))))).))......)))))....((..((((...(((((((..(((((((.(.((((((((((((((((.....))))......)))))))))).)).).)))((.((((((((.(((((((((.(((((...(((.((.((.....)).)))))...)))))..)))).......((((((.((((((.(((((...))))).)))))).)))...))).(..(((((.((.(((((.(((.(((((((.((((....((........)).))))...)))))))......))).))))).)))))))..)..))))))).))))))))..((((((((......((((((((.....((((((((((((.((((((.(((((........(((.((((((((....)))).)))).))).(((((..(((...(((..((((((((((...((((((.(((...((...(((((.(((.((....)).))))))))..))))).)))))).......))))....)))))))))..))).((((...((((((.(((.((..(((.(((((.....))))).........((.(.((((.((........)).)))).).)).((((............(((((((.(((.(((((..((((........((((((((((((....)))))....))))))).((((.....(((((.(((((..((.((((((.((........)).)))))).)).)))))..))))).....)))).....((((((((......))..)))))).))))..........((((.((.....)).)))).((((......))))....)))))..)))..)))))))))))(((.(......).))).(((((.....))))))))..)).))).))))))...))))(((((((((................))))).))))...))))).))))).)))))))))))..)))))))......(((........)))))))))))......)))))))).....(((((((((((((...)))).))))).)))).(((((...)))))....))))..)))))))....))))..))((((((((......((((((((((((((((....((((((((((.....)))))((((((((...)))).....))))......((((((((.(..((.....))..)))))))))((((((.(((.((((((....((((...(((((.(((.(((......((((((((((.((((((((((((((.((((((.(((((.(((((((....)).)))))..))))).))))))....(((((.......)))))))))))))......))))))..)))))).....))))......))).))).)).)))....))))..)))))).))))))).))..)))))........)))))))))))...)))))..........)))))))).))))))))))......................((((.((((......)))).))))..)))))..))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

{((((...........(((((((.........)))))))((((((((..(((....)))..))))))))}}})}............(({,{.{(((,,,((((..........)))){(((((((({((({{.....,.,{((((((.(((......,.))).)))))).}}......}))))....((..((((.,.(((((((..(((((((.(.((((((((((((((((.....)))}....,,}})))))))))}).).))}{(.((((((((.(((((((((.(((((...((,{((.((.....)).)))))...))))),.)))).......{{{(((.((((((.(((((...))))).)))))).)))...}}}.{..{(({||{(.(((((.(((,{((((((.((({,...((........)).))))...)))))))......))).))))).}))))))..}.,))))))).)))))))}|.((((((((.,.,,.((((((((.....((((((((((((.((((((.(((((........{((.((((((((....))))}}))}.))).(((((,.,.{((,{{,({(((((,(((....((((((.(({..{((...((((({(((.((....)).))))))))..))))).))))))..))).})||{{{{.,|||||{,{{,.,,.{{{{.,.((((((.{((,,(..(({.(((({.....)))))..,.,...,((.{.((((,{(........)).}})),}.||.(((((..(,.{........}}},.))}.}}.||{{{{{{{{{.....{{{{{{{{{|||.,,,))))).....)))))),((((.....(((((.(((((..((.((((((.((........)).)))))).)).)))))..)))))..,..)))).....{((((({{......}}..))))))}}}},}..,|.||,|||||}|}....}||||,|((((((......)))},))}{||||..|,,...,.),,))))),|||,,{.{{{|.,||.(((((.....))))),))..))}))).)))))),}}))))}),})))))))..,...,}}.,...)))},||}}}....}))}.))))).)))))))))))..)))))))......(((........)))))))))))..,,..)))))))).....(((((((((((({...}))).))))).)))).(((((...)))))....))))..))))))).,..))))..))((((((((...,..((((((((((((((((.(((((((,(((((.....))))){((,((((...,}}}.,,,})}}}},......{{{{{{{{..((({,{.((,.{{{,{{{{{(((((((({....})))))..,)))...))})})))..))}})))),,,,.((((((.(((((((((((((({((((((.(((((,((((({{....}}.))))).,)))))}))))),....(((((.......)))))))))))))......))))))..))))))...},)))))))...(((((((.....)))..))))..,,..,...((((((....)))))).........)))))))))))...)))))..........)))))))).}}}}},,,,,..,,,.,}}}}},,,.......,,,{,{{{,......)))).}))}.,))))),}))).