Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001278406.2
Sequence Length
1422 nt
GC Content
0.6069
CACCGAGGGCUCAUCCAUCCGCAGAGCAGGGCAGUGGGAGGAGACGCCAUGACCCCCAUCGUCACAGUCCUGAUCUGUCUCGGGCUGAGUCUGGGCCCCAGGACCCGCGUGCAGACAGGGACCAUCCCCAAGCCCACCCUGUGGGCUGAGCCAGACUCUGUGAUCACCCAGGGGAGUCCCGUCACCCUCAGUUGUCAGGGGAGCCUUGAAGCCCAGGAGUACCGUCUAUAUAGGGAGAAAAAAUCAGCAUCUUGGAUUACACGGAUACGACCAGAGCUUGUGAAGAACGGCCAGUUCCACAUCCCAUCCAUCACCUGGGAACACACAGGGCGAUAUGGCUGUCAGUAUUACAGCCGCGCUCGGUGGUCUGAGCUCAGUGACCCCCUGGUGCUGGUGAUGACAGGAGCCUACCCAAAACCCACCCUCUCAGCCCAGCCCAGCCCUGUGGUGACCUCAGGAGGAAGGGUGACCCUCCAGUGUGAGUCACAGGUGGCAUUUGGCGGCUUCAUUCUGUGUAAGGAAGGAGAAGAUGAACACCCACAAUGCCUGAACUCCCAGCCCCAUGCCCGUGGGUCGUCCCGCGCCAUCUUCUCCGUGGGCCCCGUGAGCCCGAAUCGCAGGUGGUCGCACAGGUGCUAUGGUUAUGACUUGAACUCUCCCUAUGUGUGGUCUUCACCCAGUGAUCUCCUGGAGCUCCUGGUCCCAGGUGUUUCUAAGAAGCCAUCACUCUCAGUGCAGCCGGGUCCUGUCAUGGCCCCUGGGGAAAGCCUGACCCUCCAGUGUGUCUCUGAUGUCGGCUAUGACAGAUUUGUUCUGUACAAGGAGGGGGAACGUGACCUUCGCCAGCUCCCUGGCCGGCAGCCCCAGGCUGGGCUCUCCCAGGCCAACUUCACCCUGGGCCCUGUGAGCCGCUCCUACGGGGGCCAGUACAGAUGCUACGGUGCACACAACCUCUCCUCUGAGUGCUCGGCCCCCAGCGACCCCCUGGACAUCCUGAUCACAGGACAGAUCCGUGGCACACCCUUCAUCUCAGUGCAGCCAGGCCCCACAGUGGCCUCAGGAGAGAACGUGACCCUGCUGUGUCAGUCAUGGCGGCAGUUCCACACUUUCCUUCUGACCAAGGCGGGAGCAGCUGAUGCCCCACUCCGUCUAAGAUCAAUACACGAAUAUCCUAAGUACCAGGCUGAAUUCCCCAUGAGUCCUGUGACCUCAGCCCACGCGGGGACCUACAGGUGCUACGGCUCACUCAACUCCGACCCCUACCUGCUGUCUCACCCCAGUGAGCCCCUGGAGCUCGUGGUCUCAGGACCCUCCAUGGGUUCCAGCCCCCCACCCACCGGUCCCAUCUCCACACCUGCAGGCCCUGAGGACCAGCCCCUCACCCCCACUGGGUCGGAUCCCCAAAGUGGUGAGUGAGGGGCU

Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-557.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -583.96
Frequency: 0.0000
Diversity: 301.89
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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