Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001278638.2
Sequence Length
1067 nt
GC Content
0.6345
CCUUUCACUUUCGGUCUCUGGCUGUCACCCGGCUUGGCCCCUUCCACACCCAACUGGGGCAAGCCUGACCCGGCGACAGGAGGCAUGAGGGGCCCCCGGCCGAAAUGACAGUGCUGGCGCCAGCCUGGAGCCCAACACACCCGCUCCCCUGCAGACCUAUCUCCUCCUGCUGCUGCUGCUGAGCUCGGGACUCAGUGGGACCCAGGACUGCUCCUUCCAACACAGCCCCAUCUCCUCCGACUUCGCUGUCAAAAUCCGUGAGCUGUCUGACUACCUGCUUCAAGAUUACCCAGUCACCGUGGCCUCCAACCUGCAGGACGAGGAGCUCUGCGGGGGCCUCUGGCGGCUGGUCCUGGCACAGCGCUGGAUGGAGCGGCUCAAGACUGUCGCUGGGUCCAAGAUGCAAGGCUUGCUGGAGCGCGUGAACACGGAGAUACACUUUGUCACCAAAUGUGCCUUUCAGCCCCCCCCCAGCUGUCUUCGCUUCGUCCAGACCAACAUCUCCCGCCUCCUGCAGGAGACCUCCGAGCAGCUGGUGGCGCUGAAGCCCUGGAUCACUCGCCAGAACUUCUCCCGGUGCCUGGAGCUGCAGUGUCAGCCCGACUCCUCAACCCUGCCACCCCCAUGGAGUCCCCGGCCCCUGGAGGCCACAGCCCCGACAGCCCCGCAGCCCCCUCUGCUCCUCCUACUGCUGCUGCCCGUGGGCCUCCUGCUGCUGGCCGCUGCCUGGUGCCUGCACUGGCAGAGGACGCGGCGGAGGACACCCCGCCCUGGGGAGCAGGUGCCCCCCGUCCCCAGUCCCCAGGACCUGCUGCUUGUGGAGCACUGACCUGGCCAAGGCCUCAUCCUGGGGAGGAUACUGAGGCACACAGAGGGGAGUCACCAGCCAGAGGAUGCAUAGCCUGGACACAGAGGAAGUUGGCUAGAGGCCGGUCCCUUCCUUGGGCCCCUCUCAUUCCCUCCCCAGAAUGGAGGCAACGCCAGAAUCCAGCACCGGCCCCAUUUACCCAACUCUGUACAAAGCCCUUGUCCCCAUGAAAUUGUAUAUAAAUCAUCCUUUUCUACCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-430.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -444.97
Frequency: 0.0000
Diversity: 143.01
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
............((((((((((((......((((((.((((..............))))))))))((((..(((((..(((((...(((((((..((((((.........).))))).((.(((((((..((((.....(((((((..(.((((..................)))).)..))))..)))......))))..))))).)))).............))))).)).)))))....)))))))))......(((.(((((((((((...................)))))..((((((((((((((((((..(.(((.((....((((((..((((((((.((((((.(((.((((((((((((((((((....((((....((((((............((...((((((((((((....((((((.....))))))......))))))..))))))...)))))))).)))))))))))))))))...........(((((..((((.(((....)))..))))..))))))))))..)))..)))))).))))))))....)))))))).))).)..)))))).))..(((.((((((...................))))))...)))...))))))))))......))))))..))).((((((((((............(((((.(((((((((((((.(((((.(.((.(((((.((((....))))))))).)).)))))))))))....)))))...))).)))))((((((...((((....(((((((((..((((.(....).)))).......(((....)))...)))))))))))))...).))))).)))))))).))...))))))))).(((((...(.(((..((((.((.((((((.(((((((((((..........(((.((((.(((((........)))))))))....)))..........)))))))...)))).))))))..........)).))))..))).)....))))).................))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
............{{((((((((((......(((((,{((((..............)))))))))){(({..(((((..(((((...(((((((..((((((.........).))))).{,{(((((((..((((.....(((((((..,.((((...,.........,}..,)))).}..))))..)))......))))..))))).)))}.............))))).)).)))))....))))))))}......({(.(((((({((({...,.,,....|.......))))}..((((((((((((((((((..(.(((.{(....{(((((..((((((((.((((((.(((.((((((((((((((((({...,((((....((((((............((...((((((((((((....((((((.....))))))......))))))..))))))...}})))))).)))))))))))))))))...........(((((..((((.(((....)))..))))..))))))))))..)))..)))))).))))))))....)))))))}.))).)..)))))).))..(((.((((((...................))))))...)))...))))))))))......))))))..))}.{{((((((((............(((((.(((((((((((((.(((((.(.((.(((((.((((....))))))))).)).)))))))))))....)))))...))).)))))(((((,...((((....(((((((((..((((.(....).)))).,{,...(((....))),},)))))))))))))...).))))).)))))))).)}...)))))))))},{{,,...,.{((,.,,{({((,((((((.(((((((((((.,.....,,,(((.((((.(((((........)))))))))....))).,......}.)))))))...)))).)))))).{{{{{{,...,,,||,...}}.}...,))))),.......,},,,,....}}.
Back