Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001278646.2
Sequence Length
689 nt
GC Content
0.5298
AGUCACCCGCAGCAGGCGUGCAGUUUCCCGGCUCUCCGCGCGGCCGGGGAAGGUCAGCGCCGUAAUGGCGUUCUUGGCGUCGGGACCCUACCUGACCCAUCAGCAAAAGGUGUUGCGGCUUUAUAAGCGGGCGCUACGCCACCUCGAGUCGUGGUGCGUCCAGAGACAAAUACCGAUACUUUGCUUGUUUGAUGAGAGCCCGGUUUGAAGAACAUAAGAAUGAAAAGGAUAUGGCGAAGGCCACCCAGCUGCUGAAGGAGGCCGAGGAAGAAUUCUGGUACCGUCAGCAUCCACAGCCAUACAUCUUCCCUGACUCUCCUGGGGGCACCUCCUAUGAGAGAUACGAUUGCUACAAGGUCCCAGAAUGGUGCUUAGAUGACUGGCAUCCUUCUGAGAAGGCAAUGUAUCCUGAUUACUUUGCCAAGAGAGAACAGUGGAAGAAACUGCGGAGGGAAAGCUGGGAACGAGAGGUUAAGCAGCUGCAGGAGGAAACGCCACCUGGUGGUCCUUUAACUGAAGCUUUGCCCCCUGCCCGAAAGGAAGGUGAUUUGCCCCCACUGUGGUGGUAUAUUGUGACCAGACCCCGGGAGCGGCCCAUGUAGAAAGAGAGAGACCUCAUCUUUCAUGCUUGCAAGUGAAAUAUGUUACAGAACAUGCACUUGCCCUAAUAAAAAAUCAGUGAAAUGGUC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-236.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -248.74
Frequency: 0.0000
Diversity: 182.71
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((((((..(((((....((((((((((........)))))))))).....)))))(((.(((((((((((((((((((......)))))).((((((((((((((((((.(((((...))))((((((...(((((........)))))))))))...........))))))))))..))).))))))...))).......)))))).............((...((((....)))).))...((((((.((..(((.((((....))))))).)).))))))......))))))).(((((((((.(((((.....((((......((.((.(((((.((((((......((.(((((.((((((.((....)))))))).))))).)).))))))))))))).)).....))))..)))))..))).))))))..)))))).(((....((((..((((..(((.((((..(.(..((((((..((((....)))).))))))..).)..)))).))).(((..((....)).))).....((((.(((...))).))))..))))..))))..)))(((.....)))..((((((((((((....))).)))))).)))..(((((((...((((((....)))))))))))))...............)))).......
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{(((((,{,,({{((,(.(({,{((((((((,{{{{..{{|||,|||},.((((..(((((((.{.,(((((((((.((((((......))))))))|,,(((({,,((((({{,{{(((,..|}}|((((((..,(((((........))))))))))}.....,,,...})}}))))))},)}}|||}}}},|,}}},,,}|}.,.)}}}..,}}})))....,,.}))))))..)))).})).}}|||,{,.||}}|||}.|||},..||||,||.||.}||||.{((...|{|.,...(((((((((.(((((.,...((((......((.((.(((((,{(((((......((.(((((.((((({,((....)))))))).))))).)).))))))))))))).)).....))))..)))))..))).))))))...})})).,}}}..)))))).||.}},|||...,,((({.((((((((..((((....)))).)))))...))).})))}}))},|||}}((....))..))})}},,(((.({,,,,,||,|||,....,,.}))}..,},}||{.,.,,)}}..((((((((((((....))).)))))).)))..(((((((...((((((....)))))))))))))...............},}...,}},.
Back