Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001281432.2

Sequence Length

2012 nt

GC Content

0.4861

AGUCUCCUUCCACAAAACCAUGGCGUCGCUCAAAUGUAGCACCGUCGUCUGCGUGAUCUGCUUGGAGAAGCCCAAAUACCGCUGUCCAGCCUGCCGCGUGCCCUACUGCUCGGUAGUCUGCUUCCGGAAGCACAAAGAACAGUGCAACCCUGAAACUCGUCCUGUUGAGAAAAAAAUAAGAUCAGCUCUUCCUACCAAAACCGUAAAGCCUGUGGAAAACAAAGAUGAUGAUGACUCUAUAGCUGAUUUUCUCAAUAGUGAUGAGGAAGAAGACAGAGUUUCUUUGCAGAAUUUAAAGAAUUUAGAUGGACUCUCGUCCUGUCACCCAGGCUGGAGUGCAGCGGCGCAAUCUCGGCUCACUGCAACCUCUCCCUCCCAGAUUCAAGCAAUUCUCAUGCCUCAGCCUCCCGAGCAGCUGGGACUACAGGCGCCUGCCACUACGCCCAACCAAUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGAUGGGGUUUCGCCAUGUUGGCCAGGCUGGUCUUGAACUCCUGACCUCAGGUGAUACACCCGCCUCGACUUCCCAAAGUACUGGGAUUAUAGGCGUGAGCCACCGCUCCAGGCCCUAAGCUAAACUUUCAUCACCUCCUGCUCCUGACUCAUCUAAAGCCUUGGUUCUCACAGUGUGGUUCAUGGAGCAUCAGAAUCAGCUGGGAGCUUGCUAGAAACGCAGCAUUGCAUUUGGAAAUGGGACUAGAAGAUUUAGAGAUGCUGAAAUAAUUAGAAGCAGUUUUUAAAAAGAUAAAGGGCUCUGGAAGAUUCCCAGUUAUAACAAAAUAAAUAAUCCAAACCUGCAGCUGAUUGGGACAUGCAGCCCUCUGGUUUACCCAGUAGGGUUAGGGAUGGAUCUUGUCCCAGCCUCAGUCUCAUUCCCGCUGUGAACUUGUAGGCUUUGCUCCUGCUGUUCUCAGGAACAAAGCUGUCAUGGCCAUCACACACAACGUACCUGAGGCAGCGCUCGGAUGGACGUGACACCAGCCUGGUCUUGUGCUGUCUGGACAGUGUAGCUACUGGGGCUGCCCCUGGGGAGCUGGAGGCAAGCCCAGACCACUAAUUUCCUCUGAAAGCUGCCUACACCCAUAGCCGUAUUGGCCAGGACCAGUCCCAGGGGCCAGAGGCGGAUUAUUGCCUCCAGGAGCCUGGUCUGCAGCGGCGAGGUGCUCAGGGAACAGGGAGCUUGAGAGAAGUGUUUUUCUUCCACACCAUCCAGCUCUUUAGCAGCAAGGCAGGCCAUUCUGAUCUUAAAAAGCAAAUAUCCCUUUAUAGCUUUAGAUUUAUCUAGCCCUCUUAGCAGAAAAUGGAAAUCAAAACUAUCUUUAACAAAUCAUCUUAACAAGGUGAACUGAAGGCACCUGGUUGCAAACAGCUGGCUGCCCUGAACCAAACUGGUUCCAUAUGCCACAAGUCUAUACACCCCAGGCAACUGUGCUUAGGCCUUACAUAUGCUACUUGAAAACAAGAUAAGAGUCCAUCAAGAUAUAACUGAUAUGCCAUAAAACCCAGUCUUCUAAAGUGUACAUCCCAGAGUUUGGUAUAUUCCCAGAGUUGCUUAUACCACUCUUCACCUACAUAACCACCCUGCAGGGUAGGUGUUACUGUGCCCACUGCAUACAUGAGGAAUAUGAGGCUCAGAGAGGCUAAACAACCUGCCCAAGGCCACCUGCAUUGCAGUGGCAGAGCCAGCAUUCCCACUCGGGUCCAUCUGGUCCCCAAAAUUGAUCCACUGCCCACCCCGACUUCUUGGGUCUUACUUACUCUCCACUUCUGCCAUGCACGCUUGAUGACUGUGGCAGCUGCAUGCAGCCUCUGGAUGUGUUUCCGAGUUAACCAGGAACGAAUGGCUAAGAGGUUUGCCCAGAAACAGGAAAGAGAUAAUAAAGGGGCCAUUAGAGCUGUCAGUGACCUCGCUGCAGCAGCACCACAGUUGCUGUCAAAGUUUCAAAUACGUUUUUUUUUUUUCAAUAAAUUGCUACAAAUAAGGUUCUAAAAUCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-607.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -647.48

Frequency: 0.0000

Diversity: 521.93

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

...............((((..(((...)))....(((((((..((((((.(((((....((.(((((((((.........)))...(((.((((((.((........)).)))))).))).(((.((..((((........))))...)).))).((((((((((((((((........((((((((.((((.....................)))).....(((..........)))..)))))))))))))))))).))))))..(((((((.(.((((..(.(((..(((......((((.((((((((((.(((.(((......((..(((((((((.(((.........)).).)))))....))))..))....((((((....(((((.(((((....(((((((((.(((((..((..(((....)))..))..)))((((.(((((((((....)).)))))))..)))).((((.(((.(((((((((((((..........))))...((((...))))(((((.....(((((......)))))....))))).((((....))))..((((((((((((.(((......(((....(((...((....))...)))...)))...(((...)))(((((.(.(((((.(((.((((((((((((((((.((...((((((.........((.(((((((((......((((((((((((............)))).)))))))).......(((((((..(.....(((((((((.............................))))))))))..).))))))((((.....))))..(((((.((((((.....))))))))))).))))))))).))))))))..)).)))))))).((....))(((((....)))))....(((((((.(((((..............((((......))))))))).))))))))))).))))))).))))).).)))))))).)))))..)))))))(((((((((..((((((((((.((.((((............))))...)))))))....((...(((.....)))..)).))))))))))))))..((((((......))))))....))))))))).)))..)))))).))))).))))...))).)).)))))((((.......)))).....((.((((((.(((.(((((.(((...(((.(((.(((((...(((((..(((......))).))))))))))..((((....(((....)))...))))......................(((((((...)))))))...)))))).))).)))))))).)))))).))....((((((...))))))((((((......(((((..(((...((....)))))..)))))....))))))...)))))).))).))).)))))))))).))))......))).))).)..)))).).))))))).(((((.....(((((((.((((((((((((((....(((......(((....(((((((....((........))))))))).....)))......)))....)).)))))))).(((((.....(((..........)))....(((((.(((...)))))))).))))).............(((.((....)).)))......................)))).))).))))...)))))..)))))).....))....)))))..))))))(((((..(((((.((((((((((...(.((((((.(.((.((((..................)))).)).).)))))).)..))))........((((.((((.((....)))))).))))))))))))))).)))))(..(((.....)))..)...........................))))))).....))))..........

Thermodynamic Ensemble Prediction

.{,,,{.,,.......,{,((((((..(({,....},}))..)))})}.(((.(((((((...(((((((((......((((((((((((((((((.(({......,)).))),,|((({((((,((..((((........))))..}),.,...((((((((((((((((,.......{(((((((.,{,{.,,.......,.......,||}}},..,..,,,..........}},..)))))))))))))))))).))))))||||,||}}.,,,||||||||,,,.,,,|||}}}},}}.{{{((((....)))).}})...)))))))),..})))))).........))))..........)))))....))))}}}}.)))..((((..((((((.{(((,,{,((((.((((.,,(((((((((((((.{{..{|............(((((,(((((..(((((.((((((((((.(((.(((((((((((((..,....|..))))..,((((,,.}}}}(((((.....(((((......)))))....))))).((((....))))..((({{{,{|||,.,,,...,,,|||,..,({{{({(,....,,...{{{,,{||{.,,.{{{,,}|}{{(({.{.(((({.(({{(((((((({(((((((.{{...((((((.........((.(((((((((.,....((((((((((((............)))}.)))))))).......,(((((,,{{,....(((((((((.......................,,....))))))))}}.,,}||||||((((.....)))).}}||||.((((({,...,}))))))))))}))))))))),)}))))))..}}.))))})||,(,{{{{|,,{,{{.}}})),)),,,,{((((((.(((({.........},..,{(((......))))))))).))))))}))))}})))))).))))).).))))))})})))},},)))))))(((((((((..(((((((((,,((.((((............))))...)))))))....((...(((,...,)))..)).))))))))))))))..((((((......))))))}}}}))))))))).)))..)))))|.{(((.{{{{,..,{((({{,,(,(({{{(,,..,,,}}}.,},,,..))}}))))))}.||,{|.,{|}.(((......(((((...(((((..{{(......)}}.))))))))))......)))}}}},})),....((((,.{(((....((((({...{{..(((((((...)))))))..}}..((((.(((((((....))))))).))))..((((({...})))))((((((......(((((..(({..,((....)))))..)))))....))))))...((((....))))....||.....}}})))))....)))).}.)))}.,})))).})))})))))}.})))}....((((,.{((((((..{........}..)))))))))))...................}.}))))))))))..)))))))))))))......)})),...))))))...))))(({.......,,,|||..,|||,.,,{(({,.(({{(((,(((({{((....(((....|||.....}})),..........|,.,,,..,.....,,,|,....,)))),........,}}}}}},,,}})),))))}.||{(({(((((((((..(((((.((((((((((...{.((((((.{.({.{(((.,.........,,,....)))).)).}.)))))).)..))))........((((.((((.((....)))))).))))))))))))))).)))))))),,,))}},,}}...........................,,.,},........,)))}..........