Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001281434.2
Sequence Length
737 nt
GC Content
0.4410
AGUCUCCUUCCACAAAACCAUGGCGUCGCUCAAAUGUAGCACCGUCGUCUGCGUGAUCUGCUUGGAGAAGCCCAAAUACCGCUGUCCAGCCUGCCGCGUGCCCUACUGCUCGGUAGUCUGCUUCCGGAAGCACAAAGGGGAAUCUGCAACAUUAAGAAGCUUAUUGCUCAAUCCACACCUCAGGCAGUUGAUGGUCAACCUCGAUCAGGGAGAAGACAAAGCAAAGCUCAUGAGAGCUUACAUGCAAGAGCCUUUGUUUGUGGAGUUUGCAGACUGCUGUUUAGGAAUUGUGGAGCCAUCCCAGAAUGAGGAGUCUUAAGAUGGAUUAUUGUGCUGCUUGCUCAAGCGUGUGCUUGACUCCUGGAACCUGCCUGCUCCCUCUCCCAGACCAGCUAGUUUGGGGCUGGGGAGCUCAGGCAAAAGAGGUUUCCAGGAUGCAGAUUAGGUCAUGCAGGCCUUUACCGGCAUUGAUGUGGCUCAUGUUUCAGGCAGACUUGGGGUCCUUAAGGUGGCAAGUCCUUUAUGGAGAGAAAACUUGACAUUCAGAUGAUUGUUUUUAAAUGUUUUACUUUUGGUACAGUUGAUAGACAUCAUAAACGAUAUCAAGCUUACACUUCAUAUGGAGUUAAACUUGGUCAGUGUUAAUAAAAUCAAAACGUGAUUCUACUGUACAUUGCAUUAUUCAUAAUUUAAUUGUUUGAAAUUACAUUAAAUAAAUCAACUAAUUAAAUACUAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-214.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -230.70
Frequency: 0.0000
Diversity: 202.38
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((.(((((((((.....((((((..((((....).)))..))))))((((((((((((((.(((..(((.........))).))))))((((((.((........)).))))))(((((....((.(((((((.((((..(((((((..(((((.(((...((((....((((((.(..((((..(((((((((..((((.....))).)..)))......((((((....)))))).))).)))..))))..)..))))))....))))...))).)))))...)))))))....)))).........(((((......))))).))))))).))...((((((....)))))).((((((((((((((((((((((.((((((((......))))))))..)))))))..)))).....))).)))))))).)))))..)))))))))))(((......))).....)))))((((.((((.....)))).))))......)))).)))((.(((..(((((((.(.((.(((((.(((...(((((.((((((((.(((.(((....))).))).)))).)))))))))....))).))))).)).).))))))).))).)).....((((((((((((.((.(((((.....))))).)).)).)))))).))))......(((((((((.((((.(((......)))...)))).)))))))))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((,(({{,,...,,,.{((((.(((((({,,,{({.,,..,,,.((((((((((((((({{(((..{((.........))).)))))){(((((,({,...,...}}.||||||(((((,,,{(,,((((({{.((((..(((((((..{((({.{((...{{||....((({{(.{..((((..((({{{{{(..{(((.....}}),)..}}}...,,.((((((....)))))).,,),)}}..)))).,),,)})))),...)))),,,))),,}))),..})))))).,|.||||,...,,,,.{{((|.....,))}},.}}}}}|}.|}.|.((((((....)))))).((((((((((((((((((((((.((((((((......))))))))..)))))))..))))}....,))))))))))).))))}..)))))))))))))........))))))}.))))))))))}}},|}},}}})|||}},,,,..,})).}}){{.(((..(((((((.{.{{.(((((.(((...((((,{((((((({.(((.,,{,....)},))).}))).)))))))))....))).))))).}}.,.))))))).))).)}.....{{({((((((...{{.(((((.....))))).)).},.)))))).}}},......(((((((((.((((.,{{......,,}...)))).))))))))).,,...
Back