Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001282151.2
Sequence Length
1295 nt
GC Content
0.3869
GAGGAGCCUGAGGAAGAGGGCGGCGACGGUGGUGGUGACUGAGCGGAGCCCGGUGACAGGAUGUUGGUGUUGGUAUUAGGAGAUCUGCACAUCCCACACCGGUGCAACAGUUUGCCAGCUAAAUUCAAAAAACUCCUGGUGCCAGGAAAAAUUCAGCACAUUCUCUGCACAGGAAACCUUUGCACCAAAGAGAGUUAUGACUAUCUCAAGACUCUGGCUGGUGAUGUUCAUAUUGUGAGAGGAGACUUCGAUGAGAAACAUUAUUCCAUCAUUUGUGUUGAUGGAUAUCCAGGCUUCUACAGUGGUCACCUAUGUGUAUCAGCUAAUUGGAGAUGAUGUGAAAGUAGAACGAAUCGAAUACAAAAAACCUUAAAGCCAGGCCUGUCUUGAUGAUUUUUGGUUUUUUUUCAUUGUCCUGUUGAAAUCAAGUAAUUAAACAUUUAAGAGCCACAAAAUUGUAUCACUUUUAUAAUAUUUUGCAGUAAAAUAUAAUACCAUCUUCUCUGUUAAUACAUAAUUGCUCCAAGCUUCCUGUAAACUAUAAGAAUAUAUUUAGUUUACAGUAUAUGGAUUCUAUGAAAAAAUGUCCACAACACAGUAAUUGGUCACUUGUUAAGAAAAAUUUAUCCUUGUAAGUAUCUUCAAAGUUGAUAUUUGGAACUUUAUUCCAAAAGUAGUGCAUGUGGAGAAAGAAUCUAGACUUUCUUGUAUACAUUUUUCUCUUCUCCAGUAAUAAACAAUUACCUUUCAUUUAUACUUUGAUAACCUGUAUUUAAUUUAAAAAAAAACAUAAAAAUGAGGAACCAAGUGAAACUACGGAUAUAAAUAUUAAAGUGGACGAGAUGACCUUUCAGAGCUCUUCUCUUACAUUGUGUCAUAAUGUUGGACUCAGAUUUUAUUUGCUAAAUAAUAUACCAUGCCGACAUUAACAGUGAUUCUUCAAACUGUUGCUAUUUCCAUUUUUCAAGGUUUAAUAAAAGUUUUAAAAAUACAAGUUUAGGGGCCGGGCACAGUGGCUCACACCCUAAUCCCAACACUUUGGGAGGCUGAGGCAGGUGGAUCACCUGAGGUCAGGAGUUCAAGACCAGCCUGGCCAACAUGGUGAAACCCUGUCUGUACUAAAAAUACAAAAUUAGCCAGCAUGGUGCUACAUGCCUGUAUUCCCAGCUACUCGGGAGGCUGAGGCAGUAGAAUCACUUGAAUCCUGGAGUUGGAGGUUGCAGUGAGCCGAGAUCACACCAUUGCACUCCAGCCUGGUCAACAAGAGCAUAACUCCGUCUCAAAAAAAAACAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-343.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -366.31
Frequency: 0.0000
Diversity: 248.36
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....((((........)))).((.((....)).))...(((((((((.((((((...((((((.(((.((........)).)))...))))))..)))))).(((((((((((((((((.............(((((.(((..((((............))))..))))))))...(((((...)))))((((((.(((.....))).))))))))))))..(((..((((.((((((((((((.(((((((.(((......)))))))..((((((((.(((((((...((((........)))).....(((((((.(((.....(((((((.(((((((((.((((((...(((...((((((((..(((..((((.....))))....)))..))))))))))).((((.((.(((((................))))).))..))))..)))).)))))))))))((((((((...)))))))).....)))))))...))).))))))).....((((......((((((((((............))))))))))....))))............))))))))))))))).....(((((((((((..........(((((......(((((.........)))))((((((.....))))))..(((((.(((.(((((((((((.....((......))........)))).)))))))(((((.....))))).((((((((((((...........)))).....................))))))))......)))..))))))))))..............)))))).))))).....))).)))))))))))).)))).)))((((((((......((.((((((...)))))).))......)))))))).............)))))))))))....((((...((((((.(((((........))))).........((((((...((((......))))...))))))((((((....))))))((((((((((((.(..(((((((.(((((((.(((...)))...)))))))..)).)))))..)))))))((((.......))))...))))))....((((.((((.(((((...(((((........)))))....))))))))).))))))))))...))))(((((((..(((((((..............)))))))))))))).((.((.....)).))...))))).)))).............
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,,,,((((..,,,,..|||},((,(({{,.||,||.,{(({{(({{(,((((((...((((((.(((.((........)).)))...))))))..)))))).||(((({{(((((((((.............(((({{(({,{((({............))),}}))))))))...(((((...)))))((((((.(((.....))).)))))))))))))}|{{..((((.((((((((((((.(((((((.(((......)))))))..{(((((((.(((((((..,((((......,,||}}.....(((((((.(((.....(((((((.(((((((((.((((({...,,....{{{{{,{{..{({,,((((....,|}}}..|,}|}||)))))}}},||.,{{,.,{.{{|||,....,,..,,,....,)))).}),.}}},..}))).)))))))))))((((((({...}))))))).....)))))))...))).)))))))...|,{,,|}}}...((((((((((............))))))))))....}))}..,.........})))))))))))))}.....(((((((((((.......{{{(((((....,{(((((..,...,..))))}|(((((.....}))))}..(((({.,...(((((((((((...,.((......))..,.....)))).)))))))(((((.....)))))..{{{{{{{.,,{{{{,......{{{,{{{.............,,,...,,}}))))....,}))),,)))))))))}.,,,}.,,......)))))).))))).....))).)))))))))))).)))).}}{((((((((......{{.((((({...}))))).}}......))))))))}..,,|,|....,)},)))))))),...|||{,,,|||{{|,|{{{{........}}},,.........((((((...((((......))))...))))))((((({....})))))((((((((((((.(..(((((((.(((((((.(({...}))...)))))))..)).)))))..)))))))|(((.......))),...})))))....((((.((((.(((((...(((((........)))))....))))))))).))))}}}}}}..,}||}(((((((..(((((((..............)))))))))))))),||,{{.....)}.},...))))}.))),.............
Back