Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001282454.2

Sequence Length

2016 nt

GC Content

0.4167

CUUUCUCUAGACGCGUCUUGCUGGGAGAGUGUCCGUUGCUUCCCGUCCGUGUCGCGGCCCUGCGGUUGGCGGCCUCCUCGUGGAGCGGAGCAAGGCUGAGAUCUGUAUCUGUGGACCUGAAUGUUGAUCCCUCGCUUCAGAUUGACAUACCUGAUGCGCUCAGUGAGAGAGACAAAGUCAAAUUUACAGUGCACACAAAGACCACACUGCCCACGUUUCAGAGCCCAGAGUUUUCUGUUACAAGGCAACAUGAAGACUUUGUGUGGCUACAUGACACUCUUAUUGAAACAACAGACUAUGCUGGGCUUAUUAUUCCACCUGCUCCUACGAAGCCCGACUUUGAUGGUCCUCGAGAGAAGAUGCAGAAACUGGGAGAAGGUGAAGGGUCUAUGACCAAAGAAGAAUUUGCCAAGAUGAAACAAGAACUGGAAGCUGAGUAUCUCGCUGUGUUUAAGAAGACUGUGUCCUCCCAUGAAGUCUUUCUUCAGCGGCUUUCUUCUCACCCUGUUCUCAGUAAAGAUCGCAACUUUCAUGUUUUCCUGGAAUAUGAUCAGGAUCUAAGUGUUAGGCGGAAAAAUACUAAAGAGAUGUUUGGUGGCUUCUUCAAAAGUGUGGUGAAAAGUGCUGAUGAAGUCCUUUUUACUGGAGUUAAGGAGGUAGAUGACUUCUUUGAGCAAGAGAAGAACUUCCUUAUUAACUAUUACAAUAGGAUCAAAGAUUCUUGUGUGAAAGCUGACAAAAUGACCAGAUCUCAUAAAAAUGUUGCCGAUGACUAUAUCCACACCGCAGCCUGCUUACAUAGCCUGGCUUUAGAAGAGCCCACAGUCAUCAAAAAGUACCUAUUGAAGGUUGCUGAGCUAUUUGAAAAACUAAGGAAAGUAGAGGGUCGAGUUUCAUCAGAUGAAGAUUUGAAGCUAACAGAGCUCCUCCGAUACUACAUGCUCAACAUUGAAGCUGCUAAGGAUCUCUUAUACAGACGCACCAAAGCCCUCAUUGACUAUGAGAACUCAAACAAAGCUCUGGAUAAGGCCCGGUUAAAGAGCAAAGACGUCAAGUUGGCUGAGGCACACCAGCAGGAGUGCUGCCAGAAAUUUGAACAACUUUCCGAAUCUGCAAAAGAAGAACUGAUAAAUUUCAAACGGAAGAGAGUGGCAGCAUUUAGAAAGAAUCUAAUUGAAAUGUCUGAACUGGAAAUAAAACAUGCCAGGAACAAUGUCUCCCUUUUGCAGAGCUGUAUUGACUUGUUCAAGAAUAACUGAUAUGCCUUCACUCAGAAGAAAAGAAAUGAAUGUGAAAGAAAGCCAAGCAUCACUUGCACUUAAAUCAUUACCACGGAAGAUAUAUUAGCUUCAACUUUAGUUUAAAAUUAUGUGAAUAAAUAUUUUGAUUUCUACAAAUCUUAACAUUUAACCAUGUUGGUUUAAAAAUAUUAUUGCUUGCUACUUGGACAUAACUAAUUUUUCCUUGUGCAUUUAAUACCUCUGGGCAGAAUCCAAAUACUGGGUUCUCCCGUAGUUCGUCUUUAGUUACUAAGAAAGGGUGUAGGACACAUUAGCCUUCUGGAAACAAGUAGAAGCCAUCACCUGGCCCAUGUCCCUACAAACCCAUGAUUGUCAGGGAGGUGCCAGUUACAGCAGGUGAUUCAGCUACUUGAGGUCGGUAACAGACCUUCCAUUCCUCACUGAAGGUGGGGUUUGUGUUUUUGUUUUGCCCUGUUACUCCACUGGUAGUCAUCUGGUGUUUGUACUAUAACAACAGCAAGAAAAUCUCAUUUAUCUUUAUAUACUCUUUGCACCUCCUUUUUUUAGUCGAGAUAUAAAUAUUUGAGGGGAGAGAAAUAUCUACAGGUAUAUAUGGAAACAAAUAAUGUGGUCUGCUUUAUAAGAUGGCCAGAUCUACAUUAGGAAAAGUAUAAGCCCCCUCCCUAAUGGCCGCUGGGGGGUGAGGGCGGUGUGUUGUAUGUCUUUGGGUGUUUGUUUUUUUAUAAAGCAUAUAAUAAAAUAAUCGUGCUACUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-549.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -585.31

Frequency: 0.0000

Diversity: 534.93

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((((..(((((.((((.....)))))))))(.(((((.((..((((((..(.((((..((.....)))))).)..))))))..))))))).)(((((...(((((((((.((.(((((.((.((....))))))))).)).))).....))))))))))).)))))))................(((((((.(((((((((((((((((..(((((((((((((((((((((((((.......)))).))))))))))...))))..............)))))))..(((......)))(((..(((.((((((((.(((((((((((.....)))))...(((.((....)).)))........)))))).)))))...((((...))))...))).)))..))).....(((((((((((.((.((((((((((((.(((((((((....))))(((((((((((.(((((.....)))))..(((((((((.((((...(((((((((..(((((.......(((((((((...)))))))))....))))).((((((.........)))))).(((((((.((((((((((((......((((((((((((((.(((.....))).))))))))(((((.(((((((((......(((((((.....))))))).)))))))))(((.((.(((((..((((((...))))))..))))).)).))).........((((((((((....(((..((((((..((((.(((.......((((.(((.....)))..))))(((((..(((.(((((((.((((..........)))).))))).)).))).)))))........)))..))))...)))).))..)))...))).))))))).((((.....)))).)))))......)))))).......)))))))))))).)))))))...(((((((......)).(((((.....))))).............((((((.....((((((((((...((......))....))))))).)))...)))).))(((((((((((..............((((((..(((........)))..(((......)))..))))))....)))))))))))(((.....))).........)))))..((((............))))((((((.(((.......((((....))))..))))))))).......))))).....((((.....)))).........)))))))))))))))))..(((.....)))..................((((.........))))........((((((...(((((..(((((.((..(((((....)))))..)).)))))..)))))...)))))).....(((((..(((.((..(((.............)))..)))))..))))).((.((((.((((((((.....)))))))))))).))....((((........))))..)))...))))))))...(.((((((........)))))).).....(((((((...(((((((((........)))).))))))).)))))..))))))))).)))))))).)).((((((.......)))))).((..(((((((...)))))))..)).)))))))))))......(((((((.(((((.(((((.((.((((.((......)))))).)).......((((..(((..((((((.(((......................))))))))))))..))))((((((((....)))...(((.(((((.........((((((((((((((.........)).)))).))))))))......))))).)))..)))))..))))).))))))))))))))))))))))......)))))))...(.(((((((.(((((.....))))).))))))).))))).)))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((((..(((((.((((.....))))))))){.(((({,((,.((((((..(.((((..((.....)))))).)..))))))..))))))).|(((((...(((((((((.((.(((((.(,,({....})))))))).)).))).....)))))))))))})))))))..............,,((,((((.(((((((((((((((((..(({(({(((((((((((((((((((.....,.}))).))))))))))...))))...,,,...,,...,})},,}..{||......)))(((||({..{(((((((.((((({{{{,{...,.||||,.,,|||.{|.|..)},),,.,......)))))).})))).,,((((...}}}}..,}},.,}}..}||.,{,{(((((((((((.{{.(((((((({{((.(((((({{,..,.||}|(((((((({({.(((((.....)))))..)}.........((((((.((((.((((((((.((.((((.(((((((({,,,|}}}}}}}}..{{|,,.({(((({.{{(,({{{{{{{....(((((((.((((((((((((......((((((((((((((.(((.....))).))))))))|{{((,(((((((((......(((((((.....))))))).))))))))},||.||.(((((..((((((...))))))..))))).}|,,|,,....,,,.{{{,,,||||....,||,,{{,((({{((.,.,,,.......((((.(((.....)))..)))|,,.,..,|||....|}}}}||....{{{{{{{.....))))})))|,|||.|||,.........},,.,||||.,{|}}|{||{,|}|,,,||}..})))))}{|{{....,)))),})))....,,.)}}))),......)))))))))))).)))))))...,,,..((......)).(((((.....)))))...{,,,....,((((({,{.,{{{,,,{{{|,.,|}||..,{.,||{,,{||||{||.{||{{.{(,,,.}}.|||||||||,..,||||,,,..|{{{{{{..(((,,,,,{|.,,,..(((......))}..}}}}}},,,.}||||}||}{((((.....))))}.}}...})))},..((((..........,.))))...,..,,}}},}))),)}))))}})},.},)}.,|||||{{{.....,,,...,|,|{((|||,|,,..........}}}..)))}}}}..||||{{({{...,.}}}..|{,,{||,,,......||||.|,,..,||||}}.....,|}|||,|,.,,{{|||..{{(((.{(..(((({....}))))..}}.}}}}}.,|}}},}))))}}}......,,,||,,|||,,|}}|||}}......,}}}}))).,,})))}}))}},}}}.{(((.((((((((.....)))))))))))).)))))))))}...,}))).)))})))))).))))))))...{.{(((((........)))))),......((((({{,,.(((((((((........)))).)))))}),)))))..)))))}))}.)))))))).)}.((((((.......)))))).((..(((((((...)))))))..)).))))))))))}|,|.,,({{({{{.{{|||.{{{|{|{(,(((((((......)))))).),,|,....{{{{..{{{,{{(((((,(((,,,||..,,,.....,,,.,}.)))}}}))})}}..))))||{(({{{....})}...|||.{{{{(,........((((((((((((((.........)),}))),)})))))),.....))))),))),,|||||..,}}}}.}})))))))})}))))))))))......))))))).}}|}||||{{,.{{{{{.,{{{|}}}}.,,,}}},..)))),,},..