Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001282622.3
Sequence Length
5807 nt
GC Content
0.5791
GACAAACCAAGAUGGCGGCGGCGGCGCUGAAGGCCGCGGCGUUUGGGAGGUAACUGUGGUGGCGAAGGCUGCGGUAGUGGGGAGGCAACCACACAGUUUGGAAGAAACGGAGCGGGACGAAGAGGCGGUAGCAGUAGAGUCAGCCUGAGACUCUCAGAGCACGACGGCCACACGCCCCCUUAGGCCCUCGGCGGGCGGCGGCUGCCCCGCUUAGGGCCUAGCCUCCGAGCAUUGCCUCGGCUUCAAACAGCGGCGGCGCCAUGAGUCCUUAAGGGCGGUCCAAGCCUCCCGAUCCCUGGCCCAGACCUCGGGCCCACCAUGGAGCCGGGGUCCGACGAUUUCCUACCGCCACCGGAGUGCCCGGUGUUCGAGCCUAGCUGGGCCGAGUUCCGAGACCCUCUUGGCUACAUCGCGAAAAUCAGGCCCAUCGCAGAGAAAUCGGGCAUUUGCAAGAUCCGCCCACCCGCGGACUGGCAGCCACCCUUUGCUGUGGAAGUGGACAACUUCAGGUUUACCCCCCGAAUCCAGAGGCUGAAUGAGCUAGAGGCCCAGACGAGAGUGAAACUGAACUACUUGGACCAGAUUGCCAAAUUCUGGGAAAUCCAGGGCUCCUCCUUAAAGAUUCCCAAUGUAGAACGGCGGAUCUUGGACCUCUACAGUCUCAGCAAAAUUGUGGUGGAGGAAGGUGGUUAUGAAGCUAUCUGCAAGGACCGUCGGUGGGCUCGGGUAGCCCAGCGCCUCAACUAUCCACCAGGCAAAAAUAUUGGCUCCUUGCUACGCUCCCACUACGAACGCAUUGUUUAUCCCUAUGAAAUGUACCAGUCUGGAGCCAACCUUGUGUGUAACACACGUCCAUUUGAUAAUGAGGAGAAGGACAAGGAAUACAAACCCCACAGCAUCCCCCUACGACAGUCUGUGCAGCCUUCCAAGUUCAACAGCUAUGGCCGGCGGGCCAAGAGACUGCAGCCUGAUCCGGAACCCACAGAGGAAGACAUUGAGAAGAAUCCAGAGCUGAAAAAGCUACAGAUCUAUGGGGCAGGCCCCAAGAUGAUGGGCCUGGGCCUCAUGGCCAAAGACAAGACUCUGCGGAAGAAAGAUAAGGAGGGGCCUGAGUGUCCCCCCACAGUAGUGGUGAAGGAGGAGUUAGGUGGGGAUGUGAAGGUGGAGUCAACAUCGCCUAAGACCUUCCUGGAGAGCAAGGAGGAGCUGAGUCACAGCCCAGAACCCUGCACCAAGAUGACCAUGAGGCUACGGAGGAACCACAGCAAUGCCCAGUUUAUUGAGUCAUAUGUCUGCCGGAUGUGUUCUCGAGGGGAUGAGGAUGACAAGCUCCUGCUGUGUGAUGGCUGUGAUGACAACUACCACAUCUUCUGCCUGCUGCCUCCUCUGCCUGAGAUCCCCAAGGGUGUCUGGCGGUGCCCAAAGUGUGUCAUGGCGGAGUGUAAGCGGCCCCCAGAAGCCUUUGGCUUUGAGCAGGCUACCCGGGAAUACACUCUGCAGAGCUUUGGCGAGAUGGCCGACUCCUUUAAAGCUGACUACUUCAACAUGCCCGUGCAUAUGGUGCCCACAGAACUUGUGGAGAAGGAGUUCUGGAGGCUGGUAAAUAGCAUUGAGGAAGAUGUGACUGUUGAGUAUGGAGCUGACAUCCAUUCCAAAGAAUUUGGCAGCGGUUUCCCUGUCAGUGACAGUAAACGGCACCUAACCCCCGAAGAGGAGGAGUAUGCUACCAGUGGUUGGAACCUAAAUGUGAUGCCGGUGUUGGAACAGUCUGUACUGUGCCACAUCAAUGCAGAUAUCUCUGGCAUGAAGGUGCCCUGGCUCUACGUGGGCAUGGUCUUCUCAGCCUUUUGCUGGCAUAUUGAGGAUCACUGGAGUUACUCCAUUAACUACCUCCACUGGGGUGAGCCGAAGACCUGGUAUGGGGUGCCCUCACUUGCAGCAGAACAUUUGGAAGAAGUGAUGAAGAAGCUGACACCUGAACUAUUUGAUAGCCAGCCUGACCUCCUGCACCAACUUGUCACCCUCAUGAAUCCCAACACCCUCAUGUCCCAUGGUGUGCCAGUUGUCCGCACAAACCAGUGUGCAGGAGAGUUUGUCAUCACCUUCCCCCGUGCUUACCACAGCGGCUUCAACCAAGGCUACAACUUUGCCGAGGCUGUCAACUUUUGCACUGCUGACUGGUUGCCUGCUGGGCGCCAGUGCAUUGAGCACUACCGCCGGCUCCGGAGAUACUGCGUCUUCUCCCAUGAGGAGCUUAUCUGCAAGAUGGCUGCCUGCCCAGAGAAGCUAGACCUGAACCUGGCGGCAGCUGUGCAUAAGGAGAUGUUCAUCAUGGUGCAAGAAGAGCGGCGUCUACGAAAGGCCCUGCUGGAGAAGGGUAUCACAGAGGCUGAGCGAGAGGCUUUCGAGCUGCUCCCAGAUGAUGAGCGCCAGUGUAUCAAGUGCAAGACUACGUGUUUCCUGUCAGCCCUGGCCUGCUACGACUGCCCAGACGGCCUUGUCUGCCUUUCCCACAUCAAUGAUCUCUGCAAGUGCUCCAGUAGCCGGCAGUACCUGCGGUAUCGGUAUACCUUGGAUGAGCUUCCUGCCAUGCUGCAUAAGCUGAAGGUUCGGGCUGAGUCCUUUGACACCUGGGCCAACAAAGUGCGAGUGGCCCUGGAGGUGGAGGAUGGGCGGAAGCGCAGCCUUGAAGAACUGAGGGCACUAGAGUCUGAAGCCCGUGAGCGGAGGUUUCCUAAUAGUGAGCUGCUGCAGCAACUAAAGAACUGCCUGAGUGAGGCAGAGGCUUGCGUGUCCCGAGCUCUGGGACUGGUCAGCGGCCAGGAAGCUGGCCCCCACAGGGUGGCUGGUCUACAGAUGACCCUGACUGAGCUCCGGGCCUUUCUGGACCAGAUGAACAACCUGCCUUGCGCCAUGCACCAGAUUGGGGAUGUCAAGGGUGUUCUGGAACAGGUGGAGGCCUACCAGGCUGAGGCUCGUGAGGCCCUGGCCUCACUGCCCUCCAGUCCAGGGCUACUGCAGUCCCUGUUGGAGAGGGGGCGGCAGCUGGGGGUGGAGGUGCCUGAGGCCCAGCAGCUCCAGCGGCAGGUGGAACAGGCGCGAUGGCUGGAUGAGGUGAAACGCACACUGGCCCCCUCAGCCCGAAGGGGCACCUUGGCUGUCAUGCGAGGACUGUUGGUCGCGGGUGCCAGUGUAGCCCCUAGCCCUGCUGUGGAUAAAGCCCAGGCCGAGCUGCAGGAACUGCUGACCAUUGCUGAACGCUGGGAGGAGAAAGCCCACCUCUGCCUGGAGGCCAGGCAGAAGCAUCCACCAGCCACACUUGAGGCCAUAAUCCGUGAAGCGGAAAACAUCCCUGUUCACCUGCCCAACAUCCAGGCUCUCAAGGAGGCUCUUGCUAAGGCCCGGGCCUGGAUUGCUGAUGUUGAUGAGAUCCAAAAUGGUGACCACUACCCCUGCCUGGAUGACUUGGAGGGCCUAGUAGCUGUGGGCCGGGACCUACCUGUGGGGCUGGAGGAGCUGAGACAGCUAGAGCUACAGGUACUGACAGCGCACUCCUGGAGGGAGAAGGCCUCCAAGACCUUCCUCAAGAAAAAUUCUUGCUACACGCUGCUGGAGGUUCUCUGCCCAUGUGCAGAUGCCGGCUCAGACAGCACCAAGCGCAGCCGGUGGAUGGAGAAGGAGCUGGGGUUGUACAAAUCUGACACAGAGCUGCUGGGGCUGUCUGCGCAGGACCUCAGGGACCCAGGCUCUGUGAUCGUGGCCUUCAAGGAGGGGGAACAGAAGGAGAAGGAGGGUAUCCUGCAGCUGCGUCGCACCAAUUCGGCCAAGCCCAGUCCACUGGCAUCAUCGAGCACGGCCUCCUCUACAACCUCUAUCUGUGUGUGUGGGCAGGUGCUGGCUGGGGCGGGAGCUCUGCAGUGUGACCUGUGUCAGGACUGGUUCCAUGGGCGGUGUGUGUCAGUGCCUCGCCUCCUCAGCUCUCCGAGGCCCAAUCCCACCUCAUCCCCACUGCUGGCCUGGUGGGAAUGGGACACCAAAUUCCUGUGUCCACUGUGUAUGCGCUCAAGGCGCCCGCGCCUGGAGACCAUCCUGGCACUGCUGGUAGCCCUGCAGAGACUGCCUGUGCGGCUGCCCGAGGGCGAGGCCCUGCAGUGCCUCACAGAGAGGGCCAUCAGCUGGCAAGGCCGCGCCAGGCAGGCUCUGGCCUCUGAAGAUGUGACUGCUCUUUUGGGACGGCUGGCUGAGCUCCGCCAACGGCUACAGGCUGAACCUAGACCUGAGGAGCCUCCUAACUACCCUGCAGCCCCUGCUUCUGACCCCCUCAGAGAGGGCAGUGGCAAGGAUAUGCCUAAGGUCCAGGGCUUACUGGAGAAUGGAGACAGUGUGACCAGUCCUGAGAAGGUAGCCCCGGAGGAGGGCUCAGGUAAGAGAGAUCUGGAGCUGCUGUCCUCGCUGUUGCCACAGUUGACUGGCCCUGUGUUGGAACUGCCUGAGGCAACCCGGGCCCCCUUGGAGGAGCUCAUGAUGGAGGGGGACCUGCUCGAGGUGACCCUGGAUGAGAACCACAGCAUAUGGCAGCUGCUGCAGGCUGGACAGCCCCCAGACCUGGAGAGGAUCCGCACACUUCUGGAGCUGGAGAAGGCAGAGCGUCACGGGAGUCGGGCUCGGGGCCGGGCCCUGGAGAGGCGGCGGCGGCGGAAGGUGGAUCGGGGUGGGGAGGGCGAUGACCCAGCCCGAGAGGAGCUAGAGCCAAAGAGGGUACGGAGCUCAGGGCCAGAGGCUGAGGAGGUCCAGGAGGAGGAAGAGCUGGAGGAGGAGACUGGGGGUGAGGGCCCCCCUGCACCCAUCCCCACCACUGGCAGCCCCAGCACCCAGGAGAACCAGAAUGGCUUGGAACCGGCGGAAGGGACCACUUCAGGCCCCUCGGCCCCUUUCUCCACUCUGACUCCCCGGCUGCAUCUGCCCUGCCCACAGCAGCCGCCUCAGCAACAGUUGUGACA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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-2355.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2457.45
Frequency: 0.0000
Diversity: 1370.33
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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