Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001283050.2

Sequence Length

1112 nt

GC Content

0.5818

GCAGUUAGAGCCGAUCUCCCGCGCCCCGAGGUUGCUCCUCUCCGAGGUCUCCCGCGGCCCAAGUUCUCCGCGCCCCGAGGUCUCCGCGCCCCGAGGUCUCCGCGGCCCGAGGUCUCCGCCCGCACCAUGCGGCUGGGCAGUCCUGGACUGCUCUUCCUGCUCUUCAGCAGCCUUCGAGCUGAUACUCAGGAGAAGGAAGUCAGAGCGAUGGUAGGCAGCGACGUGGAGCUCAGCUGCGCUUGCCCUGAAGGAAGCCGUUUUGAUUUAAAUGAUGUUUACGUAUAUUGGCAAACCAGUGAGUCGAAAACCGUGGUGACCUACCACAUCCCACAGAACAGCUCCUUGGAAAACGUGGACAGCCGCUACCGGAACCGAGCCCUGAUGUCACCGGCCGGCAUGCUGCGGGGCGACUUCUCCCUGCGCUUGUUCAACGUCACCCCCCAGGACGAGCAGAAGUUUCACUGCCUGGUGUUGAGCCAAUCCCUGGGAUUCCAGGAGGUUUUGAGCGUUGAGGUUACACUGCAUGUGGCAGCAAACUUCAGCGUGCCCGUCGUCAGCGCCCCCCACAGCCCCUCCCAGGAUGAGCUCACCUUCACGUGUACAUCCAUAAACGGCUACCCCAGGCCCAACGUGUACUGGAUCAAUAAGACGGACAACAGCCUGCUGGACCAGGCUCUGCAGAAUGACACCGUCUUCUUGAACAUGCGGGGCUUGUAUGACGUGGUCAGCGUGCUGAGGAUCGCACGGACCCCCAGCGUGAACAUUGGCUGCUGCAUAGAGAACGUGCUUCUGCAGCAGAACCUGACUGUCGGCAGCCAGACAGGAAAUGACAUCGGAGAGAGAGACAAGAUCACAGAGAAUCCAGUCAGUACCGGCGAGAAAAACGCGGCCACGUGGAGCAUCCUGGCUGUCCUGUGCCUGCUUGUGGUCGUGGCGGUGGCCAUAGGCUGGGUGUGCAGGGACCGAUGCCUCCAACACAGCUAUGCAGGUGCCUGGGCUGUGAGUCCGGAGACAGAGCUCACUGAAUCCUGGAACCUGCUCCUUCUGCUCUCGUGACUGACUGUGUUCUCUAUGCAACUUCCAAUAAAACCUCUUCAUUUGAAAGGAAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-414.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -433.89

Frequency: 0.0000

Diversity: 278.81

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((.((..(((.....)))..))))...((((((((((((((((((.(((...(((((..........)))))..((((.((...(((((...(.(((((.(((((...((((((....((((((.(((((((((((((((((...)))))).((((((.(((((.((((((......))))...)).))))).))))))((((.((..(((((((..((((.(((.(((...))).)))))))))).(((((.((.((((((...........((((.((..((((((....))))))...)).)))).((((((...))))))......)))))).))))))).......((((....)))).......)))).)).)))).....)))))).))))).))))))..))))))...)))))...((((((((.......(((((..((((....)))).....))))))))))))).(((((((((....))))).))))......(((((((((...((((.....))))..)))))))))((((..(((.(((((((.(.((((((((.......(((((....(((......)))..)))))......))))....(((((((..(((((......((((.(((((((....((..((((.(((......)))))))..))...))))))).)))))))))..)))))))......))))...).))))))).))).))))))))))...))))).)).))))((((((((..(((......))).))))))))..((((.(((.(....).))).))))....))).)))))))).))...........(((((((.((((((((.(..((((((.....(((....)))((((((((..((...(((((((((((((((((((((......))))))))))).))))..)))))).)))))).))))....(((....((((((.((.(((..((((((.(.......).))))))....))).)).)))))).....))).))))))))))))))).)))))))..))))))))........(((.(((....))))))......

Thermodynamic Ensemble Prediction

{{.,...({(,,,.,}},.,),}}...((((((((((((((((((.(((..{{((((....,{.,,{|||||{.,,({{{{,{{,||||...|,||||}}|||||,..{{{{{{.,,,{(((((.(((((((((((((((((...)))))),{{{((({(({{{.{(({{(,,,,..}||||...}}))}}),)))|,|((((.((..{(((,(({{(((,.(({.{{{...))),)))}}))}||.(((({{((.((((((........,.,((((.((,.((((((....)))))}...)).)))).((((((...))))))......)))))).)))))))||....,((((....))))..,,,..}}}}.)).)))},..,.))))))}})))).))))))|.)}}}))..,}||}|{,{(((({{{{,......{{{||,|||{{,{..,,,,,.}}}}}||||}}}}}}}|{{{{(((((....))))).)))},,}.||(((((((((...((((.....))))..)))))))))((((..(((.(((((((,{.((((((((.......(((((.,,.({{......)}),.)))))......))))....(((((((..(((((......((((.(((((((....((..((((.(({......))}))))..))...))))))).)))))))))..)))))))......))))...).))))))).))).))))||,,,,}}.)))))}}}.}|||(((((({(,,({(....,,||,.}}}))))}..,||,.|||||}}}})}))).)))),...))).)))))))).))}.......|..(((((((.((((((((.,..((((((.....(((....}}|((((((((..((...(((((((((((((((((((({......})))))))))).))))..)))))).))))))},))),...{{{....((((((.((.(((,.((((((,{,....,.).)))))).,..))).)).)))))).....))).))))))})))))))).))))))).,))))))))........(((.(((....))))))......