Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001284244.2

Sequence Length

1004 nt

GC Content

0.5428

GAGAACAAAAUAAAAUUCUUUAUGGGUGACAGUCAUGAGCUGUGCUUGGCUCCAAAAACCCGACUAAAGAUGUAACAAGGUGCGGUGUUGGGCGCAUUUAUCCUGUGUUAACUUCCUAUGUUAACGUGCUGUGACACCAGAGGUGUGCAUCCUCGAGUGUGAAGAGAAGGUCUUCCCCAGCCCCCUCUGGACUCCAUGCACCAAGGUCAUGGCCAGGAGCUCUUGGCAGCUCAGCCCUGCCGCCCCAGAGCAUGUGGCGGCUGCUCUCUACCAGCCGAGAGCUUCGGAGAUGCAGCAUCUGCGGCGAAUGCCCCGAGUCCGGAGCUUGUUCCAGGAGCAGGAAGAGCCCGAGCCUGGCAUGGAGGAGGCUGGUGAGAUGGAGCAGAAGCAGCUGCAGAAGAGAUUUGGGGGCUUCACCGGGGCCCGGAAGUCGGCCAGGAAGUUGGCCAAUCAGAAGCGGUUCAGUGAGUUUAUGAGGCAAUACUUGGUCCUGAGCAUGCAGUCCAGCCAGCGCCGGCGCACCCUGCACCAGAAUGGUAAUGUGUAGCCGGAAGGGGCGCUCCUCCCAGCUGUACCGGCCACUGCAACCCAUGAGCGUCCAGGUGAUCCCCCAAACAGCAUGUGCUCAGCCCCAGACCUGCCGCCUGGGAAUCAGGAUUCCUUCUUCCCCAAGGCACUGAGCGCCUGCAGAUCCCGCAGGCUUCGUUUGCCUCCAGAACCUUCCCGUCUGAUUGUUCCUCCCCAGCCCCCUGGCAUGUUUCACCACAACCCUGUUGCUACAUCAGAGUGUAUUUUUGUAAUUCCUCUAGCUACCAUUUCAAUAGCCCCAUCUCUCCUGCUCACCCGCCUCUUGCCCCUUCUAGGGGCAGGUGAAAGGAAUAGGAAAUUGAACCUGGGGUUUUGACUUGCCACUGCCAUAACUUGUUUGUAAAAGAGCUGUUCUUUUUGACUGAUUGUUUUAAACAACGAUUUCUCCAUUAAACUUCUACUGAGCAAAUGGUUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-351.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -371.43

Frequency: 0.0000

Diversity: 215.64

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((((............(((((((((.(((((..((((((....))))))..(((((((.........((.((((((.(.(((..(((((.((((((...((((((((((.......))))))(((((((.((((..((((.......))))..))))(((((.....))))).((((......))))...(((((.((....)))))))((.((((((((((((((...(((...((((((.((.....)).)))))).)))..))....))))))))))))))....)))))))..)))).)))))))))))..))).).)))))).)).((((((((.(((.(((.((...)).))).((.(((((.((((((((((((((.(.((.((((((((((((..(((((((.....((((...((((...((((((....))))))((((((..((((......(.((((..(((((((.((..((.((((.((..((......))..)).(((((((((.....((((...))))...)))).)))))...((((((((......((.((.......)).)).......)))))))).((.((((.........(((.((((((((.........((((....(((((..(((...)))..)))))...)))))))))))).))).)))))).))))))..)))))))))..)))))...)))))))))).)))).)))))))))))......)))))....((((...)))).(((((....))))).))))))).))).))).))).)))))))).)))))))..)))))))))))..((..(.(((((((((...))))))))).)...))..((((........)))))))))))))).)).)))..))))))...((((......))))))))))).......(((((((......)))))))...(((((....(((....)))..)))))....

Thermodynamic Ensemble Prediction

{((((((.........,,,(((((((({.{((((..((((({....})))))..,{{{(((.......,.,{.((((((.(.(((..(((((.((((((...((((((((((.......))))))(((((((.((((..((((.......))))..))))(((((.....))))).((((......))))...(((((.((....)))))))((.((((((((((((,{...(((...((((((.((.....)).)))))).)))........))))))))))))))...,)))))))..)))).)))))))))))..))).).)))))).||,(((((((,{(((,(((.((..,)).}||.((.(((((.((((((((((((((.(.({.((((((({,,{{,.(((((((.....((((...((({...((((((....}))))|(((((({.{(((...,{.{.((((..(((((((.,,{(((..((((((((((,({...,,,.,,.(((((((((..,..((({...})))...)))).)))))..,((({{{{{..,,,.||||{...}},.}}})),......}}}}}}}}.((.,...,,,...,,.)),.})))))))..))))...,{{{,,,,(((((..(((...)))..)))))..,))),..(((.((((((.......)))))))))),)))))))..))))),..)))))))))),}))).))))))))))),||,..|},,,...|{{{{.,,|}}}.{{||,,,,.))}),,))))))).}},}))).))).)))))))).))))))).,)))))))))))..((..{.(((((((((...))))))))).}...))..((((........)))))))))))}})}}),))),,}}}}}}...{{{{....,,||},}})))))...{{,.{{(((({......}}}}}}},,,{{{{{....,,,....))).,))))),,..