Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001287008.2
Sequence Length
1007 nt
GC Content
0.5879
ACUCCCCUGGCAGACCCCGCCAAGCGCCUCGGAGCGCGCAGGAUGCGCUGGGCGGCCGCCACCCUCCGUGGCAAGGCGAGGCCCCGGGGGCGGGCCGGGGUCACCACGCCUGCCCCAGGGAACCGCACAGUGGUGCCACCACACGAGACCUUUGGCUUCAAGGUGGCCGUGAUCGCCUCCAUUGUGAGCUGUGCCAUCAUCCUGCUCAUGUCCAUGGCCUUCCUCACCUGCUGCCUCCUCAAGUGCGUGAAGAAGAGCAAGCGGCGGCGCUCCAACAGGUCAGCCCAGCUGUGGUCCCAGCUGAAAGAUGAGGACUUGGAGACGGUGCAGGCCGCAUACCUUGGCCUCAAGCACUUCAACAAACCCGUGAGCGGGCCCAGCCAGGCGCACGACAACCACAGCUUCACCACAGACCAUGGUGAGAGCACCAGCAAGCUGGCCAGUGUGACCCGCAGCGUGGACAAGGACCCUGGGAUCCCCAGAGCUCUAAGCCUCAGUGGCUCCUCCAGCUCACCCCAAGCCCAGGUGAUGGUGCACAUGGCAAACCCCAGACAGCCCCUGCCUGCCUCUGGGCUGGCCACAGGAAUGCCACAACAGCCCGCAGCAUAUGCCCUAGGGUGACCACGCAGUGAGGCUGGUGCCCAUGCUCCACACUGGGAGGCCAGGCUGACCCCACCAGCCAGUCAGCUACAACUCCACAUCAACUCCACAUGCGCCCAGCUCGAGACUGAUGAGUGGAAUCAGCUUCCAGGUGUAGGGACCCCUUGAGGGGCCGAGCUGACAUCCAAGGCUGAGGACCCCAGUGGGGAGUGUUCUGUUCCGGCAUAUCCUGGCCGUAACGAUUUUUAUAGUUAUGGACUACUUGAAACCACUACUGAGGGUAAUUUACUAGCUGUGGCCUCCCACUAACUAGCAUUCCUUUAAAGAGACUGGGAAAUGUUUUAAGCAAAUCUAGUUUUGUAUAAUAAAAUAAGAAAAUAGCAAUAAACUUCUUUUCAGCAACUACA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-376.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -394.06
Frequency: 0.0000
Diversity: 214.32
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((...(((((..((..((((...(((.(((((.(((((((..((((((((.(((((((((.....)))))..)))((((((((.(((((((((..((....))..))))))))).))).(((((...)))))((((((....(((.((...)))))...)))))).......)))))..((((.(..((((((((((((((.....((((((((((((((.((((.((((.........)))).)))).)))).))..((((..(((((......(((((((..(((((((((((((.((...)).)).))..(((..((.(((((((((((.......))))))...)))))))..)))...((((.((.(((...)))..)).))))...)))))))))((((((.......))))))..((....))..))))))))))))...))))..)))))))))))).((((((.......(((((...((((.....)))).....)))))........))))))))))))))))..).)))).)))))).).)).)))))..))))))))))))))....))..)))))((.((((((((.((....(((....)))......)).))).))))).))...(((((......(((((((((((((((.......)))))...((((((....(((((((((.(((.....((.....))..)))..))))..))))).(((((((...(((((((((.((((....))))))...)).)))))..)))))))..(((((((((((((((((((((((.((((........)))).))))..............)))).))).....)).)))))).)))).......))))))))))))))))......))))).........))).(((((((..((((...((...(((.(((((((...))))))).))).....))...))))...)))))))........
Thermodynamic Ensemble Prediction
.......(((,.((((,,((...((((({.(((((((((((((((...(((((((({(((((.....))))).{{((((,{{(((.(((((((((.,((....))..))))))))).))).(((((...)))))((((((....(((.((...)))))...)))))).}}..}))))),,...,,}.))))).))).))))))))...{(((,.,.((((((.((((.{(((.........)))).)))).)))).))..,.)))})))))))...}))),.))...)}.|,|||}}}}(((((((({.{.((..(((..((.(((((((((((.......))))))...)))))))..)))..))((((((((((((((((.(((((((..........(((((((((.......)))))),})).((((....))))...))))).))(((.((((((.,....((((((((.......(((((...||||},.((((({(((..|({|{{.,{{,,(..(((((,..((,{{...(((......)))....))},.,))))).,}.))))})))}...)))}..)))))........(((.....))))))))))),.)))))).))).)))))).))))..)))},))..(((((((((((((((.......|||||.{{(((((,...,((({(({{{.,((,.,.,((,,,..|}..|||.,||||..,}}}},|||||||...|||||||||,{{{{.,,.))))}}.}}))})),},..,)))))}.,(((((((((((({{{{{,,,{,,.{|||,,.,,,,{||||{|||........,.}}}}})),)))...,...}).)))))).)))).......))))),))))))))))......{((((((((...........)))}}})))}....{{...(((.(((((((...))))))).))).....}}......,.))))))))))..,,,,.
Back