Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001287342.2
Sequence Length
583 nt
GC Content
0.6158
AGGGGACUCCGGGAGGAGGAACAUGGCGGUGGCGGACCUCGCUCUCAUUCCUGAUGUGGACAUCGACUCCGACGGCGUCUUCAAGUAUGUGCUGAUCCGAGUCCACUCGGCUCCCCGCUCCGGGGCUCCGGCUGCAGAGAGCAAGGAGAUCGUGCGCGGCUACAAGUGGGCUGAGUACCAUGGUGAGGCGGACAUCUACGACAAAGUGUCGGGCGACAUGCAGAAGCAAGGCUGCGACUGUGAGUGUCUGGGCGGCGGGCGCAUCUCCCACCAGAGUCAGGACAAGAAGAUUCACGUGUACGGCUAUUCCAUGGCCUAUGGUCCUGCCCAGCACGCCAUUUCAACUGAGAAAAUCAAAGCCAAGUACCCCGACUACGAGGUCACCUGGGCUAACGACGGCUACUGAGCACUCCCAGCCCGGGGCCUGCUGCCUCCAGCAGCCACUUCAGAGCCCCCGCCUUUGCCUGCACUCCUCUUGCAGGGCUGGCCCUGCCUGCUCCUGCGGCAGCCUCUGGUGACGUGCUGUCCACCAGGCCUUGGAGACAGGCUAGCCUGGCCACAGAAUUAAACGUGUUGCCACACC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-226.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -235.11
Frequency: 0.0000
Diversity: 188.53
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.((((((((((((...((.(((((.(((((.(((.((((((..(((......)))....(((((.(((((((.(.........)))))).)).)))))((.((((..(((((...)))))..)))).))..)))))).)))((((.((.(((..(.((..((((........)))).)))..))).))))))..((((...))))((((........((((...(((((((((.......))).(((((((((((.............(((((..........))))).(((((..(((....(((((...)))))....)))..)))))...((((......))))......(((..(((.......)))..)))..((((((((...((..(((....)))..))..)))))))))))))))))))...)))))).))))...))))))))).)))))))..))))))))(((((((.(((...))).)).))))))).)))))))(((((((((((((...((((((((((....))))...))))))..)))).......))))))))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(({(.({{(((((((((...((.(((((.(((((.(((.((((((..,,{.{{,{.||||,||(((((.(((((((.{.........)))))).)).)))))|{.{(((..(((((...)))))..)))}.}}..)))))).)))((((.((.(((..({{(..((((........)))).))).,))).)))))}.,(((,...})))|(({.,,.{{{,(,,{|,.{{{|||{{|,|,,.,{|}|,(((((((((((......,.,,{..(((((..........))))).{|||{..(((,,,.{{|||,,,,}))),..,)))..))))),,.|{{{...,||},...,,...,,,..|,,,|.||,,,,),.)))}.((((((((...((..(((....)))..))..))))))))))))))))))}.,,)))))).}}}}.,.)))}))))).)))))))..))))))))|{{{(((,(((...|||,||,||}}}|||}}|,|{((((((({..,|)},.}|||||||{{|,,,.))))}..)))||||.|||,.......,,}))}})),....
Back