Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001287529.2

Sequence Length

2110 nt

GC Content

0.6768

GCAGAGUCGAGCGUGGGGCGGACGCGGCGGACGUGGGUGAGGGCGCGGCCGUAAGAGAGCGGGACGCGGGGUGCCCGGCGCGUGGUGGGGGUCCCCGGCGCCUGCCCCCACGGCACCCAAGAAGGCCUGGCCAGGGUACCCUCCGCGGAGCCCGGGGGUGGGGGGCGCGGGCCCGGCGCCGCGAUGGGCCCGGGACCCCCAGCGGCCGGAGCGGCGCCGUCCCCGCGGCCGCUGUCCCUGGUGGCGCGGCUGAGCUACGCCGUGGGCCACUUCCUCAACGACCUGUGCGCGUCCAUGUGGUUCACCUACCUGCUGCUCUACCUGCACUCGGUGCGCGCCUACAGCUCCCGCGGCGCGGGGCUGCUGCUGCUGCUGGGCCAGGUGGCCGACGGGCUGUGCACACCGCUCGUGGGCUACGAGGCCGACCGCGCCGCCAGCUGCUGCGCCCGCUACGGCACCGUCUGCGUCCUGCUGUCCUUCCCCUUCAUCUUCAGCCCCUGCCUGGGCUGUGGGGCGGCCACGCCCGAGUGGGCUGCCCUCCUCUACUACGGCCCGUUCAUCGUGAUCUUCCAGUUUGGCUGGGCCUCCACACAGAUCUCCCACCUCAGCCUCAUCCCGGAGCUCGUCACCAACGACCAUGAGAAGGUGGAGCUCACGGCACUCAGGUAUGCGUUCACCGUGGUGGCCAACAUCACCGUCUACGGCGCCGCCUGGCUCCUGCUGCACCUGCAGGGCUCGUCGCGGGUGGAGCCCACCCAAGACAUCAGCAUCAGCGACCAGCUGGGGGGCCAGGACGUGCCCGUGUUCCGGAACCUGUCCCUGCUGGUGGUGGGUGUCGGCGCCGUGUUCUCACUGCUAUUCCACCUGGGCACCCGGGAGAGGCGCCGGCCGCAUGCGGAGGAGCCAGGCGAGCACACCCCCCUGUUGGCCCCUGCCACGGCCCAGCCCCUGCUGCUCUGGAAGCACUGGCUCCGGGAGCCGGCUUUCUACCAGGUGGGCAUACUGUACAUGACCACCAGGCUCAUCGUGAACCUGUCCCAGACCUACAUGGCCAUGUACCUCACCUACUCGCUCCACCUGCCCAAGAAGUUCAUCGCGACCAUUCCCCUGGUGAUGUACCUCAGCGGCUUCUUGUCCUCCUUCCUCAUGAAGCCCAUCAACAAGUGCAUUGGGAGGAACAUGACCUACUUCUCAGGCCUCCUGGUGAUCCUGGCCUUUGCCGCCUGGGUGGCGCUGGCGGAGGGACUGGGUGUGGCCGUGUACGCAGCGGCUGUGCUGCUGGGUGCUGGCUGUGCCACCAUCCUCGUCACCUCGCUGGCCAUGACGGCCGACCUCAUCGGUCCCCACACGAACAGCGGAGCGUUCGUGUACGGCUCCAUGAGCUUCUUGGAUAAGGUGGCCAAUGGGCUGGCAGUCAUGGCCAUCCAGAGCCUGCACCCUUGCCCCUCAGAGCUCUGCUGCAGGGCCUGCGUGAGCUUUUACCACUGGGCGAUGGUGGCUGUGACGGGCGGCGUGGGCGUGGCCGCUGCCCUGUGUCUCUGUAGCCUCCUGCUGUGGCCGACCCGCCUGCGACGCUGGGACCGUGAUGCCCGGCCCUGACUCCUGACAGCCUCCUGCACCUGUGCAAGGGAACUGUGGGGACGCACGAGGAUGCCCCCCAGGGCCUUGGGGAAAAGCCCCCACUGCCCCUCACUCUUCUCUGGACCCCCACCCUCCAUCCUCACCCAGCUCCCGGGGGUGGGGUCGGGUGAGGGCAGCAGGGAUGCCCGCCAGGGACUUGCAAGGACCCCCUGGGUUUUGAGGGUGUCCCAUUCUCAACUCUAAUCCAUCCCAGCCCUCUGGAGGAUUUGGGGUGCCCCUCUCGGCAGGGAACAGGAAGUAGGAAUCCCAGAAGGGUCUGGGGGAACCCUAACCCUGAGCUCAGUCCAGUUCACCCCUCACCUCCAGCCUGGGGGUCUCCAGACACUGCCAGGGCCCCCUCAGGACGGCUGGAGCCUGGAGGAGACAGCCACGGGGUGGUGGGCUGGGCCUGGACCCCACCGUGGUGGGCAGCAGGGCUGCCCGGCAGGCUUGGUGGACUCUGCUGGCAGCAAAUAAAGAGAUGACGGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-1038.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -1072.65

Frequency: 0.0000

Diversity: 497.33

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((((((((((.(((((((((((((.((.(((((.(((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((.((.(.(((((((((((.((((((((((.....)))........))))...))).))).)))).)))).).)))))(((((((.((.((((((..(((((((((..(.((((((((...))).).)))).).)))))))))..)))))).)).))))))).(((((.(((((((((((((...(((((((((..............)))...)))))))))))))).......))))).))))).((((...))))((((...(((((...((((((((((((.((....)).))).((((..((((((.((((((.((....)).)))))).))))))..))))..))))))))).)))))..)))).......))))))..))))))))))))..................((((((......)))))).(((((((((.(((....)))))))))))).))))..))))))))))))...(((....((((((...))))))....))).....)).))))).)).))).....(((((((((..((((..(........)..)))))))))).)))...........)))))).(((((((((((((((...(((....))).((((((((((((((.(((((..(((..(((..(((..((((((...))))))..)))....(((((.((.((((((.((((((((.(((((......))))).))..)))..))).)))))).)).)))))((((((((((....)))..........(((((....)))))...)))))))))))))))))))))))))))))).)).........))))))))...)))))))...(((((.((((((((.((((((.(.(((((...)))))))))))).(((((((((((((.......)))....(((((((((..((((((.((..(((........))).)).))...)))).....(((.((((((((((..((.((.((((((.............)))))).)).))...((((((.((...........)).))))))......((.(..((((((((((....(((........)))..))))))))))..).))(((..((((((....))))))..))).(((((((.((((((((((((((((.(((((((...))))))).))))..)).).)))).)))))..))).))))..((((((((((.(((((((.....))))...((((((((.((...))))))))))..(((.((((..(((.(((.....))).)))..)))))))))).))))))))))..((.((((...(((.((((((...(((((((.((.((((...))))))))))))).......)))))).))))))).))..)))))).))))))).(.(((((((((((((...((((..(((((.(((.((((((.((((....))..(((((((..(.(((....(((((((..((((.((((..(((((((....))).))))..)))).)))).(((......)))....))))))).(((((......)))))((((((.((((((.......((((((.((((((..................))))))))))))))))))))))))..(((((((((.((((((..((.....))..)))))).......))))))))).............)))).)))))))...(((((((....((((((.....((.(((.(((..((((...((((..(((((((....)))))))....))))..))))..))).))).))..))))))...)))))))...((((((((.(((...)))...))))))))...)).)))))).)))..)))))..)))).))))))))))))).))))))))))..)))))).))))))))))))))))))))).))..))))....))))))))..........................

Thermodynamic Ensemble Prediction

{{{((((((((,((((((,(((((,(((.(,.(((((.(((((((.((((((,.((.(((((((((((((((((({((,((,(,({((((({(((.((((((((((.....))),.......,)))...))).))).}))),)))),}.)))}|(((({((.((.((((((..(((((((((..(.((((((((...))).).)))).).)))))))))..)))))).)).))}})))}(((((.(((((((((((((,..(((((((((.,,......},...))).,.)))))))))))))).......))))).))))).{{{,..{|||}((((...(((((...((((((((((((.((....)).))).((((..((((((.((((((.((....)).)))))).))))))..))))..))))))))).)))))..)))).})},..))))))..)))))))))))).))...............((((((......)))))).}||||||||.|(({{..,,))))})))))}.)))}},,),))))))))...{{(,,,,((((((...))))))....,,}..,}}}},)))))})).{{{{,,,,(((((((((..((((..(........)..)))))))))).))).,...,||,..||||...({(((((((((((({...{{(....))).((((((((((((((.(((((..(((.,(((..(((..((((((...))))))..)))....(((((.((.((((((.|((((({({((,,,...,.,.,,,},))..)))}})))})))))).)).))))}((((((({{{.,,,|}|,,....,,,.{{{||,...})))),},)))))))))))))))))))))))))))))).)).........})))))))...)))}}||,,{{({{{{{(((((((,((((((.,,{|||{,..)))))))))}}}.{{{(((((((......{{,,{{|.,,,{(((({(({..{|||,|,||..{{{........))).))})),,,))))},.{.(((.((((((((((.....(,{(((.((.((((((.(((((((((.,...((({{{((((((.((...........)).)))))).........(..((((((((((....(((........)))..))))))))))..}.,{((,..,|||(({,{{||||||{{|||,(((((((.((((((((((({((((.(((((((...))))))).))))..)).}.))))},))))..))).))))}}||||((((((.((((,((.{{{.||||.{,((((((((.((...))))))))))..((({({{,}}|||.{,{.....,)).)))}.))))),)))).))))))))))}}|||,||{{({{.,..,||....|||.||||||.,}})))},}})),)))).,.))))))..))).)))))).)).))))))))))).))))))).|,{((((((((((((...((((..(((((.(((.((((((.,,{{....},..(((((((..{.({,....(((((((..((((.((((..(((((((....)))},)))..)))).)))).{{,...{{.,}},,,.))))))).(((((......)))))(((((((((((((.......(((((((((((((............,.....))))))))))))))))))))))))..(((((((((,((((((.,({....,},..)))))),}.....))))))))).............,}}}.)))))))...(((((((....((((((.....((.(((.(((..((((...((((..(((((((....)))))))....))))..))))..))).))).))..))))))...))))))){{,((((((((.(((...)))...)))))))).,})).)))))).)))..)))))..)))).)))))))))))))}))))))))))..)))))).)))))))))))))))||||}}||||||||,},,,))))))))}|||,||.........,,)),.}}).