Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001288959.2

Sequence Length

503 nt

GC Content

0.5467

AACACAUCCAAGCUUAAGACGGUGAGGUCAGCUUCACAUUCUCAGGAACUCUCCUUCUUUGGCCAGGAUUGCUACAGUUGUGAUUGGAGGAGUUGUGGCCAUGGCGGCUGUGCCCAUGGUGCUCAGUGCCAUGGGCUUCACUGCGGCGGGAAUCGCCUCGUCCUCCAUAGCAGCCAAGAUGAUGUCCGCGGCGGCCAUUGCCAAUGGGGGUGGAGUUGCCUCGGGCAGCCUUGUGGCUACUCUGCAGUCACUGGGAGCAACUGGACUCUCCGGAUUGACCAAGUUCAUCCUGGGCUCCAUUGGGUCUGCCAUUGCGGCUGUCAUUGCGAGGUUCUACUAGCUCCCUGCCCCUCGCCCUGCAGAGAAGAGAACCAUGCCAGGGGAGAAGGCACCCAGCCAUCCUGACCCAGCGAGGAGCCAACUAUCCCAAAUAUACCUGGGGUGAAAUAUACCAAAUUCUGCAUCUCCAGAGGAAAAUAAGAAAUAAAGAUGAAUUGUUGCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-182.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -190.91

Frequency: 0.0000

Diversity: 139.37

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.....((((..(((.((((..((((((....))))))......((((....)))))))).)))..))))(((.(((((((((((((.(((....((((((((((((((((((((((((((((...)))))))))))........((((((......)))))).......)))))).......((((((.((((((((((.((...)).)))))..))))).)))))))))..))))))))))).))))))).(((((........))))).((((.(((...))).))))..((((((.(((((((.(((.....))).......(((.((((((.((...((.((((..........)))).)))))))))).)))...((((...(((.....))).)))))))))))...))))))...(((((((........)))))))............((((.....(((...))).....)))).........)))))).))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

..,.,((({..{((.,(((..((((((....))))))..,},.|||,...||||||}}|.||}{{||||{((,,{{{{,(((((((.(((,...((((((((((((((((((((((((((((...)))))))))))......{.((((({...,,}),))}}.......)))))).......((((((.((((((((((.((...)).)))))..})))).)))))))))..))))))))))).))))))).((((({...{(({,|||||{|{,|({|...|||||}}}.,((((((.{((({{{.({{..,|,||},|....,|||}|}|||,..,.}}|},}((((.(((.(((((((..{.......,,.))},)))))))..)))}...))),,}}}})}))))).,,))))}}...(((((((........)))))))............{(((,....{{|,,,))}.....}},,.....}}}}}}}))).}},.