Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001289115.2

Sequence Length

1501 nt

GC Content

0.5956

AGUCUUCACCCGAAUCAGCCUCAGGAUAUCUCCACAGUCUCCCUCCUUGGCCUCUCGGAUCCGCACGGAAGCCAUCCGGAUCCCCGCUGUCUGGGACCAAAGUCCCAGGGCCUCGCAAACGGCAACUAGACCCCUUAAAGGGCCUACGGACUUGGAUCCUGAAGAGCCUGAGAGAGCGGGGUGGCGGGAGUCGGGGGGGACGGCGGGGUAGCCGCGGCCUGGUAAGUGGAGCUGGGAUUCCGGCGCCGUACGGGAGGAGAGAGUAGGCCAGCGAGGCGAUCCUCUGUCCGGGCAUAGCCCCACCCCCUCGAAUUCUGUCGCAGCAGGGGGCACAACUGUCAGCCAAUCAGCUUGGAGAACAGGCACGGCCGCGUCCCCCCCAAGCCCCACCCCCGACAGCUGGAUCUUGUGACUGGGCUCCUGGGUAGAGUUCAAGGUUGGAGUGAAGCGGCUUCCUUGCGGUUGUGUGGGUGUCCCAACCUGGGUCGAGAUACCCCGCGGUUCAAAGGCUCCCCCGCAGUGCUUUUUAAAUUGACAUAUGCAGUGAUAACCUGCUUUAGCCUCAGGCUCACUCACCCGCCCAGACCCUGGAGUGCCCACGACCCUCCGGCUGUCCACCUCAGCAAUGGCCCAGGACAAGAGCCUAUCGCUGUCAUGACCUUUGACCUCACCAAGAUCACAAAAACCUCCUCCUCCUUUGAGGUUCGAACCUGGGACCCAGAGGGAGUGAUUUUUUAUGGGGAUACCAACCCUAAGGAUGACUGGUUUAUGCUGGGACUUCGAGACGGCAGGCCUGAGAUCCAACUGCACAAUCACUGGGCCCAGCUUACGGUGGGUGCUGGACCACGGCUGGAUGAUGGGAGAUGGCACCAGGUGGAAGUCAAGAUGGAGGGGGACUCUGUGCUGCUGGAGGUGGAUGGGGAGGAGGUGCUGCGCCUGAGACAGGUCUCUGGGCCCCUGACCAGCAAACGCCAUCCCAUCAUGAGGAUUGCGCUUGGGGGGCUGCUCUUCCCCGCUUCCAACCUUCGGUUGCCGCUGGUUCCUGCCCUGGAUGGCUGCCUGCGCCGGGAUUCCUGGCUGGACAAACAGGCCGAGAUCUCAGCAUCUGCCCCCACUAGCCUCAGAAGCUGUGAUGUAGAAUCAAAUCCCGGGAUAUUUCUCCCUCCAGGGACUCAGGCAGAAUUCAAUCUCCGAGACAUUCCCCAGCCUCAUGCAGAGCCCUGGGCCUUCUCUUUGGACCUGGGACUCAAGCAGGCAGCAGGCUCAGGCCACCUCCUUGCUCUUGGGACACCAGAGAACCCAUCUUGGCUCAGUCUCCACCUCCAAGAUCAAGAGAAGACUCUUCCACCUCUUUUUGCCUGAAUGGCCUUUGGGCACAAGGUCAGAGGCUGGAUGUGGACCAGGCCCUGAACAGAAGCCAUGAGAUCUGGACUCACAGCUGCCCCCAGAGCCCAGGCAAUGGCACUGACGCUUCCCAUUAAAGCUCCACCUAAGAACCCCC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-581.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -612.30

Frequency: 0.0000

Diversity: 453.59

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((.((.((((.(((((((((((((....((((.(((((((((....((..(((.(((((((...((...))...)))))))......((((((((....))))))))(((........)))....)))..))....)))).....))))))))))))))).(((((((((((((((((((((.(((((((.....((((.((((((((....(((((((((....((.(((((....))))).))........(((.((((...(((.....)))....)))).)))((((...))))..(((((((((......)))....))))))(((((((((.((.......(((((.....)))))..((((((.(((((.((.(((.(.((((.....((((.(.((....)).).))))...)))).).)))...))..)).).)).))))))..)).)))))))))((((...))))))).))))))...)))))))).))))...)))))))))))(.(((.................))).).....))))))))...))))))))).......(((((((...)))).)))..........((((((..((((((..(((...(((((((((..((.((((...((((((.((((((..(((((((((((((((((.............(((((((.(((((.......)))))))))))).))))))))...(((((.......))))).)).)))..))))......)))...))).)))))))))))).................)).)))))))..)))...)))))).))))))....)))).)))..)))).)).)))...(((((((.((...(((((.((((...((.(((((...(((((((((...(((((.((.((((.(((.((((..((((((((((.(((.(((((((...(((.((((((...)).)))).)))...(.((((........)))).)...(((((...)))))..)))))))...((...(((((((((((((((((((((((..((((((......)).))))(.(((.((((.((((.............)))).)))).))).).......))))))((((......))))....(((((((.((.(((......))))))))....))))........(((.(((.((((((((........)).)))))).)))..)))))).))))))...)))))..)))..))....))).).)))))).)))..))))))).))))..)).))))).......((((....)))))))))))))..(((((((...(((((..((((......((((.((((((.......))).))))))).....(((..((((.......))))..)))))))..)).)))))))))).))))).))..)))))))))...)))))))))..........

Thermodynamic Ensemble Prediction

.(((.((.((((.{((((((...(((....})).,{({({((({{{{,,((((((((((((((...((...)).,.)))))))..(((.(.{(((((({{{((((..((((((.......((,.....,.)).......))))))..)))))))).))))}.).)))..))))).)){||{{{|.|||,,.,((((((((((((......)))(((((((,((,..{((.(((((....))))).))}}}}.|..(((.((((...(((.....)))....)))).)))((((...))))..(((((((((......)))....)))))).....{{{{...{{{,...,,|||}...,)))})..)))))))))))))))..,})}}|)))).((((((((((..(((((.,,({(({{{,((((.{,{{,...((({{(((((,,((((({.,,..||{{{((((.((({(((,{{{{{,|||,...,,,))))}}}))}}..,,}}|.,,,}}}|{.{{{.................}}|,}}...,})})),,,}))),..}))))))))},},))}},}}}}).))})}.),))))}...)))))))))),,,{..(((...((((((({{,.{{,(({{...|||(((.{({,{{.,{,,,,,,,{|||,||{,..,,,..,,,{{,{((((((.(((((.......))))))))))))})|))}|||,,.,(((,.......)))})}))}}})}})}}}...||||}|...}}}.}}))))))))}},........,,,,....}).}}))))).,))}...))})|}.}}},.,,}.,))))))})..)))).)).)))...(((((({,((...(((((.((((,..((.(((((...(((((((((,(((((((((({(,,,.((({(((,..,(((({,((((,,..(((((((...(((.(((((,...,).)))).)))..,((((((......,)))))||..,({(({...))}}),.)))))))...}}}}.))}}.(((((((((,((((((({,,{(((((......)}}}))},,{((.((((.((((,........}...}))).)))).))}.}.......,}}}}}||({......||||....||||(((.((.(((......))))))))....,,}}..{{,,...}}.(((.(({(((((........)).)))))).)))..))))))))).||)}}})))))}})))}}.|{{.,||,...))))))..)),,}}}}}}}.}}}},,)),)))))}.,...,((((....)))))))}}))))..(((((((...(((((,,((((....,.((((.((((((.......)))}})))))}.}...(((..((((.......))))..))))))).,)),)))))))))).))))).)),.)))))))))...)))))))))..........